基于质谱技术对胰腺癌病人血清蛋白位点特异性岩藻糖修饰的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81601828
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    18.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2603.细胞学和血液学检验
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Pancreatic cancer is one of the most malicious cancers. The earlier pancreatic cancer is diagnosed, the better is the prognosis. The ideal diagnostic marker should be able to distinguish pancreatic cancer patients from the people with high risk, such as with family pancreatic cancer, hereditary pancreatitis, obese, or type II diabetes etc. CA19-9 is the biomarker used clinically to diagnose pancreatic cancer. However, CA19-9 also increase in many non-pancreatic cancer diseases, such as pancreatitis, cystic fibrosis, obstructive jaundice, or diabetes but does not increase in some pancreatic cancer patients. The antibody of CA19-9 is able to recognize an antigen of glycan with fucosylation, sialyl Lewis A. This project will simplify the glycan structure of glycoproteins with sialidase/galactosidase double digestion and optimize mass spectrometry technology to screen for protein site-specific fucosylation as biomarkers for early pancreatic cancer using serum samples from patients of pancreatitis, type II diabetes, early and late stage pancreatic cancer which are not differentiated by CA19-9.The potential markers will be validated with MRM (multiple reaction monitoring)using yeast or cell line expressed isotopic labeled fucosylated peptide standards. Our approach will try to find site-specific fucoylation of serum proteins as biomarkers for early pancreatic cancer diagnosis.
胰腺癌是最致命的恶性肿瘤之一。病人的预后诊断和肿瘤的发现阶段密切相关。理想的诊断标志物应该区分胰腺癌病人和高危人群如有家族胰腺癌史、遗传性胰腺炎、肥胖或II型糖尿病等人群。糖抗原 19-9 (CA19-9)是目前临床使用的胰腺癌标志物,但它在胰腺炎、囊肿性纤维化、梗塞性黄疸和糖尿病等非癌症患者中也升高。CA19-9是岩藻糖修饰类型的一种。本课题拟通过借助唾液酸酶/半乳糖苷酶双酶切简化糖蛋白质的糖链并结合质谱技术的方法,对CA19-9检测无法区分的人群(包括胰腺炎、II型糖尿病、早期和晚期胰腺癌病人)中的血清糖蛋白质的岩藻糖修饰进行定性和相对定量分析,筛选出潜在的早期胰腺癌诊断标志物,并拟通过基因工程表达体系表达有岩藻糖修饰的肽段作为标准物对筛选到的潜在标志物进行基于质谱的高通量验证。本项目将实现蛋白质位点特异性岩藻糖修饰研究,以期找到临床诊断中可用的灵敏度高、特异性强的早期胰腺癌标志物。

结项摘要

本项目开发了应用质谱对人血清蛋白质岩藻糖修饰(蛋白质糖修饰的一种)的定性和定量研究方法,并将开发的血清蛋白质岩藻糖修饰的定性和定量方法应用到胰腺癌病人样品中,筛选早期胰腺癌的诊断标志物。首先,我们运用了HCDpdHCD MS3/CID MS2的质谱扫描策略对糖肽进行定性分析,同时我们解决了在质谱分析糖肽过程中避免源内裂解的问题,我们也开发了唾液酸酶和半乳糖苷酶双酶切糖链的方法,用于区分核心岩藻糖和末端岩藻糖修饰。之后,我们进一步建立了LC-HCD-PRM-MS 的质谱扫描策略进行糖肽的定量分析,使糖肽离子在复杂样品背景中实现高灵敏度、高选择性、高通量的自动定量,并比较了母离子水平定量和子离子水平定量两种定量方法在糖肽定量中的应用。在这个过程中,我们发现LC-HCD-PRM-MS的质谱扫描策略不仅可以用于岩藻糖修饰的定量分析,也可以用于糖肽同分异构体的定量分析。另外,我们也尝试利用植物表达体系生物合成岩藻糖修饰糖肽,探索应用该方法生产糖肽标准品实现对标志物糖肽绝对定量的可能性。本项目开发的糖肽定性和定量研究方法可以应用到其他任何基于糖肽的疾病标志物的筛选系统中,具有广泛的应用范围。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Quantitative Analysis of α-1-Antitrypsin Glycosylation Isoforms in HCC Patients Using LC-HCD-PRM-MS
使用 LC-HCD-PRM-MS 定量分析 HCC 患者中的 Alpha-1-抗胰蛋白酶糖基化亚型
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.0c00420
  • 发表时间:
    2020-06-16
  • 期刊:
    ANALYTICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Yin, Haidi;Zhu, Jianhui;Lubman, David M.
  • 通讯作者:
    Lubman, David M.
The analysis of alpha-1-antitrypsin glycosylation with direct LC-MS/MS.
使用直接 LC-MS/MS 分析 Alpha-1-抗胰蛋白酶糖基化
  • DOI:
    10.1002/elps.201700426
  • 发表时间:
    2018-09
  • 期刊:
    Electrophoresis
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Yin H;An M;So PK;Wong MY;Lubman DM;Yao Z
  • 通讯作者:
    Yao Z

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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