利用CRISPR技术建立条件性PBRM1/BAP1双基因敲除小鼠肾癌疾病模型

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81874142
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1802.肿瘤发生
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

VHL, PBRM1, and BAP1 are closely associated with ccRCC (clear cell renal cell carcinoma) tumorigenesis. Patients with both PBRM1 and BAP1 mutations show shorter survival, high tumor grade, high risk of metastasis and the worst outcomes. The molecular mechanism of this double-mutant tumor is still uncovered. Recently, we generated genetically engineered mouse models (GEMM) for ccRCC including VHL-BAP1- and VHL-PBRM1-deficient mice. Both VHL-BAP1- and VHL-PBRM1-deficient kidneys recapitulate the morphology and biological behavior of human ccRCC. In this study, GEMM by CRISPR will be established to develop tumorigenesis in VHL-PBRM1-BAP1 deficient mice kidneys. To identify PBRM1-BAP1-associated target protein, mass spectrometry and sequencing analysis will be conducted. In addition, clinical therapy studies will be performed using this GEMM model and tumor cell lines derived from mice tumors. This project is critical to elucidate the mechanism by which PBRM1-BAP1 inhibits ccRCC tumorigenesis and to accelerate cancer therapy development for kidney cancer.
VHL、PBRM1、BAP1是与肾癌发生密切相关的三个抑癌基因,携带PBRM1与BAP1双基因突变的肾癌病人,生存时间短、恶性程度高、转移风险大、预后差,其发病机制尚不清楚。我们在前期工作中,建立了VHL-BAP1、VHL-PBRM1基因敲除小鼠肾癌模型,这两个小鼠模型具有典型的肾透明细胞癌病理学特征,具有临床学价值。为进一步研究PBRM1-BAP1双基因突变肾癌的发病机制,探索治疗手段,迫切需要建立基因敲除小鼠模型。因此,本项目在前期工作的基础上拟开展以下工作:1.CRISPR技术制作PBRM1-BAP1敲除小鼠,建立VHL-PBRM1-BAP1敲除小鼠肾癌模型;2.蛋白质谱、测序等鉴定与PBRM1-BAP1相关的靶蛋白;3.利用小鼠肿瘤模型及其肿瘤细胞系评估临床药物的治疗效果。本项目对于研究PBRM1-BAP1双基因突变的肾癌发病机制、药物筛选、探索新的治疗手段具有重要科学意义。

结项摘要

PBRM1/BAP1双突变的肾癌患者恶性程度高,存活时间短,关于PBRM1/BAP1双突变肾癌亚型的基础与临床研究鲜有报道。因此,本研究我们侧重于PBRM1/BAP1双突变的肾癌亚型,通过Cre/Loxp系统建立PBRM1/BAP1双突变的肾癌小鼠模型,通过动物模型,模拟肿瘤发生、研究PBRM1/BAP1同时缺失对动物生理、病理的影响。① 我们成功制作了PBRM1/BAP1双敲除的flox小鼠,PCR、Western等鉴定结果表明,转基因小鼠制作正确,Cre/Loxp系统正确工作;② PBRM1/BAP1缺失后,对细胞增殖的影响,通过细胞增殖曲线以及CCK8等实验表明,与野生型MEF细胞相比,PBRM1/BAP1缺失的MEF细胞,增殖速度有所减慢;③ PBRM1/BAP1缺失导致小鼠出现多囊肾、肾脏发育混乱、肾脏导管异常变大、肾脏有积液、肾衰等表型。④ VHL/PBRM1/BAP1敲除小鼠肾脏出现多囊肾、结节、非典型增生、部分病灶形成实体瘤;小鼠自发形成的肿瘤病灶,恶性程度高,发现染色体畸形等形态,部分病灶细胞清澈透明类似于典型的人肾透明细胞癌病理学特征;⑤ VHL/PBRM1/BAP1敲除小鼠肾肿瘤分子病理特征:小鼠肾脏结节中细胞增殖活跃Ki67 阳性,肾透明细胞癌标志物CAIX强阳性表达,mTOR信号通路阳性表达,Vimentin阳性、CD10阳性、PAX8阳性,定量qPCR检测表明HIF 信号通路激活,这些分子病理学特征与肾透明细胞癌相似。⑥与以前的研究结果相似,只有VHL与PBRM1/BAP1协同纯合子缺失才能导致肾肿瘤发生,通过动物证明了VHL、PBRM1、BAP1在肾癌中是双打击基因。⑦通过蛋白质谱分析,比较VHL/PBRM1/BAP1敲除小鼠与野生型小鼠肾脏的差异蛋白。1)差异蛋白涉及以下几个大类:钙离子通道、质膜蛋白、细胞结构组成相关蛋白、细胞核相关蛋白、细胞外基质(分泌)蛋白、细胞迁移等相关蛋白。2)差异蛋白涉及的信号通路:细胞合成、脂代谢、氨基酸代谢、器官形成、DNA修复损伤、免疫、细胞膜转运、细胞有丝分裂等。因此,PBRM1/BAP1基因敲除小鼠肾癌疾病模型的建立为肾癌的临床与基础研究提供可靠的动物模型,为全面阐明PBRM1/BAP1双突变肾癌的发病机制、开发有效的药物、探索正确的治疗手段等方面提供理论依据,积累更多更新的资料。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Molecular Characterization and Functional Analysis of Leucine Zipper Transcription Factor Like 1 in Zebrafish (Danio rerio)
斑马鱼 (Danio rerio) 亮氨酸拉链转录因子 Like 1 的分子表征和功能分析
  • DOI:
    10.3389/fphys.2019.00801
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Frontiers in Physiology
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Qun Wei;Yongxia Chen;Yi-Feng Gu;Wenhe Zhao
  • 通讯作者:
    Wenhe Zhao
Salivary microbiome in chronic kidney disease: what is its connection to diabetes, hypertension, and immunity?
慢性肾病中的唾液微生物组:它与糖尿病、高血压和免疫力有何关系?
  • DOI:
    10.1186/s12967-022-03602-5
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Journal of Translational Medicine
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Fengping Liu;Jiayi Sheng;Lei Hu;Bin Zhang;Wei Guo;Yang Wang;Yifeng Gu;Peng Jiang;Hao Lin;Brako Lydia;Yifan Sun;Yifan Tang;Chaoqun Gu;Shichao Wei;Qixiao Zhai;Weiguo Chen;Ninghan Feng
  • 通讯作者:
    Ninghan Feng
Genomic and expression characterization of aquaporin genes from Siniperca chuatsi
鳜鱼水通道蛋白基因的基因组和表达特征
  • DOI:
    10.1016/j.oneear.2020.09.016
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yawei Shen;Huiyang Li;Jinliang Zhao;Shoujie Tang;Yan Zhao;Yifeng Gu;Xiaowu Chen
  • 通讯作者:
    Xiaowu Chen
Female mouse model of diabetes mellitus induced by streptozotocin and high-carbohydrate high-fat diet
链脲佐菌素+高碳水化合物高脂饮食诱导的雌性糖尿病小鼠模型
  • DOI:
    doi10.24425/pjvs.2022.142042
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Polish Journal of Veterinary Sciences
  • 影响因子:
    0.8
  • 作者:
    Rui Guo;J Dong;Deqian Wang;Yifeng Gu
  • 通讯作者:
    Yifeng Gu
Expression profile analyses of mettl8 in Oryzias latipes
野生稻mettl8表达谱分析
  • DOI:
    10.1007/s10695-020-00764-1
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Fish Physiology and Biochemistry
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Wei Pang;Ziwei Zhao;Yawei Shen;Yanhui Bi;Yifeng Gu;Xiaowu Chen
  • 通讯作者:
    Xiaowu Chen

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建立ASPL-TFE3易位肾癌小鼠模型探讨致病机制与治疗策略
  • 批准号:
    82073041
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    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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