基于非水相合成肝靶向核苷类药物的半乳糖苷酶分子改造研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21506099
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0812.生物化工与合成生物工程
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

The galactosyl nucleoside analogs designed by biomimetic recognition feature, could be recongnized and specifically binding to asialoglycoprotein receptor (ASGP-R) of hepatic cell, and transported intracellular. Thus, galactosyl nucleosides exhibit the features of the high selectivity of liver targeting effect and low toxicity, and exploitation of new type of liver targeting disaccharide nucleosides analogues received much attention for the liver diseases therapy. However, the few sources and high cost of galactosidase, low efficiency and productivity of the reaction, especially the properties of region-selectivity, substrate recognition and different affinities of galactosidase limited the large-scale application. Under such circumstances, we explored the novel organic-solvent tolerant galactosidase for the galactosyl nucleosides preparation. We will investigate the mechanism of substrate recognition and regioselectivity of the galactosidase by the molecular dynamic and bioinformatics approaches, and analyze the proximity and orientation between the different nucleosides substrates with the key amino acid residues nearby the enzyme active center. This may give more comprehensively and accurately theoretical explanation of the mechanism of transgalactosylation reaction by galactosidase. Furthermore, we will put forward a proposal for rational design molecular alteration of the galactosidase for the nucleosides, and high efficient mutants of galactosidase could also be obtained by protein engineering. We further study the high efficient and low-cost synthesis of biotechnology of disaccharide nucleosides in non-aqueous system. This may promote the development and application of the liver targeting disaccharide nucleoside analogs.
基于无唾液酸糖蛋白受体(ASGP-R)生物分子特异性识别、结合并转运的功能设计肝脏靶向性核苷类药物,以肝靶向半乳糖基核苷类药物合成为目的来解析改造半乳糖苷酶分子。本项目针对目前生物酶法合成二糖核苷存在的酶源有限、底物识别亲和力低、底物溶解性差导致的产率低等问题,以自行筛选的耐有机溶剂半乳糖苷酶为对象,研究酶催化活性中心微环境与核苷类底物识别结合与糖基化反应区域选择性机制,阐释并丰富半乳糖苷酶的转糖基化反应理论;提出针对核苷类底物的半乳糖苷酶分子改造新策略,蛋白质工程手段获得定向合成二糖核苷类药物高糖基化活性、优越区域选择性的糖苷酶突变体,为肝靶向核苷类药物合成酶提供改造技术。同时将非水相催化理念引入酶法合成二糖核苷的催化体系,非水溶剂促进底物溶解性,抑制水解反应,调控酶微环境,调节糖基化选择性甚至反应程度,形成高效低成本的合成二糖核苷新型非水相生物催化技术,将推动肝靶向治疗药物的开发应用。

结项摘要

核苷类药物齐多夫定、肌苷、5-氟脱氧尿苷、利巴韦林、地西他滨、恩曲他滨、恩替卡韦等是重要的抗乙肝病毒、丙肝病毒、HIV病毒以及白血病等肿瘤疾病治疗药物。一些治疗效果显著的核苷类药物在临床使用往往剂量大、副作用较大、靶向性较弱;半乳糖基修饰的核苷类药物不仅具有等同生物活性,而且毒副作用更低(可降低约100倍),而且能增强靶向性。本项目在克隆表达获得的β-半乳糖苷酶基础上,表达策略优化实现了酶YZ06的高效可溶性表达,该酶能催化多种核苷类药物的高区域选择性地半乳糖基化修饰。同源建模构建了酶的三维结构模型,解析其与糖基供体乳糖、核苷类底物分子的识别微环境,并分析了该酶催化核苷类底物半乳糖基化反应的区域选择性机制。以提高半乳糖基核苷产物的合成产率等为目标,采用丙氨酸扫描、定点饱和突变等策略对酶分子进行定向进化,构建含约100突变体的酶分子突变库;筛选获得了5个较高效的酶突变体。探讨了亲水性有机溶剂及金属离子对酶活性及稳定性影响,亲水性有机溶剂调控产物的生成种类,并表征了其催化反应动力学参数。构建了半乳糖基核苷类产物合成的高效非水相催化体系3个;系首次报道亲水性有机溶剂调控半乳糖苷酶催化合成半乳糖基核苷类产物。该酶的多个突变体实现了10多种半乳糖基核苷产物的高浓度水平合成(大部分达10.5 g/L~16.0 g/L,最高达21.4 g/L),反应底物浓度是初始的10倍,合成产率最高可达43.9%。突破了现有的生物酶法制备半乳糖基核苷类产物浓度水平低、区域选择性较差等重大瓶颈问题,本项目的半乳糖苷酶筛选表达及其设计与定向改造、非水相生物催化提供了更丰富的实例。有助于低毒高效的抗病毒核苷类药物开发,相关的研究成果具备适用性和潜在的应用价值。本课题累计申请相关的国家发明专利7项(其中2项已获授权,其余均已获公开),共发表标注本项目资助的SCI论文12篇,并在国际会议上发表了2篇会议论文。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(3)
专利数量(7)
Precisely regulated galactosylation of nucleoside analogues in aqueous hydrophilic solvents catalyzed by solvent-stable beta-galactosidase
在溶剂稳定的 β-半乳糖苷酶的催化下,在亲水性溶剂中精确调控核苷类似物的半乳糖基化
  • DOI:
    10.1039/c6ra12167e
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    RSC Advances
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Youzhi Zhou;Jianlin Chu;Jinsong Zhang;Ke Liu;Bingfang He
  • 通讯作者:
    Bingfang He
Efficient synthesis of ponasterone A by recombinant Escherichia coli harboring the glycosyltransferase GT(BP1) with in situ product removal
携带糖基转移酶 GT(BP1) 的重组大肠杆菌高效合成松甾酮 A,并原位产物去除
  • DOI:
    10.1039/c7ra02367g
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    RSC Advances
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Bingfeng Li;Xuejun He;Bo Fan;Jianlin Chu;Bingfang He
  • 通讯作者:
    Bingfang He
A novel strategy to improve the aromatic alcohols tolerance of enzyme for preparative-scale synthesis of natural glycosides
提高天然糖苷制备规模合成酶对芳香醇耐受性的新策略
  • DOI:
    10.1016/j.catcom.2017.07.025
  • 发表时间:
    2017-12
  • 期刊:
    Catalysis Communications
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Youzhi Zhou;Lu Zhao;Ke Liu;Jinsong Zhang;Jianlin Chu;Bingfang He
  • 通讯作者:
    Bingfang He
Switching glycosyltransferase UGTBL1 regioselectivity toward polydatin synthesis using a semi-rational design
使用半理性设计将糖基转移酶 UGT(BL)1 区域选择性转变为虎杖甙合成
  • DOI:
    10.1039/c8ob00376a
  • 发表时间:
    2018-04-14
  • 期刊:
    ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    Fan, Bo;Dong, Wenxin;He, Bingfang
  • 通讯作者:
    He, Bingfang
Lipase immobilization on functionalized mesoporous TiO2: Specific adsorption, hyperactivation and application in cinnamyl acetate synthesis
功能化介孔 TiO2 上的脂肪酶固定化:特异性吸附、超活化及其在乙酸肉桂酯合成中的应用
  • DOI:
    10.1016/j.procbio.2017.09.011
  • 发表时间:
    2018-01-01
  • 期刊:
    PROCESS BIOCHEMISTRY
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Gao, Zhen;Chu, Jianlin;He, Bingfang
  • 通讯作者:
    He, Bingfang

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其他文献

大肠杆菌BL21(DE3)膜组分相关基因的敲除对重组蛋白胞外分泌的影响
  • DOI:
    10.13343/j.cnki.wsxb.20150130
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    微生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    朱芸;周有治;储建林;何冰芳
  • 通讯作者:
    何冰芳
丁三醇合成关键酶的筛选、酶学性质及体外催化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    生物加工过程
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李惑;曹雪飞;储建林;吴斌
  • 通讯作者:
    吴斌
灵芝-黄芪双向发酵菌质多糖的分离纯化及生物活性研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    生物加工过程
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    裴智鹏;郑雪艳;何冰芳;储建林
  • 通讯作者:
    储建林

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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