环形RNA介导U1 snRNA调控神经祖细胞分化的机制

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31900444
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Due to the low reproducibility of nerve cells, the cell regeneration therapy has been considered as the most promising treatment for neurodegenerative diseases. Precise control of neuronal differentiation is necessary for the generation of a variety of neurons. Several studies have indicated that the expression of circRNAs is closely related to neuronal differentiation, however, the biogenesis and the biological function of the circRNAs are still unknown. Based on research progress and our preliminary data, we speculate that circRNAs play an important role in mediating U1 snRNA, which regulate the differentiation of neural progenitor cells. To have a better understanding of this issue and to elucidate the underlying mechanisms, we are going to investigate how circRNAs mediate U1 snRNA-regulated differentiation of neural progenitor cell and further analyze the molecular mechanism involved in the expression of circRNA by RNA splicing. The study is performed to explore the regulatory mechanisms based on the methods of RAP-RNA, RNA-seq, RNA-FISH, RNA pull down, protein mass spectrometry, ChIP-seq and so on. This study will not only help to understand the mechanisms of circRNA expression and function, but also benefit for detecting new targets for the management of neural progenitor cell differentiation. Our results will provide new knowledge for the cell therapy of neurodegenerative diseases.
由于神经细胞的低可再生性,细胞再生疗法被认为是最具发展潜力的神经退行性疾病治疗手段,而精确控制神经分化是产生多种神经元的必要条件。有研究显示circRNA的表达与神经分化密切相关,但其生物学起源及功能尚不明确。基于研究进展和前期研究结果,我们推测circRNA在介导U1 snRNA调控神经祖细胞分化过程中发挥重要作用。为深入探讨此问题并明确相关机制,我们将采用RAP-RNA、RNA-seq、RNA-FISH、RNA pull down、蛋白质谱和ChIP-seq等方法探究circRNA介导U1 snRNA调控神经祖细胞分化的机制,明确U1 snRNA通过RNA剪接调控circRNA表达的分子细节。本研究不仅有助于加深对circRNA表达和功能机制的理解,促进对circRNA基本活动规律的认识,也有助于发现控制神经祖细胞分化的新靶点,为神经退行性疾病的细胞治疗研究提供新的理论依据。

结项摘要

先前的研究显示circRNA的表达与神经分化密切相关,但其生物学起源及功能尚不明确。由于中枢神经细胞的低可再生性,细胞再生疗法被认为是最具发展潜力的神经退行性疾病治疗手段,而精确控制神经分化是产生多种神经元的必要条件。基于本项目的研究结果,我们证实circRNA在介导U1 snRNA调控神经祖细胞分化过程中发挥重要作用,并明确了circRNA调控下游基因表达的机制。大多数神经祖细胞的circRNA是通过可变剪接产生的,这是真核基因表达过程中的一个重要步骤,由U1小核核糖核蛋白或I/II类核酶催化。反向剪接是一种顺式调控元件,能够调节剪接和催化循环,该过程的正确执行需要功能正常的剪接体。U1 snRNA的表达失调会导致U1 snRNA在细胞核内聚集并伴随细胞内广泛的RNA剪接异常,进而导致神经元功能异常。随着细胞内U1 snRNA表达水平的增加,更多的U1 snRNA会在内含子上的U1 snRNA的结合位点上结合,表明U1 snRNA通过控制U1 snRNA到新生转录本的募集来调节神经元中的RNA剪接和基因表达。此外,我们发现反向剪接的效率与正向剪接相比非常低,这可能是由于剪接体在反向剪接时组装不当造成的。这些研究结果不仅有助于加深对circRNA表达和功能机制的理解,促进对circRNA基本活动规律的认识,也有助于发现控制神经祖细胞分化的新靶点,为神经退行性疾病的细胞治疗研究提供新的理论依据。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Precise annotation of human, chimpanzee, rhesus macaque and mouse mitochondrial genomes leads to insight into mitochondrial transcription in mammals
人类、黑猩猩、恒河猴和小鼠线粒体基因组的精确注释有助于深入了解哺乳动物的线粒体转录
  • DOI:
    10.1080/15476286.2019.1709746
  • 发表时间:
    2020-01-12
  • 期刊:
    RNA BIOLOGY
  • 影响因子:
    4.1
  • 作者:
    Jin, Xiufeng;Cheng, Zhi;Gao, Shan
  • 通讯作者:
    Gao, Shan
How the Replication and Transcription Complex Functions in Jumping Transcription of SARS-CoV-2.
复制和转录复合体如何在 SARS-CoV-2 跳跃转录中发挥作用
  • DOI:
    10.3389/fgene.2022.904513
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Frontiers in genetics
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
  • 通讯作者:
Presenilin 1 mutation likely contributes to U1 small nuclear RNA dysregulation and Alzheimer's diseaseelike symptoms
Presenilin 1 突变可能导致 U1 小核 RNA 失调和阿尔茨海默病样症状
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Neurobiology of Aging
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Zhi Cheng;Yingchun Shang;Xinxin Xu;Zhiqiang Dong;Yongwang Zhang;Zhanqiang Du;Xinyi Lu;Tao Zhang
  • 通讯作者:
    Tao Zhang

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其他文献

一种预测我国汛期降水统计模型的建立
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    罗连升

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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