蓝细菌Synechococcus elongatus UTEX 3055趋光性信号转导机理研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31900028
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0102.微生物生理与生化
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Phototaxis enables bacteria to search for light energy required for cell growth, while avoiding damages caused by strong light. Current research in bacterial phototaxis is mostly focused on a coccoid unicellular cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. However, due to the complexity of multiple pathways affecting phototactic motility, it is difficult to study the mechanism of phototactic signaling in this strain. Moreover, the majority of studies have been focused on identifying the photoreceptors and their responsive light spectra, but the molecular mechanism of signal transduction from photoreceptors to motility apparatus remains elusive. In our previous study, we isolated a wild rod-shaped cyanobacterium S. elongatus UTEX 3055 and found it has a more straightforward mechanism of regulating phototactic motility. Therefore, in this proposal, we will use UTEX 3055 as a model to investigate the mechanism of phototactic signal transduction, mainly through characterizing the function of each pathway proteins, their subcellular localization and protein interactions. This study is aiming to establish a new model for studying rod-shaped cyanobacteria phototaxis, which will help us further dissecting the phototactic signaling mechanism and increase our knowledge of phototaxis in bacteria with different cell shapes.
趋光性赋予细菌主动寻找生长所需光能并避开强光伤害的能力。对细菌趋光性分子机制的研究大多集中于球形单细胞蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803。然而该菌株的趋光运动受到多个信号通路的调控,增加了对信号转导机制研究的复杂性。并且已有的研究大多集中于光受体的发现及对其所感受光谱的鉴定,而受体接收到光信号之后如何将其传递到运动器官,并调控细菌运动方向的机制尚不清楚。Synechococcus elongatus UTEX 3055是一株新鉴定的短杆状蓝细菌,已有的研究发现该菌株趋光信号通路更直接。因此,本项目将以UTEX 3055为模型,通过对趋光信号转导途径中各蛋白组份进行体内和体外的功能鉴定,细胞定位以及互作关系研究,来揭示其信号转导的分子机制。本研究拟建立一个研究杆状蓝细菌趋光性的模型,帮助我们进一步了解细菌趋光性的分子机理并拓展我们对具有不同形状细菌的趋光性机制的认识。

结项摘要

细菌趋光性是众多细菌趋向性行为之一,能让细菌朝向或远离光源运动,有利于细菌在复杂的光照条件中获得适宜的光照条件,对细菌的适应性生存具有重要意义。然而,与细菌趋化性相比,细菌趋光性的细胞内信号转导机制仍不清楚。本研究以一株具有趋光性的蓝细菌Synechococcus elongatus UTEX3055为研究对象,通过遗传学、分子生物学和生物化学等方法研究了趋光性信号的细胞内转导机制。研究发现,由tax1操纵子编码的六个蛋白PixGSe、PixHSe、PixISe-1、PixJSe、PixLSe和PixISe-2之间通过蛋白-蛋白相互作用紧密联系,形成一个复杂的光信号处理复合体,类似于细菌趋化性系统。这些蛋白完全或部分定位于细胞两级,调控细菌趋光性行为。尽管PixLSe与两个潜在响应调节蛋白PixGSe、PixHSe相互作用,但保守位点突变分析表明,激酶PixLSe与响应调节蛋白PixGSe,而不是pixHSe,组成趋光性核心双组份信号系统,并在趋光性运动中起到关键作用。此外,单独的CheW家族蛋白PixISe-1或PixISe-2在功能上并不具备CheW的连接功能,进一步表明趋光信号系统和趋化性系统的信号转导机制可能存在差异。本研究首次完整描绘了细菌趋光性系统相关蛋白在细胞内的定位及相互作用关系,加深了对单细胞杆状蓝细菌Synechococcus elongatus UTEX 3055趋光性蛋白网络架构的全面认识。同时,初步建立了一个研究单细胞短杆状蓝细菌趋光性的分子模型,为进一步研究细菌趋光性提供了基础。尽管还存在一些待解决的问题,本研究的结果将有助于更深入地探究细菌趋光性的机制。

项目成果

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  • 期刊:
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  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    赵燕
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  • 作者:
    吴昊;赵燕;唐利龙;赵勇;邓华亮;韦昱;杨毅玲;李玉梅
  • 通讯作者:
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杨毅玲的其他基金

杆状蓝细菌趋光运动中细胞形状动态变化的机制
  • 批准号:
  • 批准年份:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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