Functional exploration of a deep Mycobacterium tuberculosis phosphoproteome
结核分枝杆菌深层磷酸蛋白质组的功能探索
基本信息
- 批准号:10656957
- 负责人:
- 金额:$ 61.73万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2023
- 资助国家:美国
- 起止时间:2023-02-03 至 2028-01-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:AffectArginineBacillus subtilisBacteriaBiologyChromosomesDNA BindingDataEnvironmentEukaryotaEventFamilyGene ExpressionGenesGenetic TranscriptionGram-Positive BacteriaIndividualMapsMass Spectrum AnalysisMeasuresMediatingModificationMutationMycobacterium tuberculosisOrganismOutputPathogenesisPathway interactionsPhenotypePhosphoric Monoester HydrolasesPhosphorylationPhosphorylation SitePhosphotransferasesPhysiologicalPost-Translational Protein ProcessingProteinsProteolysisRegulationRoleSignal PathwaySignal TransductionSubstrate InteractionSystemTestingTranscriptional RegulationTuberculosisVirulenceVirulence Factorsendopeptidase Clpgain of functionloss of functionmimeticsmutantnovelphosphoproteomicspreservationprotein degradationtranscription factortranscriptomics
项目摘要
ABSTRACT
Phosphosignaling provides the major conduit for bacterial adaptation. The two component systems (TCSs)
have long been viewed as the canonical phosphosignaling systems in bacteria, but increasingly, O-
phosphorylation mediated by Ser/Thr kinases is recognized as a relevant bacterial phosphosignaling
mechanism as well. We now show that in fact, Mycobacterium tuberculosis (Mtb) has an expansive,
distributed, and cooperative O-phosphorylation system of a size and complexity that is typically only associated
with eukaryotes. By using a comprehensive STPK loss- and gain-of-function mutant panel and quantitative
mass spectrometry, we show that >70% of Mtb proteins are phosphorylated on Ser/Thr/Tyr, identify thousands
of individual Ser/Thr kinase substrates, and show that the Ser/Thr kinases collectively control the expression of
~30% of Mtb genes. Here, we will test a new and extensive regulatory connection between the Ser/Thr kinases
and the His kinases of the TCSs and test the role of O-phosphorylation on the regulation of transcription
factors. As a result of our exhaustive analysis of Mtb phosphorylation, we also obtained the first evidence of
Arg phosphorylation in Mtb- the first bacterial Arg phosphoproteome outside of gram-positive bacteria. We will
identify the relevant phosphoenzymes and test the idea that pArg functions as a degradation tag for ClpP-
mediated proteolysis.
抽象的
磷s信号为细菌适应提供了主要的管道。两个组件系统(TCSS)
长期以来,人们一直被视为细菌中的规范磷酸化系统,但越来越多的O-
由Ser/Thr激酶介导的磷酸化被认为是相关的细菌磷酸化。
机制也是如此。我们现在表明,实际上,结核分枝杆菌(MTB)具有广泛的,
分布式和合作O磷酸化系统的大小和复杂性通常仅相关
与真核生物。通过使用全面的STPK损耗和功能获得突变体面板和定量
质谱法,我们表明> 70%的MTB蛋白在Ser/Thr/Tyr上磷酸化,识别数千个
单个Ser/THR激酶底物的底物,并表明Ser/Thr激酶共同控制
MTB基因的〜30%。在这里,我们将测试Ser/Thr激酶之间的新的广泛调节连接
以及他的TCSS的激酶,并测试O磷酸化对转录调节的作用
因素。由于我们对MTB磷酸化的详尽分析,我们还获得了第一个证据
MTB中的ARG磷酸化 - 革兰氏阳性细菌之外的第一个细菌ARG磷酸蛋白酶。我们将
确定相关的磷酸酶,并测试PARG充当降解标签的想法
介导的蛋白水解。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Christoph Grundner其他文献
Christoph Grundner的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('Christoph Grundner', 18)}}的其他基金
Calcium signaling in Mycobacterium tuberculosis
结核分枝杆菌中的钙信号传导
- 批准号:
10726978 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 61.73万 - 项目类别:
Direct activation of TGFbeta by an Mtb virulence factor to suppress CD4 T-cell responses
Mtb 毒力因子直接激活 TGFbeta 以抑制 CD4 T 细胞反应
- 批准号:
10374127 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 61.73万 - 项目类别:
Direct activation of TGFbeta by an Mtb virulence factor to suppress CD4 T-cell responses
Mtb 毒力因子直接激活 TGFbeta 以抑制 CD4 T 细胞反应
- 批准号:
10191677 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 61.73万 - 项目类别:
Functional phosphosignaling in Mtb infection
结核分枝杆菌感染中的功能性磷酸信号传导
- 批准号:
10177868 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 61.73万 - 项目类别:
Functional phosphosignaling in Mtb infection
结核分枝杆菌感染中的功能性磷酸信号传导
- 批准号:
10040388 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 61.73万 - 项目类别:
A chemical proteomics survey of Plasmodium gametocyte development
疟原虫配子细胞发育的化学蛋白质组学调查
- 批准号:
9537357 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 61.73万 - 项目类别:
相似国自然基金
架构蛋白CTCF第567位精氨酸突变导致神经发育障碍的作用机制研究
- 批准号:32300477
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
光触发邻二酮的生物正交合成及其与靶蛋白中精氨酸选择性偶联的生物学应用
- 批准号:22377088
- 批准年份:2023
- 资助金额:50 万元
- 项目类别:面上项目
转录因子BACH1上调精氨酸酶ARG2促进高血压的作用和机制研究
- 批准号:82370434
- 批准年份:2023
- 资助金额:49 万元
- 项目类别:面上项目
下丘脑室旁核精氨酸加压素神经元亚群调控焦虑行为的机制
- 批准号:32371068
- 批准年份:2023
- 资助金额:50 万元
- 项目类别:面上项目
精氨酸甲基转移酶CARM1通过增强非组蛋白质底物TRIM47精氨酸甲基化抑制结直肠癌转移的机制研究
- 批准号:82373038
- 批准年份:2023
- 资助金额:49 万元
- 项目类别:面上项目
相似海外基金
Functional genomics of hypothetical genes in Gram-positive bacteria
革兰氏阳性菌假设基因的功能基因组学
- 批准号:
10790885 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 61.73万 - 项目类别:
Functional Analysis of the Clp Protease Systems in Chlamydial Growth and Differentiation
Clp 蛋白酶系统在衣原体生长和分化中的功能分析
- 批准号:
10501967 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 61.73万 - 项目类别:
Functional Analysis of the Clp Protease Systems in Chlamydial Growth and Differentiation
Clp 蛋白酶系统在衣原体生长和分化中的功能分析
- 批准号:
10654041 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 61.73万 - 项目类别:
Characterization and Inhibition of protein-protein interactions involving Staphylococcus aureus GpsB
金黄色葡萄球菌 GpsB 蛋白-蛋白相互作用的表征和抑制
- 批准号:
10437907 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 61.73万 - 项目类别:
Functional genomics of hypothetical genes in Gram-positive bacteria
革兰氏阳性菌假设基因的功能基因组学
- 批准号:
10463540 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 61.73万 - 项目类别: