精氨酸磷酸化蛋白及其研究方法

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21778042
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    72.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0707.化学生物学理论、方法与技术
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Reversible phosphorylation is one of the most universal and significant protein post-translational modifications. Though discovered about 20 years earlier than O-phosphorylation, the research about N-phosphorylation of proteins is going on much slowly because of their acid/heat-lability of the N-phospho bond. Till now, a breakthrough came first from histidine phosphorylation proteins, arginine phosphorylation is less well characterized yet. Based on pArg specific polyclonal antibodies produced by our lab, coupling with the stable isotope gamma- [18O4]-ATP technology, in this project, we endeavor to investigate the regulation of expression level of arginine phosphorylation proteins; set up proteomic methodology of arginine phosphorylation proteins; explore the cellular processes involving in arginine phosphorylation proteins. We believe that the implementation of the project will help to establish the critical foundations for further study on the biological functions of this modification.
蛋白质的可逆磷酸化是生物界最普遍、最重要的一种蛋白质翻译后修饰方式。蛋白质的N-磷酸化修饰,虽然比O-磷酸化约早20年被发现,但是其相关研究严重滞后。迄今为止,关于N-磷酸化修饰的相关研究,只有组氨酸磷酸化蛋白的相关研究有所突破。精氨酸磷酸化蛋白(pArg)的研究则进展缓慢。本项目拟在我实验室自主开发的特异性pArg多克隆抗体基础上,针对pArg的酸、热高敏感特性,结合稳定同位素gamma-[18O4]-ATP标记技术,研究细胞中精氨酸磷酸化蛋白质表达水平的调控,建立精氨酸磷酸化蛋白的组学方法,探索真核细胞内精氨酸磷酸化蛋白所参与的细胞过程,为揭示其相关生物功能奠定基础。

结项摘要

蛋白质的可逆磷酸化是生物界最普遍、最重要的一种蛋白质翻译后修饰方式。蛋白质的N-磷酸化修饰,虽然比O-磷酸化约早20年被发现,但是由于其特有的酸、热高敏感性,缺乏相应的研究工具及策略,其相关研究严重滞后。迄今为止,关于N-磷酸化修饰的相关研究,只有组氨酸磷酸化蛋白的相关研究有所突破。精氨酸磷酸化蛋白(pArg)的研究则进展缓慢。通过项目的执行,建立了大规模N-磷酸化修饰蛋白质组学的分析方法,探究了真核细胞中精氨酸磷酸化蛋白的分布及所参与的细胞过程,通过癌症及癌旁组织的N-磷酸化修饰蛋白质组的差异分析,观察到癌症组织中的蛋白质精氨酸N-磷酰化修饰的变化特征;实现了在多肽与CtsR蛋白上定点引入四类pArg类似物的技术路线,这为pArg样品的制备、序列依赖性抗体甚至单克隆抗体的开发提供基础、为研究pArg蛋白功能提供可能;基于N-磷酸化过程的表面增强拉曼光谱技术,建立了高灵敏精氨酸激酶McsB的定量分析方法;利用生物信息学技术,建立Nphos(N-Phosphorylation Modification of Protein)网站,为包括N-磷酰化组氨酸、N-酰化精氨酸、N-磷酰化赖氨酸在内的相关N-磷酸化修饰蛋白的修饰位点的预测提供方法支持。相关研究成果,为精氨酸磷酸化蛋白的结构及功能研究提供了重要的研究方法策略,为相关研究领域的深入推进奠定了基础。

项目成果

期刊论文数量(21)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(2)
Direct synthesis of phosphorotrithioites and phosphorotrithioates from white phosphorus and thiols
白磷和硫醇直接合成三硫代磷酸酯和三硫代磷酸酯
  • DOI:
    10.1039/c9gc04452c
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Green Chemistry
  • 影响因子:
    9.8
  • 作者:
    Huangfu Xinlei;Wang Yueqiao;Lu Guozhang;Cao Yinwei;Tang Guo;Zhao Yufen
  • 通讯作者:
    Zhao Yufen
Cobalt-Catalyzed Oxidative C(sp(3))-H Phosphonylation for alpha-Aminophosphonates via C(sp(3))-H/P(O)-H Coupling
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Journal of Organic Chemistry
  • 影响因子:
    3.6
  • 作者:
    Lin Binzhou;Shi Shanshan;Lin Rongcan;Cui Yiqun;Fang Meijuan;Tang Guo;Zhao Yufen
  • 通讯作者:
    Zhao Yufen
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2018-07
  • 期刊:
    ChemistrySelect
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    Wang Tao;Zhang Pengbo;Hu Gaobo;Gao Yuzhen;Wu Yile;Xu Pengxiang;Liu Yan;Zhao Yufen
  • 通讯作者:
    Zhao Yufen
A plausible model correlates prebiotic peptide synthesis with the primordial genetic code
一个合理的模型将益生元肽合成与原始遗传密码相关联
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Chemical Communications
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Ying Jianxi;Fu Songsen;Li Xin;Feng Liubin;Xu Pengxiang;Liu Yan;Gao Xiang;Zhao Yufen
  • 通讯作者:
    Zhao Yufen
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基于精氨酸 N-磷酸化过程的激酶检测“关闭”SERS 测定
  • DOI:
    10.1016/j.talanta.2018.07.002
  • 发表时间:
    2018-11-01
  • 期刊:
    TALANTA
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Cai, Huahuan;Huang, Biling;Zhao, Yufen
  • 通讯作者:
    Zhao, Yufen

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  • 通讯作者:
    赵玉芬

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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