肝癌中mTOR信号通路对DNA甲基化的调控机制及其临床意义

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81772635
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1813.肿瘤诊断
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Liver is one of the key organs for metabolism in our bodies. Liver cells are in a complex microenvironment. How the extracellular signal changes the epigenetics of the cells to adapt the external microenvironment is unknown. Its molecular mechanism also remains unclear. mTOR pathway can sense extracellular nutrition signals and regulate cell metabolism. Our team found in previous study that mTOR is localized in the nucleus and the change of its activity will affect genome DNA methylation, which is associated with sensitivity of rapamycin in cancer cells. Accordingly, we hypothesized that mTOR signaling pathway sense extracellular stimuli, affect DNA methylation and change the physiological state of cancer cells. We would like to carry out the following three aspects in liver cancer: 1) To explore the role of mTOR signaling pathway activated or suppressed by extracellular signals in the DNA methylation and its biological significance; 2) To clarify the molecular mechanism of DNA methylation regulated by mTOR signaling pathways and its role in cancer development; 3) To identify biomarkers to guide mTOR-targeted therapy, by detecting change of key molecular in cancer cell lines and animal models. Successful implementation of these objectives should lead to new insights into the role of epigenetics in liver cancer, and help to develop new strategies for liver cancer treatment.
肝是人体代谢的重要器官,肝细胞面临复杂多变的微环境。胞外信号如何改变细胞的表观遗传以适应外界微环境,其分子机制仍不明确。mTOR通路可以感受胞外营养信号,调控细胞代谢。本团队在前期研究中发现,mTOR可定位于细胞核内,其活性的改变会影响肝癌细胞基因组DNA甲基化水平,并且相关变化与肝癌细胞的雷帕霉素敏感性相关。据此我们提出假设,mTOR信号通路感受胞外刺激,影响DNA甲基化水平,进而改变肿瘤细胞的生理状态。我们拟以肝癌为对象,开展以下三方面研究:①探索肿瘤胞外微环境中的各类信号激活或抑制mTOR信号通路对DNA甲基化调控的作用及其生物学意义;②阐明mTOR通路调控DNA甲基化变化的关键分子及其在肿瘤发生发展中的分子机制;③通过检测肿瘤细胞中的关键分子,结合动物模型,筛选和鉴定mTOR抑制剂用药标志物。本项目的实施,将有助于阐明肝癌的表观遗传调控机制,并为改进肝癌的临床治疗策略提供理论依据。

结项摘要

肝脏是人体最重要的代谢器官之一。肝脏代谢异常对于肝脏疾病,尤其是肝细胞癌(HCC)的发展至关重要。雷帕霉素的机制靶点 (mTOR)是环境代谢信号的关键传感器,在HCC中mTOR级联失调是最常见的,此外,表观遗传修饰的紊乱,如DNA甲基化修饰的异常,在癌变过程中也起着重要作用。. 在本研究中,我们发现mTOR信号的激活与51对HCC组织及其癌旁组织中的DNA甲基化谱呈正相关。体外研究表明,由于mTOR信号抑制,营养缺乏的环境和mTOR抑制剂雷帕霉素的治疗使细胞DNA甲基化水平下调。我们筛选了甲基化相关酶,发现mTOR信号的激活增加了DNA甲基转移酶1 (DNMT1)的表达和活性。mTOR可以以依赖4E-BP1的方式促进DNMT1的翻译效率。此外,4E-BP1的磷酸化缺陷突变体可以增强其对DNMT1的抑制作用。富含嘧啶的翻译元件 (PRTE)的突变或缺失可以消除雷帕霉素对DNMT1的抑制作用。mTOR和表观遗传抑制剂的联合在体外和体内对抑制HCC均显示出协同作用。因此,mTOR可以通过影响DNMT1的翻译效率来调节DNA甲基化谱,从而促进HCC的发展。mTOR和DNMT1协同靶向是一种有潜力的HCC治疗策略。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(3)
专利数量(0)
Sorafenib and Carfilzomib Synergistically Inhibit the Proliferation, Survival, and Metastasis of Hepatocellular Carcinoma.
索拉非尼和卡非佐米协同抑制肝细胞癌的增殖、存活和转移。
  • DOI:
    10.1158/1535-7163.mct-17-0541
  • 发表时间:
    2018-12
  • 期刊:
    MOLECULAR CANCER THERAPEUTICS
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Jiang, Chao;Xu, Rui;Li, Xiao-Xing;Zhou, Yu-Feng;Xu, Xiao-Yi;Yang, Yang;Wang, Hui-Yun;Zheng, X. F. Steven
  • 通讯作者:
    Zheng, X. F. Steven
Deep learning based prediction of reversible HAT-specific lysine acetylation
基于深度学习的可逆 HAT 特异性赖氨酸乙酰化预测
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Briefings in Bioinformatics
  • 影响因子:
    9.5
  • 作者:
    Yu K;Zhang Q;Liu Z;Du Y;Gao X;Zhao Q;Cheng H;Li XX;Liu ZX
  • 通讯作者:
    Liu ZX
gutMEGA: a database of the human gut MEtaGenome Atlas
gutMEGA:人类肠道元基因组图谱数据库
  • DOI:
    10.1093/bib/bbaa082
  • 发表时间:
    2021-05-01
  • 期刊:
    BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
  • 影响因子:
    9.5
  • 作者:
    Zhang, Qingfeng;Yu, Kai;Li, Xiaoxing
  • 通讯作者:
    Li, Xiaoxing
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Journal of Cancer
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Wang R;Xu XY;Zhu H;Liang X;Lie X;Jia MX;Wang QH;Wang HY;Li XX;Zhao GJ
  • 通讯作者:
    Zhao GJ
MT1G is Silenced by DNA Methylation and Contributes to the Pathogenesis of Hepatocellular Carcinoma.
MT1G 被 DNA 甲基化沉默并促进肝细胞癌的发病机制
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Journal of Cancer
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Zeng JD;Zhang N;Zhao GJ;Xu LX;Yang Y;Xu XY;Chen MK;Wang HY;Zheng SX;Li XX
  • 通讯作者:
    Li XX

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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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