真核基因转录调控的协同机制研究及理论模型

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    39970184
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    13.0万
  • 负责人：
    王进
  • 依托单位：
    南京大学
  • 学科分类：
    C0504.物理生物学
  • 结题年份：
    2002
  • 批准年份：
    1999
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2000-01-01 至2002-12-31

项目摘要

A simplified biochemical system was set up to study the mechanism of transcriptional synergy from multiple binding sites upstream of genes. A mathematical model was developed and by comparing the model to the transcriptional response from a DNA template sequence bearing repeated upstream binding sites, it was found that the multiple binding sites constitute a precise and efficient switch for the regulatory control of gene transcription. This result led to the analysis on the distribution of transcription regulating sites (TRS) over genomes to figure out how these multiple sites combine together to form a functional switch signal for the transcriptional activation. A statistical model employing nucleotide frequency and TRS distributional frequency over the whole genomes was introduced to measure the enrichment of TRS in different classes of genomic sequences as well as the distribution pattern of TRS over some genomes.
本课题拟以调控蛋白ZEBRA激活EBV病毒溶胞周期的转录为实验体系，系统研究调控蛋白浓度、上游调控蛋白结合位点数目、分布和结合强度等因素对转录的调控作用，创建多位点多级生化反应系统的协同作用模型，描述各种调控因素对系统转录水平的精确调控关系，阐明真核基因转录的调控机理，为探索细胞分化发育等生物学基本问题奠定基础。

结项摘要

项目成果

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  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    唐海燕;刘荣桂;韩豫;王进
  • 通讯作者：
    王进
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特征性 microRNA 表达谱与非洲绿猴自发性高血压相关
  • DOI：
    10.1080/10641963.2018.1469646
  • 发表时间：
    2019-04
  • 期刊：
    Clinical and Experimental Hypertension
  • 影响因子：
    12.3
  • 作者：
    周小军;王进;法云智;叶华虎
  • 通讯作者：
    叶华虎

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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