禽白血病病毒在药物选择压下的基因变异和准种演变

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31402226
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1802.兽医病毒学
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2017-12-31

项目摘要

The use of combinations of reverse transcriptase inhibitor drugs have proven remarkably effective in controlling the progression of human immunodeficiency virus (HIV) disease, but these benefits can be compromised by the development of drug resistance. This project attempt to study the inhibitory effect of these drugs to another retrovirus Avian leukosis virus (ALV) in vitro and in vivo and construct a passage serial of ALV under the selective pressures of these drugs, aiming to find the mutation of different gene especially for pol gene and the evolution of it’s quasispecies. This research can be used as a good model to study the evolution molecular mechanism of some retroviruses such as HIV, also can supply some basic data for the possible effect for these drugs using in the eradication program of breed chickens in China.
逆转录酶抑制剂类药物是治疗人获得性免疫缺陷病毒(HIV)感染的主要途径,但药物长期应用会使HIV 产生耐药性。本申请项目将研究该类药物对同是逆转录病毒的禽白血病病毒(ALV)在体外和体内的抑制作用,构建ALV 在相关药物及其组合的选择压作用下的连续传代系列,并对不同传代毒株的不同基因特别是pol 基因扩增测序、比较分析病毒准种的演变动态,以探索药物选择压下ALV 耐药毒株产生的可能性及相关的基因变异。本研究不仅可作为研究抗病毒药物对HIV 等逆转录病毒及其演变的分子机制的动物模型,也可为我国许多原种鸡场实施ALV 净化过程中辅助药物控制手段提供实验依据。

结项摘要

由人免疫缺陷病毒(HIV)感染导致的人获得性免疫缺陷综合征(AIDS)是全世界最为关注的疾病,逆转录酶抑制剂类药物(NRTI)是目前治疗AIDS的重要手段,但长期服用药物会导致HIV产生耐药性。本项目首先研究了逆转录酶抑制剂类药物对同是逆转录病毒的禽白血病病毒(ALV)在体外和体内的抑制作用,利用这种抑制作用先后实施针对禽白血病在体内的净化并成功去除弱毒疫苗毒种中ALV的污染。更重要的是,本研究试图以鸡ALV为模型观察其在Azidothymidine连续作用下耐药性产生的可能性并确定其耐药性产生相关的关键核酸位点。为此,我们将ALV-J分别在含有Zidovudine和Lamivudine两种药物的细胞培养体系中连续传代50代,结果发现第50代毒株分别产生了对Zidovudine和Lamivudine的耐药性,对产生耐药性ALV-J毒株的pol基因高变区通过高通量测序观察了病毒准种结构的变化,结果显示其排名第一位的优势准种所占的比例因为药物的选择作用显著下降,Zidovudine的选择作用要显著强于Lamivudine。对产生耐药性毒株的pol基因开展高通量测序并与未产生耐药性的毒株比较,发现了一个可能与耐心性产生相关的pol基因变异位点。在感染性克隆rSD1005株基础上构建了pol基因突变的点突变株SD1005-T196A,结果显示SD1005-T196A产生了对Azidothymidine的耐药性,说明发现的位点与ALV耐药性的产生密切相关。本研究观察了ALV-J在药物选择压下耐药毒株的产生,并通过高通量测序技术确定了ALV-J耐药性产生过程中病毒准种的演变规律及其pol基因发生突变的主要区域,这为研究逆转录病毒的耐药机制建立了很好的病毒模型。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
Gp85 genetic diversity of avian leukosis virus subgroup J among different individual chickens from a native flock
本地鸡群不同鸡个体间禽白血病病毒J亚型的gp85遗传多样性
  • DOI:
    10.3382/ps/pew407
  • 发表时间:
    2017-05-01
  • 期刊:
    POULTRY SCIENCE
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Li,Yang;Fu,Jiayuan;Zhao,Peng
  • 通讯作者:
    Zhao,Peng
齐多夫定和单克隆抗体联合应用去除 疫苗毒种中 REV的污染
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    病毒学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    任志浩;李阳;苏红芹;李思菲;崔治中;常爽;赵鹏
  • 通讯作者:
    赵鹏
Lamivudine Inhibits the Replication of ALV-J Associated Acutely Transforming Virus and its Helper Virus and Tumor Growth In vitro and In vivo.
拉米夫定在体外和体内抑制ALV-J相关急性转化病毒及其辅助病毒的复制和肿瘤生长
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2015.01306
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Frontiers in microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Wang Y;Xu S;Li S;Su H;Chang S;Li Y;Sun X;Zhao P;Cui Z
  • 通讯作者:
    Cui Z
Dynamic Co-evolution and Interaction of Avian Leukosis Virus Genetic Variants and Host Immune Responses.
禽白血病病毒遗传变异与宿主免疫反应的动态协同进化和相互作用
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2017.01168
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Frontiers in microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Dong X;Meng F;Hu T;Ju S;Li Y;Sun P;Wang Y;Chen W;Zhang F;Su H;Li S;Cui H;Chen J;Xu S;Fang L;Luan H;Zhang Z;Chang S;Li J;Wang L;Zhao P;Shi W;Cui Z
  • 通讯作者:
    Cui Z
ALV-J经卵黄囊接种对鸡的致病性与逆转录酶抑制剂类药物对鸡的保护作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    中国家禽
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    赵颖洁;张玉标;孟凡峰;吕艳艳;崔治中;常 爽;徐 步;范建华;赵 鹏
  • 通讯作者:
    赵 鹏

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其他文献

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  • 发表时间:
    2017-07
  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    赵鹏;吴文旋;吴佳海;朱伦琴;莘海亮;袁鑫;杨春红;杨康;孙伦;韩娥
  • 通讯作者:
    韩娥
Optimal allocation of redundancies in series systems
串联系统冗余的优化分配
  • DOI:
    10.1016/j.ejor.2012.02.024
  • 发表时间:
    2012-08
  • 期刊:
    European Journal of Operational Research
  • 影响因子:
    6.4
  • 作者:
    赵鹏;Chan, P.;Ng, H.K.T.
  • 通讯作者:
    Ng, H.K.T.

其他文献

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赵鹏的其他基金

基于外泌体和准种视角解析ALV-J基因多变性与稳定性的平衡机制
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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