染色体重排断裂点分子作图及孤独症候选易感基因位置克隆的进一步研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30971601
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    35.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1008.儿童和青少年精神行为障碍
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

孤独症倍受关注的原因是发病率高而基本无特异性治疗方法。因此确定孤独症易感基因和发现致病突变是早期诊治该病的有效方法并有助于阐明其分子病理学机制。利用平衡型染色体异常断裂点分子作图克隆多基因病易感基因是独特的定位克隆方法,其原理是染色体断裂可打断基因使其不能表达正常产物或引起表达调控的改变,从而导致疾病的发生。目前我们已收集三例孤独症伴新发生的平衡型染色体异常罕见病例,其重排断裂点与已知孤独症易感基因候选区重叠,现已初步完成重排断裂点定位,将其缩小在153kb-2Mb的染色体区域,并完成候选基因分析。本研究拟进一步开展系统的候选易感基因突变及多态位点的筛查、组织特异表达、外周血表达研究和基于孤独症病例对照的群体资料验证和多态位点关联分析、In Silico易感基因功能学分析及信号传导通路生物信息学分析和蛋白结构和功能预测。本项目的工作将对促进孤独症早期诊断和阐明其分子病理学机制起到积极作用。

结项摘要

在项目执行过程中,我们首先用aCGH分析排除了3例新发平衡型染色体异常伴孤独症/智力低下患者的微缺失、微重复和可变数目重复变异(CNVs),然后应用已建立的FISH-染色体步移技术将6个染色体断裂点区域缩小到30~35kb范围,长片段PCR和PCR产物测序确定了6个染色体断裂点的具体位置及5个重组位点的序列组成。生物信息学分析发现2个染色体断裂分别切断了ZNF407和CHCHD3基因,1个染色体断裂切断了一段未知全序列和功能的mRNA序列。根据确定候选致病基因的原则,我们将这2个基因确定为孤独症/智力低下候选新致病基因。对t(3;18)平衡型染色体异常孤独症/智力低下患者进行ZNF407基因表达研究,发现患者ZNF407基因异构体1的表达量比正常人降低了36%。对105例临床症状与t(3;18)平衡型染色体异常孤独症/智力低下患者相似病例进行ZNF407基因外显子、接头位置及调节序列的PCR及测序,在该基因外显子区共发现2个错义突变和23个多态性位点。通过对9个物种比较,发现ZNE407基因在这2个错义突变位置高度保守,PolyPhen预测这2个错义突变均为有害突变,Jpred3预测这两个位点的突变对于该段多肽链所形成的扩展链(E),α螺旋(H)的数量及分布有一定的影响。依据这些新发现,我们初步确定ZNF407基因为孤独症/智力低下新致病基因,但这些改变对ZNF407基因的功能及与孤独症/智力低下的关系还有待进一步的研究。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

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其他文献

求解非线性互补问题一个新的Jacobian光滑化方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
    计算数学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈争;马昌凤
  • 通讯作者:
    马昌凤
求解非线性互补问题的一个新的光滑牛顿法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    平顶山学院学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈争;马昌凤
  • 通讯作者:
    马昌凤
求解信赖域子问题的一个光滑牛顿法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    福建师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈争;马昌凤
  • 通讯作者:
    马昌凤
忆阻器混沌电路产生的共存吸引子与Hopf分岔
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    计算物理
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王伟;曾以成;陈争;孙睿婷
  • 通讯作者:
    孙睿婷
解无约束优化问题的一个新的带线搜索的信赖域算法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    计算数学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘景辉;马昌凤;陈争
  • 通讯作者:
    陈争

其他文献

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陈争的其他基金

平衡型染色体重排断裂点分子作图及孤独症易感基因位置克隆
  • 批准号:
    30640028
  • 批准年份:
    2006
  • 资助金额:
    10.0 万元
  • 项目类别:
    专项基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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