椰毒假单胞菌酵米面亚种鉴定、溯源技术和数据库的建立

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30901200
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    22.0万
  • 负责人：
    裴晓燕
  • 依托单位：
    国家食品安全风险评估中心
  • 学科分类：
    H3004.食品卫生
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

椰毒假单胞菌酵米面亚种是我国学者于1977年发现的一种新的细菌性食源性致病菌，该菌引起的食物中毒在我国平均死亡率达41.80%，而在西方发达国家未见报道。目前，对椰毒假单胞菌酵米面亚种的研究至今仍停留在分类学鉴定、生态学分布、细菌和毒素分离鉴定及中毒诊断标准等传统研究阶段，迄今尚未进行全面的系统发育学研究，也没有建立该菌的分子溯源分析方法，更没有建立相应的溯源分析数据库。本项目拟对椰毒假单胞菌酵米面亚种的生物分型、16S rDNA全序列、脉冲场凝胶电泳、荧光标记扩增片段长度多态性和核糖体分型方法及其指纹图谱进行研究，并建立该菌的鉴定、溯源分析数据库。研究结果将为该菌的鉴定、系统分类提供实验数据，为该菌的流行和分布情况进行积极的主动监测和预警，为该菌食物中毒的散发、暴发事件的追踪和溯源等提供技术依据和科学研究资料。

结项摘要

本研究通过API 20NE、VITEK 2、16S rDNA序列分析对椰毒假单胞菌酵米面亚种分离株进行鉴定，在此基础上使用PFGE、FAFLP、核糖体分型对鉴定明确的菌株进行分子分型，结合菌株流行病学资料建立该菌的溯源数据库。.1. 生化鉴定、培养特征及毒性试验.采用API 20NE与VITEK 2进行生化鉴定和生物分型。API 20NE将93.6%的分离株鉴定为唐菖蒲伯克霍尔德氏菌；VITEK 2将80.8%的分离株鉴定为唐菖蒲伯克霍尔德氏菌，16.7%鉴定为洋葱伯克霍尔德氏菌。.对菌株的培养特征和产毒性能进行研究。结果显示银耳液或PD水可保证该菌良好的增殖，并在一定程度上抑制杂菌生长；银耳卵黄琼脂适合对可疑菌株作初步筛选，SS培养基不适合培养特征的描述。对25株分离株进行产毒试验，产毒阳性率较高，与历史数据的比较发现其产毒能力并不恒定，可能与多次传代培养或培养基的改变有关。.2. 16S rDNA序列分析.对78株国内分离株进行16S rDNA序列测定，除2株鉴定为短小芽孢杆菌外，其他76株均鉴定为伯克霍尔德氏菌属，其中74株鉴定为唐菖蒲伯克霍尔德氏菌，2株鉴定为洋葱伯克霍尔德氏菌。根据细菌命名原则，应将该菌分类为唐菖蒲伯克霍尔德氏菌。.3. 分子分型分别选择5种限制性内切酶进行PFGE分析，建立SpeⅠ酶切的PFGE分型方法，对76株分离株及4株参考菌株进行分型。.使用4种低频酶与2种高频酶进行FAFLP分析，根据电泳结果选择限制性制性内切酶组合及选择性碱基，筛选出两种方案，建立FAFLP分型方法，对76株分离株及4株参考菌株进行分型。.使用EcoR I和Pvu II，采用DuPont RiboprinterTM系统进行自动化核糖体分型。Pvu II的分辨率高于EcoR I，但均明显低于PFGE和FAFLP。.本研究建立的PFGE与FAFLP方法对椰毒假单胞菌酵米面亚种均具有较强分型能力，各具优点。自动化核糖体分型操作更为简单快速，但价格较高、分辨率较低。.4. 溯源数据库的建立.利用表型特征、16S rDNA和分子分型技术对椰毒假单胞菌酵米面亚种分离株进行鉴定和分型，采用BioNumerics软件进行分析，结合菌株背景信息，建立比较完整的溯源分析数据库。利用该数据技术基础和不断完善的数据库信息，为该菌食物中毒、常规监测中的追踪和溯源

项目成果

期刊论文数量（3）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
椰毒假单胞菌酵米面亚种荧光标记扩增片段长度多态性分型方法的建立
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国食品卫生杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王岗;郭云昌;杜春明;付萍;李薇薇;赵悦;刘秀梅;杨大进;裴晓燕
  • 通讯作者：
    裴晓燕
椰毒假单胞菌酵米面亚种脉冲场凝胶电泳分型的研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国食品卫生杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    郭云昌;王岗;杜春明;付萍;裴晓燕
  • 通讯作者：
    裴晓燕
米酵菌酸的生物合成及其机制研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    卫生研究
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王岗;郭云昌;裴晓燕
  • 通讯作者：
    裴晓燕

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其他文献

增菌-PCR法与传统方法检测猪肉中单增李斯特菌的比较研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    中国卫生检验杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    郭云昌;裴晓燕;余东敏;杨大进
  • 通讯作者：
    杨大进
应用Taqman实时PCR法检测猪肉中单增李斯特氏菌的研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    卫生研究
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    郭云昌;裴晓燕;余东敏;杨大进
  • 通讯作者：
    杨大进
应用Taqman实时PCR法检测禽肉中沙门菌的研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    中华预防医学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    郭云昌;裴晓燕;余东敏;杨大进
  • 通讯作者：
    杨大进

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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