不同衰老型牡丹叶片的比较蛋白质组学研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    U1204307
  • 项目类别:
    联合基金项目
  • 资助金额:
    30.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2103.生命组学技术
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2015-12-31

项目摘要

Peony is a potential candidate of national flower, which is the symbol of wealth and good fortune. This project focuses on the identification of key proteins controlling senescence process of peony leaves by comparing the proteomics of peony leaves from early senescence variety Roufurong and late senescence variety Juanyehong, respectively. The following studies will be carried out: (1) Determining the senescence process of peony leaves by analyzing the ultrastructural, physiological, and biochemical differences between two varieties during natural senescence. (2) Isolating differently expressed proteins by comparing leaf proteomics of two different varieties for total leaf protein, chloroplast protein, and thylakoid membrane protein during the different periods of natural senescence using 2D-DIGE and BN/SDS-PAGE. (3) Identifying the key proteins controlling senescence process of peony leaves by cloning genes coding for differently expressed proteins, detecting genes transcriptional level, and performing bioinformatical analysis. This project will not only contribute to the better understanding of the molecular mechanisms of senescence in peony leaves, but also provide a scientific basis to molecular breeding designed to cultivate strong seedlings and improve flowering quality.
牡丹是待定的国花,是富贵吉祥的象征,本项目以牡丹早衰品种肉芙蓉和晚衰品种卷叶红的叶片为研究对象,通过比较蛋白质组学的方法,鉴定在牡丹叶片自然衰老中发挥关键作用的蛋白。具体研究内容包括:在分析2个品种叶片自然衰老的生理、生化和显微结构差异的基础上,确定衰老的发展进程;通过2D-DIGE、BN/SDS-PAGE等手段,比较2个品种在叶片自然衰老不同时期叶片总蛋白、叶绿体总蛋白、类囊体膜蛋白的表达差异,并对具有重要生理意义的差异蛋白开展基因克隆、转录水平表达、生物信息学分析等的功能研究,明确牡丹叶片中关键的衰老相关蛋白。本项目的研究不仅对理解牡丹叶片衰老的分子机理具有重要的理论意义,而且对牡丹的壮苗培育和开花质量的提高也能提供有价值的信息。

结项摘要

叶片的衰老是一个极为复杂的生理生化过程,本项目以牡丹早衰品种肉芙蓉和晚衰品种卷叶红的叶片为研究对象,进行了叶片衰老的蛋白质组和转录组的有益探索。主要结果如下:(1) 肉芙蓉为叶片早衰型牡丹,卷叶红为晚衰型牡丹,叶片诱导衰老期间测定POD酶活,肉芙蓉酶活从870(U/g.min)降到543(U/g.min),卷叶红酶活从460(U/g.min)升到了1336(U/g.min);进一步测定SOD酶活,肉芙蓉酶活从106(U/g.min)变化到 102(U/g.min);卷叶红酶活从104(U/g.min)降到了53.7(U/g.min),接着又升到了111(U/g.min);另外,测定了衰老期间两品种H2O2含量变化,发现肉芙蓉叶片H2O2从0.56上升到 3.928,即暗诱导衰老期间H2O2显著上升;卷叶红酶活从2.34降到了1.47,上述结果的差异可能和两个品种衰老的特性不同有关。(2)牡丹叶片暗诱导衰老过程中,内肽酶活力在暗诱导72h之前呈上升趋势,在72h之后开始下降,表明内肽酶在牡丹叶片衰老过程中扮演着重要的角色。(3)肉芙蓉和卷叶红叶片衰老过程中蛋白质含量和叶绿素的含量均呈下降趋势,但卷叶红下降慢于肉芙蓉。(4)牡丹衰老过程中叶片的解剖结构显微观察发现,叶片组织结构逐渐疏松,细胞轮廓逐渐模糊,叶片中叶肉细胞内的叶绿体以及气孔保卫细胞中的叶绿体的数量也呈下降趋势,并且部分气孔保卫细胞呈关闭状态。同时发现卷叶红叶片中叶绿体的衰减情况慢于肉芙蓉的叶片。(5)肉芙蓉和卷叶红自然衰老期间牡丹叶片转录组和蛋白质组测序,得到了有效RNA-seq数据共2.09亿条,数据量19.37G,平均长度92.2bp;每个样本测序数据量都在5G以上,满足后续转录组分析需要;蛋白质组iTRAQ测序共获得447192个二级谱图,能匹配到16603个多肽上,鉴定到3755种蛋白。发现了众多衰老差异相关蛋白,主要和活性氧、蛋白质降解、代谢物质运输、植物激素、叶绿素降解、氨基酸转移等途径有关。(6)选取其中差异显著可能起关键作用的衰老相关基因,包括SOD基因、乙烯信号转导中的EIN2及EIN3基因、seed maturation protein基因、线粒体上的NADH还原酶基因、HSP90、HSP17.5、WRKY抗逆转录因子等进行植物转基因功能分析,实验还在进行当中。

项目成果

期刊论文数量(21)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(5)
专利数量(0)
The Phylogenetic Analysis and Identification of a Novel Remorin Member from Rice(Oryza sativa L) by Proteomics under Salt Stress
盐胁迫下水稻Remorin新成员的系统发育和蛋白质组学鉴定
  • DOI:
    10.4028/www.scientific.net/amr.1073-1076.229
  • 发表时间:
    2014-12
  • 期刊:
    Advanced Materials Research
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    冯爱青;张振波;张延召;韩建明
  • 通讯作者:
    韩建明
Identification and Analysis of the Heat Shock Transcriptor PsHsfB1 in Tree peony
牡丹热激转录子PsHsfB1的鉴定与分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Applied Mechanics and Materials
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    程彦伟;押辉远;高凯;韩建明
  • 通讯作者:
    韩建明
油菜素内酯对黄豆种子萌发及下胚轴和胚根生长的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    洛阳师范学院学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    程彦伟;柳家婷;韩建明;杨亚会
  • 通讯作者:
    杨亚会
Transcriptome sequencing of purple petal spot region in tree peony reveals differentially expressed anthocyanin structural genes.
牡丹紫色花瓣斑点区域转录组测序揭示花青素结构基因差异表达
  • DOI:
    10.3389/fpls.2015.00964
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Frontiers in plant science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Zhang Y;Cheng Y;Ya H;Xu S;Han J
  • 通讯作者:
    Han J
盐胁迫下质膜相关蛋白OsREM1的蛋白质组学研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    科学通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    韩建明;李勇慧;王育娜;付霞飞
  • 通讯作者:
    付霞飞

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其他文献

矮牡丹与芍药属其他5个种叶绿体基因组特征的比较
  • DOI:
    10.11707/j.1001-7488.20200409
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    林业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周晓君;张凯;彭正锋;孙姗姗;押辉远;张延召;程彦伟
  • 通讯作者:
    程彦伟

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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