STRUCTURAL STUDIES OF RNA FOLDING INTERMEDIATES

RNA折叠中间体的结构研究

基本信息

  • 批准号:
    7601779
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.79万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2007
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2007-04-01 至 2008-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. The subproject and investigator (PI) may have received primary funding from another NIH source, and thus could be represented in other CRISP entries. The institution listed is for the Center, which is not necessarily the institution for the investigator. RNA molecules including ribozymes form another major class of structurally important biomolecules. Identifying the structure and folding mechanisms is critical for understanding their function. The goal of the proposal is to discern the important folding steps by identifying the structure of the folding intermediates. This information will used to further understand the function of this particular RNA, and folding and function of RNA molecules in general. Structural RNAs adopt 3D structures which are essential for their biological function. Predicting the 3D structure from the nucleotide sequence has proven remarkably difficult and remains a central problem in structural biology. The goal of this project is to understand the folding using time-resolved (sec) small-angle X-ray scattering (SAXS) methods. One of the fundamental structural parameters of a macromolecule is its over-all size and shape. SAXS can provide this information and is extremely well-suited for characterizing partially folded, short-lived states. The proposed measurements will be extremely useful in determining the sequence of events and, in particular the role of compaction in the folding process of the S-domain of the P RNA ribozyme. These data will be compared to those obtained using chemical modification and spectroscopy, and will greatly assist model building to produce a movie of the folding process. In particular, we wish to distinguish between four models based upon preliminary structural mapping data . These models have a Rg differing by 1  10 ¿, which is within the expected experimental accuracy.
该副本是使用众多研究子项目之一 由NIH/NCRR资助的中心赠款提供的资源。子弹和 调查员(PI)可能已经从其他NIH来源获得了主要资金, 因此可以在其他清晰的条目中代表。列出的机构是 对于中心,这是调查员的机构。 RNA分子包括核酶,形成了另一类重要的结构重要生物分子。识别结构和折叠机制对于理解其功能至关重要。该建议的目的是通过识别折叠中间体的结构来辨别重要的折叠步骤。该信息将用于进一步了解该特定RNA的功能,以及RNA分子的折叠和功能。 结构RNA采用3D结构,这对于其生物功能至关重要。事实证明,预测核苷酸序列的3D结构非常困难,并且在结构生物学中仍然是一个核心问题。该项目的目的是使用时间分辨(SEC)小角度X射线散射(SAXS)方法来了解折叠。大分子的基本结构参数之一是其大小和形状。 SAXS可以提供​​此信息,非常适合表征部分折叠的短寿命状态。所提出的测量将在确定事件序列,尤其是压实在P RNA核酶S域的折叠过程中的作用非常有用。这些数据将与使用化学修饰和光谱法获得的数据进行比较,并将大大帮助模型构建以制作折叠过程的电影。特别是,我们希望根据初步结构映射数据进行区分四个模型。这些模型的RG分化为1 10?,这在预期的实验精度范围内。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Tobin R Sosnick其他文献

Tobin R Sosnick的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Tobin R Sosnick', 18)}}的其他基金

Studies of the function of membrane and soluble proteins and their biophysical properties.
研究膜和可溶性蛋白质的功能及其生物物理特性。
  • 批准号:
    10552333
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
RIBOZYMES
核酶
  • 批准号:
    8361078
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
SINGLE MOLECULE AND SAXS STUDIES OF EARLY COLLAPSE IN PROTEIN FOLDING
蛋白质折叠早期塌陷的单分子和 SAXS 研究
  • 批准号:
    8361284
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
IMPROVING AUTOMATION AND KINETICS CAPABILITIES AT BIOCAT
提高 BIOCAT 的自动化和动力学能力
  • 批准号:
    8361285
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
CONFORMATIONS OF LIGHT-SENSITIVE PROTEINS
光敏蛋白的构象
  • 批准号:
    8168623
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
EVALUATION OF SPEED-ITFIX PROTEIN-STRUCTURE PREDICTION ALGORITHM FOR LOW HOMOLO
低同源性 Speed-ITFIX 蛋白质结构预测算法的评估
  • 批准号:
    8171939
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
STRUCTURAL BASIS OF RNA THERMOSTABILITY
RNA 热稳定性的结构基础
  • 批准号:
    8168622
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
RIBOZYMES
核酶
  • 批准号:
    8168552
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
CONFORMATIONS OF LIGHT-SENSITIVE PROTEINS
光敏蛋白的构象
  • 批准号:
    7954904
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
Graduate Program in Biophysical Sciences at the University of Chicago
芝加哥大学生物物理科学研究生项目
  • 批准号:
    7643588
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:

相似国自然基金

基于微观仿真的城市交通宏观基本图特性研究
  • 批准号:
    11672289
  • 批准年份:
    2016
  • 资助金额:
    56.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
新医改多重政策实施背景下基本药物可及性评价:指标及方法的建立与实证
  • 批准号:
    71473170
  • 批准年份:
    2014
  • 资助金额:
    63.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
国家基本药物制度对医疗服务利用与药品合理使用的长期影响追踪研究
  • 批准号:
    71273016
  • 批准年份:
    2012
  • 资助金额:
    55.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
组合恒等式的研究
  • 批准号:
    11226295
  • 批准年份:
    2012
  • 资助金额:
    3.0 万元
  • 项目类别:
    数学天元基金项目
Ti-Al合金系的基本原子团序列和亚稳相高温结构材料的设计
  • 批准号:
    50471058
  • 批准年份:
    2004
  • 资助金额:
    25.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

Examining the genetic regulation of A-to-I editing and mediation of Alzheimer's disease
检查 A 到 I 编辑的基因调控和阿尔茨海默氏病的介导
  • 批准号:
    10749631
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
Molecular recognition by ADAR1 of Z-RNA within transcriptomes
ADAR1 对转录组中 Z-RNA 的分子识别
  • 批准号:
    10712207
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
A NOVEL PROCESS SAFEGUARDS GENOME INTEGRITY IN THE MAMMALIAN GERM LINE
保护哺乳动物生殖系基因组完整性的新工艺
  • 批准号:
    10445720
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
Discovery of structural RNAs involved in human health and disease
发现与人类健康和疾病有关的结构RNA
  • 批准号:
    10704745
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
Mapping the sequence landscape of RNA structure, dynamics and protein interactions using high-throughput single-molecule FRET
使用高通量单分子 FRET 绘制 RNA 结构、动力学和蛋白质相互作用的序列图谱
  • 批准号:
    10707257
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 0.79万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了