我国华东地区副溶血弧菌的遗传相关性和分子进化研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31150001
  • 项目类别:
    专项基金项目
  • 资助金额:
    15.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2003.食品微生物学
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2013-12-31

项目摘要

副溶血弧菌是一种革兰氏阴性嗜盐杆菌,在全世界沿海地广泛存在,它是海产品中引起食物中毒最重要的致病菌之一。本课题从我国华东地区主要沿海城市分离、收集来自于临床、食品和环境的副溶血弧菌,采用ERIC-PCR技术初步进行分型;对于代表性菌株,应用PFGE技术和MLST方法进行分子分型,通过电泳图谱聚类分析和系统发育图谱的构建,明确不同来源不同地区菌株间的遗传相关性,推断流行株的播散途径,为消除病原微生物对食品污染的的关键环节提供科学依据;另外,通过分析看家基因的重组现象,揭示副溶血弧菌的进化机制。本课题对于深入了解我国副溶血弧菌的分子流行病学现状,实现对副溶血弧菌的主动监测、暴发调查和传染源追踪,预防和控制副溶血弧菌引起的食源性疾病,具有重要理论和实践意义。

结项摘要

副溶血弧菌是鱼虾、贝类等海产品中重要的致病菌,因此在海产品消费量较大的长三角地区沿海城市开展关于副溶血弧菌流行病学特征及其溯源研究显得十分重要。.本研究选取了来自上海、宁波、舟山的109株临床、食品和环境分离株,首先对其进行了毒力基因的筛查和血清分型研究;在此基础上,采用了ERIC-PCR和MLST技术对副溶血弧菌进行了分型研究。.一、不同来源副溶血弧菌毒力基因筛查及致病性分析.利用PCR方法对109株副溶血弧菌分离株的毒力基因tdh、trh、ToxRS/new、orf8进行筛查,结果表明tdh的携带率最高(64.2%),trh携带率最低(7.3%),ToxRS/new(39.4%)和orf8(30.3%)介于两者之间;同时,三种不同来源的菌株携带率差异大,临床分离株四种携带率均为最高,而环境分离株则最低。.二、不同来源副溶血弧菌分离株的血清分型.通过玻片凝集反应对所有分离株进行了血清分型,结果表明:在所检测到的26种血清型中,O3:K6和O4:K8所占比例较高,分别为20.7%和19.5%,合计达40.2%,其次为O4:K68,O1:K25,O3:K68,O3:K25,O3:K8和O1:K6等。.三、不同来源副溶血弧菌分离株的ERIC-PCR分型.采用ERIC-PCR基因分型方法,结合聚类分析进行了各分离株之间的遗传相关性比较,结果表明:ERIC-PCR指纹图谱可将109株副溶血弧菌分为65个型,31个类群,并得到类群19为最流行ERIC群,聚集了30株临床分离株和8株食品分离株,且tdh携带率高达97.4%(37/38);亲缘关系比较显示:不同来源的分离株可聚为一类,其中有5个亚型中存在食品分离株与致病性分离株聚在一起,基因水平上存在一定的相关性。.四、不同来源副溶血弧菌分离株的MLST分型.本研究中,109株副溶血弧菌MLST分型结果具有较高的多样性,共得到55个STs,其中新发现的ST型所占比例高达77.7%(40/55),新的等位基因型也多达78个。在所有ST型中,ST-3为优势序列型,共34株,且均为ERIC-19类群,并广泛存在于不同地点、不同年份、不同来源的分离株中。Mega软件亲缘关系分析表明,ST-305、ST-830与ST-3、ST-155与ST-794分别存在较近的亲缘关系,具有较高的基因水平相似度。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Molecular typing of Vibrio parahaemolyticus isolates from the middle-east coastline of China
中国中东海岸线副溶血性弧菌的分子分型
  • DOI:
    10.1016/j.ijfoodmicro.2011.12.001
  • 发表时间:
    2012-02-15
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF FOOD MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    5.4
  • 作者:
    Chen, Wanyi;Xie, Yanping;Shi, Xianming
  • 通讯作者:
    Shi, Xianming
血清分型及ERIC-PCR分型方法分析不同来源副溶血弧菌的遗传相关性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国食品学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    茆丹;陈万义;周秀娟;周敏;施春雷;史贤明
  • 通讯作者:
    史贤明

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其他文献

ヒトメタニューモウイルスミニゲノム系を利用したM2-2蛋白質の転写複製調節の解析
利用人间质肺病毒小基因组系统分析 M2-2 蛋白的转录和复制调控
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  • 通讯作者:
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  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周敏;周世健;王奉伟
  • 通讯作者:
    王奉伟

其他文献

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周敏的其他基金

ABC转运蛋白介导副溶血性弧菌耐药性产生的分子机制
  • 批准号:
    31471660
  • 批准年份:
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    92.0 万元
  • 项目类别:
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相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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