计算模型结合活体成像:初级视觉皮层功能的自组织模式

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31571076
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    64.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0904.感觉与运动系统神经生物学
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

“Simulating the brain”is an important direction in the brain research, and it will provide an irreplaceable tool to “understanding the brain”. Meanwhile, in the past three years, the artificial intelligence develops dramatically, such as “deep learning” neural network, and may lead to a new round of industrial revolution. However, it is still lack of brain mechanism. To fill the gap between simulating and understanding the brain, it is desirable to find the appropriate interface between simulations and experiments. The goal is to establish the computational model with clear biological meanings, and to double confirm it by in vivo brain functional imaging. We plan to adopt the self organization model based on learning iterations and neighborhood function, which has been successfully applied in the past, to simulate the formation of functional maps; and at the same time, to obtain the time lapsed functional maps by in vivo optical imaging tools. Through side by side comparison between the model and the experiment, we will 1. explain the diversity of the functional maps; 2. explore the inherent interactions between various experimental maps, by introducing the experimental data into the computational model; 3. predict the temporal spatial dynamics of functional maps based on the simulation, and confirm it by specific in vivo experiments. These efforts will enhance the two-way crosstalk of the model and the experiment, and in turn propel the understanding of brain functional organization to a computable and predictable level, and help to improve the “brain like” artificial intelligence.
“模拟脑”是脑研究的重要方向,它将为“认识脑”提供不可替代的研究手段;同时,近三年来,“深度学习”等人工智能研究获得了根本性突破,有望启动新的产业革命,但其脑科学依据不足。消除“模拟脑”与“认识脑”之间的鸿沟,迫切需要找到模拟与实验之间的接口,建立具有明确生理学对应关系的计算模型,并采用活体脑成像验证。采用学习率迭代与相邻相似生理准则的自组织模型,申请人前期的模拟工作与动物实验高度契合,奠定了本申请深入理论研究的基础。我们将进行多种条件下的模拟与预测;同时以活体光学成像佐以双光子成像对初级视觉皮层进行实时、慢性功能成像。通过模拟与实验的紧密结合,1. 解释功能图的多样性表现形式;2. 探讨多变的图形模式下隐含的内在作用规律;3.在模拟中预测时空动态可塑性,进行针对性动物实验,实现两者的交互验证,从而将脑功能组织模式的定性认识提升到可计算、可预测水平,促进计算神经科学和类脑人工智能发展。

结项摘要

本课题采用自组织神经计算网络,第一,模拟生成了多种动物视觉皮层的方位、眼优势、空间频率功能图,与实验数据高度相似。第二,利用该模型进行了预测,在眼优势剥夺情况下,定量预测方位功能图与眼优势功能图在时间与空间上的非线性动力学变化过程;同时,在活体动物的视觉皮层上植入慢性成像窗口,在进行单眼缝合实验的过程中,进行长期、多次内源性光学成像,实验结果与模型预测高度吻合(Neuroscience, 2016a)。并在发育的不同时期,在视觉系统的不同层次上,发现其可塑性具有强度和有无水平上的差异,提示在后续模型中学习率的异质性选择(Frontiers in Neurosci., 2019)。第三,瞄准“深度学习”中多层次的基本框架,我们研究了初级视觉皮层17区与下一级视觉皮层21a之间在方位适应情况下,适应效应的传递效应,通过内源性光学成像、单细胞记录、场电位记录等多种技术手段,发现,其传递效应具有特征依赖性的级联放大效应,为多层级信息传递框架提供了生理学基础(Scientific report, 2017),发现17区与21a区相似的回馈神经网络,及层次性的差异(Neuroscience, 2018a),而17区的反馈则对外膝体的方位选择性并没有显著的影响(Neuroscience, 2018b)。同时,我们进一步研究了视觉剥夺情况下,底层的视网膜的可塑性,发现12-24小时的视觉剥夺,会引起视网膜功能的快速下降,该下调会被传递到初级视觉皮层,首次证实在成年动物的视网膜上存在着视觉经验依赖的功能可塑性(Plos One, 2016)。第四,我们已经成功完成了动物成像数据与模拟网络之间的对接,实际的实验数据得以可靠地代入模型,进行功能组织模式的推导、修复和预测,相关结果正在整理投稿中。第五,我们将功能图的研究拓展到猫牙相关皮层,系统研究了其功能反应模式(Neuroscience, 2016b),发现根管治疗并不改变该皮层的功能构筑模式(Neuroscience, 2017,封面文章),但过度的根管治疗则带来皮层反应的敏感化(Neurocience Letters, 2018)。.总体来看,自组织神经计算模型可以模拟、预测、代入并推导真实实验数据;我们也获得了视觉系统从视网膜、外膝体、初级视觉皮层到中级视觉皮层信息传递方式的相关实验数据,并为下一步应用于深层级计算模型奠定了基础。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The Common and Distinct Orientation Adaptation Effect at Pinwheel Centers in Areas 21a and 17 of Cats.
猫 21a 和 17 区风车中心的共同和独特的方向适应效应。
  • DOI:
    10.1016/j.neuroscience.2018.03.005
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Neuroscience
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Meng Jianjun;Li Zhong;Li Hongjian;Zhu Jianbin;Yu Hongbo
  • 通讯作者:
    Yu Hongbo
The feature-specific propagation of orientation and direction adaptation from areas 17 to 21a in cats.
猫的定向和方向适应从区域 17 到 21a 的特定特征传播
  • DOI:
    10.1038/s41598-017-00419-x
  • 发表时间:
    2017-03-24
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Li Z;Meng J;Li H;Jin A;Tang Q;Zhu J;Yu H
  • 通讯作者:
    Yu H
Relationship between the Dynamics of Orientation Tuning and Spatiotemporal Receptive Field Structures of Cat LGN Neurons.
Cat LGN 神经元的方向调节动力学与时空感受野结构之间的关系。
  • DOI:
    10.1016/j.neuroscience.2018.02.024
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Neuroscience
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Li Hongjian;Fang Qi;Ge Yijun;Li Zhong;Meng Jianjun;Zhu Jianbing;Yu Hongbo
  • 通讯作者:
    Yu Hongbo
The Shift of ERG B-Wave Induced by Hours' Dark Exposure in Rodents.
啮齿动物数小时黑暗暴露引起的 ERG B 波变化
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0161010
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Li D;Fang Q;Yu H
  • 通讯作者:
    Yu H
POPULATION RESPONSE CHARACTERISTICS OF INTRINSIC SIGNALS IN THE CAT SOMATOSENSORY CORTEX FOLLOWING CANINE MECHANICAL STIMULATION
犬机械刺激后猫体感皮层内在信号的群体反应特征
  • DOI:
    10.1016/j.neuroscience.2016.04.052
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Neuroscience
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Tao Jianxiang;Wang Jian;Li Zhong;Meng Jianjun;Yu Hongbo
  • 通讯作者:
    Yu Hongbo

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其他文献

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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