Specific protein labeling in cells with engineered BirA
使用工程 BirA 标记细胞中的特定蛋白质
基本信息
- 批准号:7545931
- 负责人:
- 金额:$ 28.3万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2005
- 资助国家:美国
- 起止时间:2005-01-17 至 2009-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
DESCRIPTION (provided by applicant): New methodology is proposed for the in vivo labeling of recombinant proteins with small-molecule probes (e.g., fluorophores, crosslinkers, photo switches, and spin labels). This methodology will employ re-engineered mutants of biotin ligase (BirA), a bacterial enzyme that site-specifically biotinylates a lysine side-chain within a 13-amino acid consensus sequence (the "acceptor peptide"; modified lysine residue shown in blue, below). By altering the biotin binding site of BirA to accommodate a range of biotin analogues and other small molecules, we expect to generate enzymes ("probe ligases") that site-specifically conjugate various probes to recombinant proteins bearing the acceptor peptide. Protein-conjugated biotin analogues beating ketone, azide, or alkyne groups can be bio-orthogonally ligated to appropriately functionalized fluorophores or other biophysical probes via hydrazone formation, Staudinger ligation, and [3+2] Sharpless cycloaddition, respectively.
Specific aims: 1. Development of a probe ligase that works in vitro. 2. Development of a probe ligase that works in living cells. 3. Application of the methodology to identification of protein interaction partners for glutamate receptor.
描述(由申请人提供):提出了针对具有小分子探针的重组蛋白在体内标记的新方法(例如荧光团,交叉链接器,照片开关和自旋标签)。该方法将采用生物素连接酶(BIRA)的重新设计突变体,这是一种细菌酶,该酶在13-氨基酸共有序列中特定于特异性生物素化赖氨酸侧链(“受体肽”;蓝色所示的修饰的赖氨酸残留物,下面显示为蓝色,下面显示)。通过改变BIRA的生物素结合位点以适应一系列生物素类似物和其他小分子,我们希望产生酶(“探针连接酶”),该酶(“探针连接酶”)特定于位点结合了各种探针以重新组合受体肽的蛋白质。蛋白质偶联的生物素类似物可以通过生物直接结合酮,叠氮化物或炔烃组,以适当功能化功能化的荧光团或其他生物物理探针,分别通过氢化援助形成,Staudinger结扎和[3+2] Sharpless Cycloadition。
具体目的:1。在体外工作的探针连接酶的发展。 2。开发在活细胞中起作用的探针连接酶。 3。将方法的应用用于鉴定谷氨酸受体的蛋白质相互作用伙伴。
项目成果
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数据更新时间:2024-06-01
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