孤独症全基因组关联第二阶段研究

孤独症是一种起病于婴幼儿期的神经发育障碍。研究提示遗传因素在该病发病中起重要作用。孤独症全基因组关联研究(GWAS)克服了候选基因策略的局限性，有助于从全基因组水平发现新的易感基因。由于种族遗传异质性，亟待开展汉族人群孤独症GWAS研究。本课题组前期已完成汉族孤独症GWAS第一阶段研究，对240个孤独症家系进行了全基因组50万个单核苷酸多态性(SNPs)芯片检测，发现40余个与孤独症关联的SNP位点。本研究将另外收集较大孤独症家系样本，采用与前期工作相同的诊断标准(孤独症诊断访谈量表)，降低样本的异质性；继而采用Sequenom MassARRAY等基因型检测方法，对GWAS第一阶段筛选出的具有显著意义的SNP位点进行第二阶段验证；以期发现新的孤独症神经发育相关易感基因，并对易感基因功能进行初步研究。本研究与前期工作密切衔接，预期结果将为孤独症病因与发病机制提供线索。

本项目采用多种国际通用的诊断标准，并引进相应工具，完成孤独症诊断访谈量表(ADI-R)、孤独症评定量表(CARS)、孤独症行为问题问卷(ABC)的评定，辅以较为完整的各项临床评估。采集儿童孤独症患者血样，以及其父母正常对照的血样，并提取DNA。目前已收集汉族儿童孤独症核心家系800余个，建立孤独症遗传资源库。.全基因组关联研究两阶段设计的第一阶段研究，并开展了第二阶段的研究。 在第一阶段的研究中，首先进行了240个家系的全基因组SNP芯片的检验，经过严格的质量控制后，去除1个家系，239个家系纳入统计分析。采用PLINK软件和FBAT进行全基因组以家系为基础的关联研究，发现多个具有显著性意义的SNP位点。在第二阶段研究中，选取P <1E-05的10余个位点在在另外独立样本约569余个孤独症家系中进行全基因组关联研究结果的2期验证，研究发现位于SMARCA2 基因上游的rs3847228 与孤独症关联，而且另外一个位于NRXN3基因的SNP(单核苷酸多态性)位点也与孤独症关联（P<0.05）。SMARCA2 参与染色质的重塑，使其他转录因子结合到DNA上，发挥转录活性，继而启动其他基因的表达。既往研究报道SMARCA2 与精神分裂症关联。SMARCA2 本研究进行了SMARCA2的功能研究，发现干扰SMARCA2 影响神经元迁移。NRXN3是参与突触形成的分子，既往研究发现参与突触形成的分子NLGN3、NLGN4、SHANK3、SHANK2等与孤独症关联，提示孤独症患者可能存在突触的异常。突触是一个神经元与另一个神经元相接触的部位。因此，突触是神经元之间在功能上发生联系的部位，也是信息传递的关键部位。既往研究曾发现NRXN家族中的NRXN1 基因与孤独症关联，但尚未有报道NRXN3 基因与孤独症关联。通路分析也发现，参与神经发育、树突形成的通路与孤独症关联。研究结果已投稿并修回。.全基因组关联研究也为易感基因关联研究提供了宝贵的线索。既往研究仅针对RELN基因进行关联分析，尚无DAB1基因与孤独症关联的报道。本课题组进一步针对通路分析发现，RELN通路上的DAB1 基因与孤独症关联。继而以全基因组关联研究为线索，发现DISC1，ATP2B2 是孤独症的易感基因。对ASMT基因测序发现孤独症患者存在罕见突变。共发表论著6篇，其中SCI收录论著5篇。..

内容获取失败，请点击重试