喜马拉雅东部山地鸟类物种垂直分布格局与成因

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31630069
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    275.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0402.动物系统与分类
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Species richness pattern and its driving factors are key issues in biogeography and evolutionary biology. East Himalayan Mountains area has two of the global biodiversity hotspots, where has long been considered as the original center, distribution center and endemism center of extensive bird species, is an ideal “Natural Lab” for zoogeographical studies. This proposal aims to interpret the elevational gradient of species richness distribution pattern of babblers in this area and its driving factors by integrating phylogenomics and genome based comparative phylogeography. We plan to firstly construct the α and β leveled species richness patterns, and then test the species differentiation and phylogenetic diversity pattern, compare the phylogeographical divergence and genetic diversity in relating to their related environmental factors, and finally integrate multiple factors analysis. The proposal try to correlate speciation, population divergence, phylogroup distribution, and their relatedness with climatic and ecological factors as well as geological history to explore mechanism and driving factors of elevational distribution patterns within this mountain system. The study will hopefully contribute some new ideas to the research field of biogeography.
物种丰富度分布格局及其形成动因是目前生物地理学和进化生物学的研究热点。喜马拉雅东部山地是全球生物多样性热点;是许多鸟类物种的起源地、分布中心、分化中心和特有化中心;是研究动物地理分布格局的“天然实验室”。本项目通过整合系统发育基因组、比较谱系基因组分析方法,揭示喜马拉雅东部山地画眉科鸟类物种垂直分布格局及其成因。项目首先研究在α、β不同层次的物种丰富度垂直分布格局;然后解析物种分化及系统发育多样性分布格局;比较不同物种种群谱系分化、遗传多样性格局及其与环境因子之间的关联性;最后开展地理格局形成的综合因子分析。本研究尝试通过对生物多样性热点地区鸟类的物种分化、种群分化、地理分布及其与气候因子、生态因子、地质历史事件的关联性分析,来揭示喜马拉雅东部山地山脉系统鸟类物种的时空分布格局与形成机制。本研究将在动物地理领域的核心理论问题上提出新的见解。

结项摘要

本研究通过对鸟类物种分化、种群分化、地理分布及其与气候因子、生态因子、地质历史事件的关联性分析,揭示喜马拉雅东部山地鸟类物种的时空分布格局与形成机制,探讨鸟类物种高海拔分布的适应进化组学依据。.构建了全球90%的鹛类物种系统发育树,建立了7科、64属的新分类系统,并提出1新科和1新属,为鹛类演化和多样性格局研究提供了基础。研究发现鹛类在中新世早期起源于中国-喜马拉雅山地,在此山脉系统的物种积累时间最长。该区域物种多样性与其首次拓殖时间相关,与扩散事件和多样化速率无关;更新世的快速物种分化是导致岛屿物种丰富度快速增加和积累的主要原因。由此,鹛类的多样性格局主要受“时间-成种效应”的影响,岛屿是鹛类的分化中心,与第四纪冰期导致的海平面下降有关。该研究支持中国-喜马拉雅地区热带、亚热带环境是鹛类的起源中心,并赋予印度-太平洋群岛的近期物种分化摇篮。发现中国雀形目鸟类谱系多样性格局以萨尔温江-湄公河-珠江为分界线,热带保守性能更好地解释分界线西南热点的形成动因,而多样化速率更好地解释东北热点的形成动因。.发现了两种柳莺之间的DMD现象。青藏高原东部的祖先种群向西扩张并替代了目前已灭绝的另一物种,该灭绝物种的线粒体及少量核基因通过遗传渐渗传递到了该扩张种群,形成了目前的黄腹柳莺,此现象被称为“幽灵渐渗”。该研究的意义在于发现了和已灭绝物种之间的“幽灵渐渗”现象可能是自然界很常见的一种现象。.已完成项目任务书所有考核指标。发表论文24篇,其中第一标注9篇,其他标注15篇,SCI论文22篇。参加18人次国际会议,并作11次报告;参加31人次国内会议,并作20次报告。培养博士后3位、研究生10位。团队1人在国内、外学术组织人任重要职务;3人获中科院院长优秀奖和优秀毕业生;1人获中国动物学会长隆启航奖;1人被提名为中国科协青年托举人才;培养2篇中国科学院优秀毕业论文。

项目成果

期刊论文数量(21)
专著数量(0)
科研奖励数量(6)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Physiological and genetic convergence supports hypoxia resistance in high-altitude songbirds.
生理和遗传趋同支持高海拔鸣禽的耐缺氧能力
  • DOI:
    10.1371/journal.pgen.1009270
  • 发表时间:
    2020-12
  • 期刊:
    PLoS genetics
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Xiong Y;Fan L;Hao Y;Cheng Y;Chang Y;Wang J;Lin H;Song G;Qu Y;Lei F
  • 通讯作者:
    Lei F
Near-complete phylogeny and taxonomic revision of the world's babblers (Aves: Passeriformes)
世界鸫鸟(鸟纲:雀形目)的近乎完整的系统发育和分类学修订
  • DOI:
    10.1016/j.ympev.2018.10.010
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION
  • 影响因子:
    4.1
  • 作者:
    Cai, Tianlong;Cibois, Alice;Fjeldsa, Jon
  • 通讯作者:
    Fjeldsa, Jon
Divergent and parallel routes of biochemical adaptation in high-altitude passerine birds from the Qinghai-Tibet Plateau
青藏高原高海拔雀形目鸟类生化适应的分歧与平行途径
  • DOI:
    10.1073/pnas.1720487115
  • 发表时间:
    2018-02-20
  • 期刊:
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Zhu, Xiaojia;Guan, Yuyan;Storz, Jay F.
  • 通讯作者:
    Storz, Jay F.
Factors determining species richness patterns of breeding birds along an elevational gradient in the Horn of Africa region
非洲之角地区沿海拔梯度繁殖鸟类物种丰富度模式的决定因素
  • DOI:
    10.1002/ece3.5491
  • 发表时间:
    2019-08-05
  • 期刊:
    ECOLOGY AND EVOLUTION
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    Abebe, Ahunim Fenitie;Cai, Tianlong;Lei, Fumin
  • 通讯作者:
    Lei, Fumin
The role of evolutionary time, diversification rates and dispersal in determining the global diversity of a large radiation of passerine birds
进化时间、多样化率和扩散在决定雀形目鸟类大辐射全球多样性中的作用
  • DOI:
    10.1111/jbi.13823
  • 发表时间:
    2020-04-24
  • 期刊:
    JOURNAL OF BIOGEOGRAPHY
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Cai, Tianlong;Shao, Shimiao;Fjelds, Jon
  • 通讯作者:
    Fjelds, Jon

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雷富民的其他基金

山雀科鸟类多样性垂直格局的形成动因和适应进化机制研究
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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