纸基变构响应型三维传感界面的构建及其p53/MDM2相互作用抑制剂研究应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21705082
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0404.化学与生物传感
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

The small molecule inhibitors targeting protein–protein interactions (PPIs) have become a hotspot of new drugs. The conventional detection methods suffer from high cost, dependence on the fluorescence or antibody labeling and susceptible to matrix interference. Herein, we designed a three-dimensional (3D) nanoprobe which is conformational-change responsive inspired by the 3D rigid architecture of DNA tetrahedron. Integrated with an origami paper-based device, we developed a novel biosensing platform for the study of small molecule inhibitors targeting the PPI between p53 and murine double minute 2 protein (MDM2). By incorporation of the functional group within the rigid tetrahedron cage, the nanoprobe designed can yield electrochemical response once it has conformational change triggered by the target. An interface with uniform orientation and tolerance of matrix interference can be generated by self-assembling of the nanoprobe on the working area of 3D paper device. And we can control the reaction process with programmed folding. Also, we will make efforts to investigate the related scientific issues such as oriented assembly, dynamic characteristics of biomolecular probes on the paper device and the effect of relative dimensions of tetrahedron and nanoceria to the conformational-change response. The successful implementation of this project will pave a simple, portable, and cost-effective way for the study of PPI inhibitors.
靶向蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的小分子抑制剂研究已成为新药研发的重点领域之一,现有检测方法存在成本高、需要荧光或抗体标记以及易受基质干扰等缺点。本项目拟利用3D折纸芯片技术,结合DNA四面体的三维刚性结构,设计变构响应型传感界面,构建纸基PPI抑制剂研究平台,对靶向p53与鼠双微粒体(MDM2)相互作用的抑制剂进行生物活性评价,进而研究其细胞水平作用机制。本项目创新性的利用四面体三维刚性结构进行功能基团的立体保护,通过三维构象的变化实现对目标物质的响应,不但提高了探针用于复杂基质检测时的稳定性,还实现了传感界面的空间调控。结合3D折纸芯片的有序折叠和修饰,可对反应进程实时控制。同时,本项目还将对纳米探针在纸芯片上的有效组装,探针与纳米粒子的相对尺寸对变构响应的影响以及纸基上生物分子识别动力学特性等科学问题进行深入研究。本项目有望为PPI抑制剂研究提供更加便捷经济的分析平台和科学思路。

结项摘要

生物体内蛋白质相互作用在生命过程中起着至关重要的作用,其中p53与其负性调节蛋白MDM2之间的相互作用与众多肿瘤发生、发展密切相关。针对现有蛋白质相互作用检测方法成本高、需要荧光或抗体标记以及易受基质干扰等缺点,我们以DNA纳米结构的设计和组装为基础,构建了新型蛋白质相互作用检测平台,并实现了专属抑制剂的活性评价。在此基础上,深入研究框架核酸的精准构建与位点特异性修饰功能,探讨了框架结构介导下的三维空间取向性和纸基平台上的分子识别与捕获等问题,通过结合G-四链体和蛋白质适配体等功能片段,开发了基于DNA纳米结构的特异性检测体系,进行了细胞内相关物质检测。并通过与具备特殊形貌和活性的无机纳米材料相结合构建高灵敏传感平台,对多类型的疾病和肿瘤标志物以及病毒遗传物质进行了分析测定,进而用在了实际生物样品和临床生化样品检测中。此外,利用DNA结构对细胞特殊微环境响应能力,结合光热性能纳米材料,设计了近红外响应释放型智能递药系统,在肿瘤的协同治疗中取得了显著效果。所建立的新方法和新技术有效丰富了DNA纳米材料生物医学中的研究应用,可为药物活性评价,疾病的早期诊断和治疗以及病毒感染防控等领域研究提供有效的技术支持。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(4)
Facile and highly sensitive photoelectrochemical biosensing platform based on hierarchical architectured polydopamine/tungsten oxide nanocomposite film
基于分层结构聚多巴胺/氧化钨纳米复合膜的简便高灵敏光电化学生物传感平台
  • DOI:
    10.1016/j.bios.2018.10.026
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Biosensors and Bioelectronics
  • 影响因子:
    12.6
  • 作者:
    Yu Yanyan;Huang Zhongnan;Zhou Yao;Zhang Lihua;Liu Ailin;Chen Wei;Lin Jianhua;Peng Huaping
  • 通讯作者:
    Peng Huaping
Rattle-Type Gold Nanorods/Porous-SiO2 Nanocomposites as Near-Infrared Light-Activated Drug Delivery Systems for Cancer Combined Chemo-Photothermal Therapy
拨浪鼓型金纳米棒/多孔 SiO2 纳米复合材料作为近红外光激活药物输送系统用于癌症化疗光热联合治疗
  • DOI:
    10.1021/acs.molpharmaceut.8b01298
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Molecular Pharmaceutics
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Yu Yanyan;Zhou Min;Zhang Wei;Huang Lei;Miao D;an;Zhu Hongyan;Su Gaoxing
  • 通讯作者:
    Su Gaoxing
Fluorescence resonance energy transfer-based DNA framework assembled split G-quadruplex nanodevices for microRNA sensing
基于荧光共振能量转移的 DNA 框架组装分裂 G-四链体纳米器件用于 microRNA 传感
  • DOI:
    10.1039/d0cc06054b
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Chemical Communications
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Su Gaoxing;Zhu Min;Xu Mengting;Pan Jianbin;Zhou Yao;Zhou Hongyu;Zhang Wei S.;Tong Yanli;Yu Yanyan
  • 通讯作者:
    Yu Yanyan
Reverse Transcription Recombinase Polymerase Amplification Coupled with CRISPR-Cas12a for Facile and Highly Sensitive Colorimetric SARS-CoV-2 Detection
逆转录重组酶聚合酶扩增与 CRISPR-Cas12a 相结合,可实现简便且高灵敏度的 SARS-CoV-2 比色检测
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.1c00013
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Analytical Chemistry, DOI: 10.1021/acs.analchem.1c00013
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhang Wei S.;Pan Jianbin;Li Feng;Zhu Min;Xu Mengting;Zhu Hongyan;Yu Yanyan;Su Gaoxing
  • 通讯作者:
    Su Gaoxing
Engineering of exosome-triggered enzyme-powered DNA motors for highly sensitive fluorescence detection of tumor-derived exosomes
外泌体触发酶驱动的 DNA 马达工程,用于肿瘤来源外泌体的高灵敏度荧光检测
  • DOI:
    10.1016/j.bios.2020.112482
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Biosensors and Bioelectronics
  • 影响因子:
    12.6
  • 作者:
    Yanyan Yu;Wei S. Zhang;Yuehua Guo;Huaping Peng;Min Zhu;D;an Miao;Gaoxing Su
  • 通讯作者:
    Gaoxing Su

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其他文献

波动温度下原料乳中金黄色葡萄球菌的生长动力学模型
  • DOI:
    10.16429/j.1009-7848.2016.11.005
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    中国食品学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    于艳艳;丁甜;刘东红
  • 通讯作者:
    刘东红
一种高效的基于高阶DPA的掩码安全性评价方案
  • DOI:
    10.13868/j.cnki.jcr.000251
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    密码学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    唐明;王蓬勃;杨国峰;于艳艳
  • 通讯作者:
    于艳艳
The optimization of electrolyte composition for CH4 and H2 generation via CO2/H2O co-electrolysis in eutectic molten salts
共晶熔盐中 CO2/H2O 共电解产生 CH4 和 H2 的电解质组成优化
  • DOI:
    10.1016/j.ijhydene.2018.09.089
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    International Journal of Hydrogen Energy
  • 影响因子:
    7.2
  • 作者:
    纪德强;李志达;李伟;苑丹丹;王宇航;于艳艳;吴红军
  • 通讯作者:
    吴红军
Facile Synthesis of Capacitive Carbon Materials via Electrolyzing Carbonates Eutectic with Varying Metallic Anodes
通过使用不同金属阳极电解碳酸盐共晶轻松合成电容性碳材料
  • DOI:
    10.1149/2.0531813jes
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Journal of The Electrochemical Society
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    于艳艳;李志达;张文勇;苑丹丹;谷笛;李金莲;何周文;吴红军
  • 通讯作者:
    吴红军
Effect of CaCO3 addition on the electrochemical generation of syngas from CO2/H2O in molten salts
添加CaCO3对熔盐中CO2/H2O电化学生成合成气的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    International Journal of Hydrogen Energy
  • 影响因子:
    7.2
  • 作者:
    刘悦;纪德强;李志达;苑丹丹;姜梦培;杨关键;于艳艳;王宇航;吴红军
  • 通讯作者:
    吴红军

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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