ACVRL1:一个新的先天性肺静脉异位引流候选基因的识别及鉴定

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81670284
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0203.先天性心脏病
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

As a very rare type of Congenital Heart Defects, the genetic mechanism of Total Anomalous Pulmonary Venous Return (TAPVR) remains unknown. In previous study, we identified a novel non-synonymous mutation (R218W) located at ACVRL1 gene in TAPVR patients by using Exome sequencing. This mutation is thought to be the most deleterious in silico analysis such as SIFT and PolyPhen2. ACVRL1 is a type I cell-surface receptor for the TGF-beta superfamily of ligands and high expresses in highly vascularized tissues such as lung and placenta. Here we propose the hypothesis that the ACVRL1 gene is a potential new pathogenic gene of TAPVR. To verify this hypothesis, we will carried out the following studies including further sequencing the ACVRL1 gene in in Chinese population, comparing the different expression of ACVRL1 gene in TAPVR and normal people and applying transgenic zebrafish experiments. The Sequenom platform experiment, Real time PCR, Western blot, Dual-Luciferase Reporter Assay System and the CRISPR / cas9 technology will be used. This study will elucidate the pathogenesis of TAPVR, and provide new clues for pulmonary vein abnormal development of birth defects.
完全性肺静脉异位引流(TAPVR)是一类罕见而又严重的先天性心脏病,严重威胁婴幼儿的生命,但至今为止对其发病机制仍知之甚少。前期我们利用外显子组测序技术在多名TAPVR患儿中发现了ACVRL1基因新发杂合突变R218W,软件分析该突变严重影响了蛋白功能。ACVRL1基因属于TGF-β信号通路,主要调节血管内皮细胞的增殖和胚胎发育。为此,我们提出假设:ACVRL1基因可能是TAPVR潜在的新的致病基因。为验证这一假说,我们将通过扩大样本验证、比较ACVRL1基因在患儿及正常人表达差异、模式动物斑马鱼实验,采用Sequenom平台分型实验、Real-time PCR、Western Blot、双荧光素酶报告基因和CRISPR/Cas9基因编辑技术等手段,从临床、细胞和模式动物等多方面探讨ACVRL1基因突变在肺静脉异位引流发生中的作用。本研究将为阐明肺静脉发育异常等疾病发生机制提供新的线索。

结项摘要

完全性肺静脉异位引流(TAPVC)是一类罕见而又严重的先心病,目前发病机制仍未清楚,尽管近年来有研究发现一些基因与TAPVC 相关,但缺乏可重复性。课题组前期对多个TAPVC 患儿进行家系外显子组测序研究发现ACVRL1基因新发突变(c.C652T / p.R218W),在父母及正常对照组中均未发现该突变,软件预测该突变明显损害了蛋白功能,STRING基因富集分析提示ACVRL1基因与SMAD9/SMAD1/GATA4等心脏发育因子关联。ACVRL1基因R218W突变的体外功能学研究:利用人肾上皮来源的293T细胞,构建转染野生型及p.R218W突变型载体。Western Blot显示R218W突变体影响了该基因蛋白质表达,突变型的蛋白表达量明显比野生型载体的蛋白表达量少,抑制ACVRL1的蛋白表达。免疫荧光实验显示ACVRL1基因的R218W突变型载体不影响其蛋白定位,与野生型均定位在细胞膜上。双荧光素酶报告基因实验结果显示ACVRL1基因R218W突变型显著抑制了启动子BMP9对ACVRL1基因正常的转录调控作用,下调了该基因的转录活性。利用斑马鱼模式动物进行了ACVRL1基因突变的斑马鱼体内功能试验: 成功构建ACVRL1野生型、R218W突变型载体和相应的斑马鱼模型;斑马鱼胚胎形态学观察及心率分析发现R218W突变型斑马鱼出现心包水肿与心率下降;转录组高通量测序数据分析中,基因功能注释提示ACVRL1基因对细胞发生分化、心脑发育、核糖体组成、转录因子结合等生物过程有影响,表达量分析显示R218W突变型斑马鱼胚胎中ATP2A2、MEF2A等心脏发育相关的重要基因表达明显下降;启动子预测软件显示ATP2A2、MEF2A等可与转录因子SMAD5 结合,而SMAD5是ALK1通路的下游底物,提示ACVRL1基因突变可能通过影响SMAD5调控ATP2A2、MEF2A等心脏发育相关基因来影响心脏发育。本研究为阐明TAPVC的发病机制提供新的线索和理论依据,对筛查肺静脉发育异常等出生缺陷有重要意义,同时将有可能为心脏相关疾病的诊断、治疗和研发新的药物提供新的靶点。课题组后期将进行小鼠模型研究,并继续扩大TAPVC人群进行验证。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(0)
Search of Somatic Mutations of NKX2-5 and GATA4 Genes in Chinese Patients with Sporadic Congenital Heart Disease
中国散发性先天性心脏病患者NKX2-5和GATA4基因体细胞突变的研究
  • DOI:
    10.1007/s00246-018-1955-z
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    PEDIATRIC CARDIOLOGY
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Yin, Jie;Qian, Jianhua;Yang, Shiwei
  • 通讯作者:
    Yang, Shiwei
罕见儿童黏多糖贮积症I型并扩张型心肌病1例并文献复习
  • DOI:
    10.3760/cma.j.issn.2095-428x.2020.01.018
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    中华实用儿科杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张涵;杨世伟;秦玉明
  • 通讯作者:
    秦玉明
Whole-Exome Sequencing Reveals Novel Genetic Variation for Dilated Cardiomyopathy in Pediatric Chinese Patients
全外显子组测序揭示了中国儿科扩张型心肌病的新遗传变异
  • DOI:
    10.1007/s00246-019-02096-1
  • 发表时间:
    2019-04
  • 期刊:
    Pediatric Cardiology
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Dai Genyin;Pu Zhening;Cheng Xueying;Yin Jie;Chen Jun;Xu Ting;Zhang Han;Li Zewei;Chen Xuan;Chen Jinlong;Qin Yuming;Yang Shiwei
  • 通讯作者:
    Yang Shiwei
Whole-exome sequencing identifies SGCD and ACVRL1 mutations associated with total anomalous pulmonary venous return (TAPVR) in Chinese population.
全外显子组测序鉴定出与中国人群肺静脉回流异常 (TAPVR) 相关的 SGCD 和 AVRL1 突变
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.15434
  • 发表时间:
    2017-04-25
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Li J;Yang S;Pu Z;Dai J;Jiang T;Du F;Jiang Z;Cheng Y;Dai G;Wang J;Qi J;Cao L;Cheng X;Ren C;Li X;Qin Y
  • 通讯作者:
    Qin Y
先天性心脏病伴神经发育障碍的临床表现及遗传学研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    中华实用儿科杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    董畅;秦玉明;杨世伟
  • 通讯作者:
    杨世伟

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其他文献

白细胞介素17通过促进上皮间质转化调控胃癌细胞迁移侵袭能力
  • DOI:
    10.3760/cma.j.issn.1673-9752.2015.11.013
  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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芴基苯并噁嗪单体的合成及热性能研究
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨世伟;谷德权;李荣清
  • 通讯作者:
    李荣清
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 作者:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    孟岩;梁改革;高建恩;赵文君;韩浩;杨世伟
  • 通讯作者:
    杨世伟

其他文献

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杨世伟的其他基金

探寻与先天性心脏病相关的心脏发育特异转录因子基因新变异
  • 批准号:
    81000076
  • 批准年份:
    2010
  • 资助金额:
    20.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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