基于代谢组学的丙型肝炎病毒自发清除机制的研究

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基本信息

  • 批准号:
    81301472
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2109.医学病毒学与病毒感染研究新技术与新方法
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Most HCV infected patients (70-80%) develop chronic hepatitis ,but approximately 20-30% of HCV infected patients can clear the virus spontaneously after acute infection and avoid the progression to chronic hepatitis C, which can develop into cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Factors related to development of persistent infection, which occurs in the great majority of cases, or to spontaneous viral clearance, are not well defined. If we can find the factors affecting the spontanoeus clearance in host, may avoid developing to chronic hepatitis C. We performed serum metabolomics research on a small samples of the spontaneous clearance hepatitis C virus patients , chronic hepatitis C patients and normal control in our preliminary work.and find 5 possible biomarkers and pathogenesis of spontaneous clearance hepatitis C. This study will further focus on detecting these biomarkers serum level differences in a large sample of spontaneous clearance of hepatitis C virus, chronic hepatitis C, and the normal population by liquid chromatography tandemmass spectrometry and determineing the perturbation pathways, and to infer the biological processes of spontaneous clearance hepatitis C. Given appropriate intervention to hepatitis C ,triggering or inhibiting the metabolic pathway, may increase the rate of viral spontaneous clearance in hepatitis C infectors.
丙型肝炎病毒感染人后,70-80%的患者会慢性化,而其它20-30%的患者发生丙肝病毒自发清除,这部分患者大大减少了发展为慢性丙型肝炎-肝硬化-肝癌的几率,若能从宿主因素找到影响丙肝病毒自发清除的关键因子及机制,将可能避免丙肝慢性化的发生。我们前期工作中对小样本的丙肝病毒自发清除者、慢性丙型肝炎患者、正常对照的血清进行了代谢组学研究,发现各群体间存在代谢图谱的差异,已筛选出与丙肝病毒自发清除有关的5种较特异的生物因子,本研究拟进一步用代谢组学方法靶向检测这几种生物因子在大样本的丙肝病毒自发清除组、慢性丙型肝炎和正常人群血清水平的差异,并寻找这些生物因子的代谢途径,探讨其代谢通路及上下游代谢物质对于丙肝病毒自发清除的机制的影响,确定丙肝病毒自发清除的生物标志物。这些生物标志物的发现,对于未来给予丙肝病毒感染者适当的干预,激活或抑制其体内某代谢网络系统,提高丙肝病毒的自发清除率将有重要意义。

结项摘要

丙型肝炎病毒感染成人后,70-80%的患者会慢性化,而其它20-30%的患者发生丙肝病毒自发清除,这部分患者大大减少了发展为慢性丙型肝炎-肝硬化-肝癌的几率,本研究探索丙型肝炎自发清除者、慢性丙型肝炎(慢性丙肝)者及健康人血清代谢组学差异,探索HCV自发清除的关键分子及可能的发生机制。研究收集了丙型肝炎自发清除者、慢性丙肝患者和健康对照组的血清,采用快速液相色谱-串联质谱联用(LC-MS/MS)技术,应用主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)进行模式识别,然后通过变量重要性因子(VIP)、非参数检验,结合数据库检索筛选鉴定出差异的代谢物。进一步用标准品定量差异显著的物质。 18个变量被确认为存在显著差异的代谢物,其中5个变量被鉴定为磷脂酰乙醇胺、棕榈油酸、溶血磷脂酰胆碱、N-Acetyl-9-O-lactoylneuraminic acid、Dodecanoylcarnitine、Tetrahexosylceramide,涉及脂肪酸、磷脂等代谢。其中PE等物质,与自发清除组的相关性较好,工作者接受曲线(ROC)下面积为0.887~0.977,具有较好的特异性和敏感性。丙肝自发清除者、丙肝慢性感染者、健康人在血清代谢水平上存在明显差异,这些差异的代谢物可能是影响丙型肝炎病毒感染后不同结局的主要物质。

项目成果

期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
IFNL4 ss469415590 polymorphism contributes to treatment decisions in patients with chronic hepatitis C virus genotype 1b, but not 2a, infection.
  • DOI:
    10.1016/j.meegid.2016.01.020
  • 发表时间:
    2016-04
  • 期刊:
    Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ruihong Wu;X. Chi;Xiaomei Wang;Haibo Sun;Juan Lv;Xiuzhu Gao;Ge Yu;F. Kong;Hongqin Xu;
  • 通讯作者:
    Ruihong Wu;X. Chi;Xiaomei Wang;Haibo Sun;Juan Lv;Xiuzhu Gao;Ge Yu;F. Kong;Hongqin Xu;
Use of parenteral caffeinum natrio-benzoicum: an underestimated risk factor for HCV transmission in China
使用肠外苯甲酸咖啡因:中国丙型肝炎传播的一个被低估的危险因素
  • DOI:
    10.1186/s12889-015-2299-8
  • 发表时间:
    2015-09-19
  • 期刊:
    BMC PUBLIC HEALTH
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Xu, Hongqin;Yu, Ge;Niu, Junqi
  • 通讯作者:
    Niu, Junqi
Sustained viral response and treatment‐induced cytopenia correlate with SLCs and KLF12 genotypes in interferon/ribavirin‐treated Chinese chronic hepatitis C patients
  • DOI:
    10.1111/jgh.13290
  • 发表时间:
    2016-08
  • 期刊:
    Journal of Gastroenterology and Hepatology
  • 影响因子:
    4.1
  • 作者:
    Ruqi Mei;X. Chi;Ruihong Wu;Hongqin Xu;Xiaomei Wang;Xiuzhu Gao;Haibo Sun;Juan Lv;Ge Yu
  • 通讯作者:
    Ruqi Mei;X. Chi;Ruihong Wu;Hongqin Xu;Xiaomei Wang;Xiuzhu Gao;Haibo Sun;Juan Lv;Ge Yu
Replication Inhibition of Hepatitis B Virus and Hepatitis C Virus in Co-Infected Patients in Chinese Population.
中国人群乙型肝炎病毒和丙型肝炎病毒合并感染患者的复制抑制
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0139015
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Yu G;Chi X;Wu R;Wang X;Gao X;Kong F;Feng X;Gao Y;Huang X;Jin J;Qi Y;Tu Z;Sun B;Zhong J;Pan Y;Niu J
  • 通讯作者:
    Niu J
Red blood cell distribution width and globulin, noninvasive indicators of fibrosis and inflammation in chronic hepatitis patients
慢性肝炎患者红细胞分布宽度和球蛋白、纤维化和炎症的无创指标
  • DOI:
    10.1097/meg.0000000000000662
  • 发表时间:
    2016-09-01
  • 期刊:
    EUROPEAN JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY & HEPATOLOGY
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    Wang, Huan;Xu, Hongqin;Niu, Junqi
  • 通讯作者:
    Niu, Junqi

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其他文献

丙型肝炎病毒自发清除者的血清代谢组学研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    中华传染病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    姜翠;吴瑞红;王晓美;尹磊;尹沛源;迟秀梅;顾景凯;潘煜;许国旺
  • 通讯作者:
    许国旺
白洋淀沉积物-沉水植物-水系统氮、磷分布特征
  • DOI:
    10.13870/j.cnki.stbcxb.2017.03.050
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    水土保持学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王亚琼;薛培英;耿丽平;陈苗苗;孙洪欣;王殿武;冯宇佳;王晓美
  • 通讯作者:
    王晓美
三轴磁通门传感器水平和定向对地磁日变化观测数据的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    地震学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王晓美;滕云田;谭婧;吴琼;王喆
  • 通讯作者:
    王喆
基于改进非劣分类遗传算法的多目标药物制备工艺优化分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
    中国卫生统计
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    乔宇超;王晓美;任家辉;崔宇;赵执扬;仇丽霞
  • 通讯作者:
    仇丽霞
用多通道AD分级采集扩展地震数据采集器的动态范围
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    地球物理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王晓美;卢红娅;王喆;张旸
  • 通讯作者:
    张旸

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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