噬菌体在纳帕海湿地中的时空分布及在有机碳循环中的作用研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31160121
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    50.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0305.群落生态学
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

随着全球工业化的发展,碳平衡已成为必须关注的问题。病毒尤其是噬菌体在维持全球有机碳平衡中具有重要作用,全球26%的可溶性有机碳(DOC)循环是由海洋病毒来完成的。湿地是大陆有机碳的主要储库,纳帕海作为我国独特的低纬度高海拔季节性高原湿地具有很高的研究价值。然而,关于噬菌体在维持该地DOC平衡中作用的研究尚未见报道。本研究拟在不同季节采集纳帕海4种湿地类型的水样、土样,通过表面荧光显微镜、透射电镜测定样品中细菌和噬菌体的丰度;探明噬菌体在该地域的分布状态。同时用放射性示踪等方法测定烈性噬菌体量和活细菌量;化学法测定总DOC含量;所得数据经Binder模型计算后分析噬菌体裂解细菌释放的有机碳在DOC中的比例。研究结果不仅将揭示噬菌体在纳帕海湿地中的时空分布规律,也可阐明噬菌体在维持该地域有机碳平衡中的作用,同时也将为进一步探索噬菌体在整个湿地生态系统中的作用提供理论和实践基础。

结项摘要

噬菌体作为结构最简单生命体,不仅在调节细菌群落结构、遗传物质水平转移方面作用巨大,同时也被证明在生物地球化学循环尤其是碳循环方面具有重要作用,但遗憾的是截至目前关于纳帕海湿地噬菌体、细菌及它们与有机碳研究尚未见报道。因此,针对纳帕海湿地开展噬菌体丰度、生态状况和多样性研究,并探讨它们在该区域碳循环中的作用和功能无疑具有重要科学意义,主要研究结果如下:.1)利用EFM技术检测纳帕海不同季节、不同湿地类型水样中浮游细菌和病毒丰度,从分布上看旱季和雨季浮游细菌丰度平均值分别为3.52×105 /mL和2.02×106 /mL,浮游病毒丰度平均值分别为3.63×106 /mL和3.71×107 /mL,且雨季浮游病毒和细菌丰度显著高于旱季。旱季浮游病毒与细菌的丰度呈显著正相关(P<0.01),而与叶绿素呈弱负相关 (P<0.05);而雨季浮游病毒丰度与浮游细菌丰度(P<0.01)和叶绿素a(Chl-a)(P<0.05)都呈显著正相关。.2)雨季细菌有机碳产出量为8.01 µg C/L•h,旱季为10.3 µg C/L•h,雨季和旱季经由病毒裂解而引起细菌死亡率(FMVL)分别为54.9%和27%。通过Binder模型分析表明纳帕海地区由病毒裂解细菌所贡献的DOC在总有机碳中占主导地位,其贡献率在雨季和旱季分别为84.37%和72.9%。.3)利用较保守的T4类噬菌体g23基因为指针,对该地区T4类噬菌体分布情况进行调查。系统发育分析表明纳帕海高原湿地不仅存在其他生境已分离到的T4噬菌体类群,还存在独有的NPHI和Ⅱ两个新类群。.4)利用分离培养技术从纳帕海湿地分离得到19株可培养低温噬菌体,电镜形态表明分别属于长尾、短尾和肌尾噬菌体科;并对以假单胞、黄杆菌和温和气单胞菌为宿主的3株肌尾科低温噬菌体进行了系统生物学特性研究。.本研究首次从不同角度和尺度,对低纬度、高原低温湿地纳帕海浮游病毒的丰度、生态状况、噬菌体分离进行研究。探索了噬菌体分布及其与DOC的关系,一直到可培养低温噬菌体分离及生物学特性的研究,使得这一独特地理环境的微生物生态研究更加系统,是目前国内外关于低纬度高原低温湿地生态系统中噬菌体从宏观到微观尺度的唯一报道。研究结果不仅使得这一独特地理环境的微生物生态研究更加系统化,也为进一步在该地区开展微生物生态学、生物地球化学及挖掘微生物资源奠定了基础。

项目成果

期刊论文数量(15)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Purification and characterization of an extracellular cold-adapted alkaline lipase produced by psychrotrophic bacterium Yersinia enterocolitica strain KM1
耐冷细菌小肠结肠炎耶尔森菌 KM1 菌株产生的胞外冷适应碱性脂肪酶的纯化和表征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Journal of Basic Microbiology
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Chen; Guiyuan;Zhang; Qi;Lin; Lianbing;Wei; Yunlin
  • 通讯作者:
    Yunlin
噬菌体与宿主菌间的角逐
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    生命的化学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    俞汇颖;张琦;魏云林;季秀玲
  • 通讯作者:
    季秀玲
Gene cloning, sequence analysis and heterologous expression of a novel cold-active lipase from Pseudomonas sp PF16
假单胞菌 PF16 新型冷活性脂肪酶的基因克隆、序列分析和异源表达
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Technology and Health Care
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Li; Shan;Lin; Lianbing;Zhang; Qi;Wei; Yunlin
  • 通讯作者:
    Yunlin
极地和深海环境中低温噬菌体研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    生命科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李明源;季秀玲;魏云林;LI Ming-Yuan;JI Xiu-Ling;WEI Yun-Lin*(Biotechnology Research
  • 通讯作者:
    WEI Yun-Lin*(Biotechnology Research
Isolation and characterization of a novel lytic cold-active bacteriophage VNPH-1 from the Napahai wetland in China
中国纳帕海湿地新型裂解冷活性噬菌体 VNPH-1 的分离和表征
  • DOI:
    10.1007/s13213-014-1018-5
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Annals of Microbiology
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    季秀玲
  • 通讯作者:
    季秀玲

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  • 通讯作者:
    林连兵
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  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    季秀玲
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  • 期刊:
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    --
  • 作者:
    崔自红;季秀玲
  • 通讯作者:
    季秀玲
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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    --
  • 作者:
    李明源;季秀玲;王宝强;张琦;林连兵;张兵;魏云林
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    魏云林
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    应用与环境生物学报
  • 影响因子:
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  • 作者:
    崔锦锦;李凌彦;季秀玲;林连兵;魏云林;张琦
  • 通讯作者:
    张琦

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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