拟南芥E3泛素连接酶CSM1调控DNA损伤修复的机理

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31800216
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0205.植物与环境互作
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

All organisms evolved with sophisticated DNA damage repair system to maintain genome stability. Posttranslational modifications (such as phosphorylation and ubiquitination) play crucial roles in DNA damage repair. In animals, two E3 ubiquitin ligases RNF8 and RNF168 are required to repair double strand breaks (DSB). However, the homologs of RNF8 and RNF168 or their functional counterparts were not identified in the plants yet. Therefore, the mechanisms of DSB repair in plants need to be further elucidated. Arabidopsis contains an E3 ubiquitin ligase with BRCT and RING motifs, and its biological functions are still unknown. In previous studies, we found that the csm1 mutant was hypersensitive to DSB reagents. We hypothesize that CSM1 has similar functions to RNF8 or RNF168. In this project, we are aiming to identify CSM1 targets and reveal the mechanisms of CSM1 in regulating DNA damage repair. This study will not only help to discover CSM1 as a novel gene in regulating DSB repair, but also help to reveal ubiquitination modification as a new mechanism of DNA damage repair in plants, which is of great scientific significance.
所有生物都进化出精细的DNA损伤修复系统以维持基因组的稳定性。蛋白质翻译后修饰(如磷酸化、泛素化)在DNA损伤修复过程中发挥了极其重要的作用。在动物中,E3泛素连接酶RNF8和RNF168对修复DNA双链断裂是必需的。但是在植物中还没有发现RNF8和RNF168的同源蛋白或类似功能蛋白。因此,植物修复DNA双链断裂的机理有待进一步解析。拟南芥有一个含BRCT和RING结构域的E3泛素连接酶CSM1,其生物学功能尚不清楚。在前期的研究中,我们发现csm1突变体对DNA双链断裂试剂极度敏感。我们推测CSM1具有类似RNF8或RNF168的功能。本项目将鉴定CSM1泛素化的底物,解析CSM1调控DNA损伤修复的分子机理。本项目的开展不仅有助于发现植物调控DNA双链断裂修复的新基因(CSM1),而且有助于揭示植物调控DNA损伤修复的新机制(泛素化修饰),具有重要的科学意义。

结项摘要

所有生物都进化出精细的DNA损伤应答系统以维持基因组的稳定性。蛋白质翻译后修饰(如磷酸化、泛素化)在DNA 损伤应答过程中发挥了极其重要的作用。在动物中,E3泛素连接酶RNF8和RNF168对修复DNA双链断裂(DSBs)是必需的。但是在植物中还没有发现RNF8和RNF168的同源蛋白或类似功能蛋白。因此,植物修复DSBs的机理有待进一步解析。在前期的研究中,我们筛选到拟南芥csm1突变体对DSBs诱导试剂极度敏感。CSM1编码一个含有BRCT和RING结构域的蛋白,其生物学功能尚不清楚,我们推测CSM1具有类似RNF8或RNF168的功能。本项目研究了CSM1的基本功能,鉴定了CSM1泛素化底物,解析了CSM1参与DSBs修复的分子机理。主要结果如下:(1)CSM1对于DSBs修复是必需的;(2)CSM1编码一个植物特有的、细胞核定位蛋白;(3)BRCT和RING结构域对于CSM1的功能都非常重要;(4)CSM1与SOG1相互作用;(5)CSM1泛素化SOG1,SOG1第109位的赖氨酸是最主要的泛素化位点;(6)CSM1稳定SOG1;(7)CSM1对于同源重组(HR)修复是必要的。本项目研究发现,CSM1通过HR途径修复DSBs,是一个新的、植物特有的HR调控蛋白。SOG1也是植物特有的转录因子。因此,CSM1-SOG1调控模块是一个植物特有的HR调控机制。本项目不仅发现了植物调控DSBs修复的新基因,而且表明泛素化修饰调控也是植物DNA损伤应答的重要机制,具有重要的科学意义。植物的HR效率是很低的,提高HR效率是提高植物基因打靶效率的关键。CSM1作为一个新型的HR调控蛋白,有望提高植物HR效率,为建立高效的植物(尤其是作物)基因打靶体系奠定理论基础和提供新的基因资源。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Loss of an ABC transporter in Arabidopsis thaliana confers hypersensitivity to the anti-cancer drug bleomycin
拟南芥中 ABC 转运蛋白的缺失导致对抗癌药物博莱霉素过敏
  • DOI:
    10.1016/j.dnarep.2021.103174
  • 发表时间:
    2021-07-10
  • 期刊:
    DNA REPAIR
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Li, Tong;Xu, Shijun;Wang, Lili
  • 通讯作者:
    Wang, Lili

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其他文献

低温等离子体对不同恶性肿瘤细胞的杀伤作用及其机制研究
  • DOI:
    10.3760/cma.j.issn.0253-3766.2016.10.002
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    中华肿瘤杂志
  • 影响因子:
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  • 作者:
    王利利;秦颂兵;徐晓婷;胡超;钱丹琪;叶超;周菊英
  • 通讯作者:
    周菊英
两种体外培养的树突状细胞负载自噬小体疫苗激活人抗原特异性T细胞活性比较
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    江苏医药
  • 影响因子:
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  • 作者:
    叶伟;王利利;殷丹丹;周镇先;赵伟
  • 通讯作者:
    赵伟
373例食管癌患者三维技术放疗预后分析
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    10.3760/cma.j.issn.0254-5098.2018.03.003
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中华放射医学与防护杂志
  • 影响因子:
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  • 作者:
    于波;汪建林;刘惠兰;戴圣斌;沙莎;王琼;茅卫东;周菊英;王利利;王坚
  • 通讯作者:
    王坚
心肌缺血后静脉注射曲马多对大鼠
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国疼痛医学杂志,2005.11:38-40
  • 影响因子:
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  • 作者:
    王利利;郭 政
  • 通讯作者:
    郭 政
联合嵌入式多标签分类算法
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    自动化学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘慧婷;冷新杨;王利利;赵鹏
  • 通讯作者:
    赵鹏

其他文献

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王利利的其他基金

拟南芥BRCT结构域蛋白SDSB1调控DNA双链断裂修复的机理
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    58 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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