Stationary phase mutagenesis, a component of cell differentiation

静止期诱变,细胞分化的一个组成部分

基本信息

  • 批准号:
    8689699
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 33.89万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2014
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2014-09-01 至 2018-08-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

DESCRIPTION (provided by applicant): Our knowledge of mutagenic processes in cells experiencing stress or non-replicating conditions is limited and controversial. While it is well established that stressed cells activate mechanisms that increase mutagenesis, it remains unclear how these mechanisms bias mutagenesis towards the formation of beneficial mutations that allow cells to escape stress. One consequence of genome-wide hypermutation is the increased risk of genetic load; the point at which increased mutation render cells non-viable. An interesting idea that addresses this dilemma, and the subject of this research, is that a stressed population of cells reduces the risks associated with hypermutable states by differentiating a subpopulation of cells that promotes genetic diversity. These mechanisms producing this kind of mutations are conserved and inform on novel views on the evolutionary process. These processes are also implicated in the acquisition of antibiotic resistance and bypass of the immune response in pathogenic bacteria. In differentiated animal cells, these processes are both beneficial and detrimental. One, they produce genetic diversity, and two they associate with the development of tumors and degenerative diseases. The overall goal of this application is to gain a better understanding on how a population of stressed cells activates cellular mechanisms that produce genetic diversity. The hypothesis under study is that the development of competence (a.k.a. the K- state) in combination with the process of transcription and the transcription-repair coupling factor (TRCF - this factor biases DNA repair systems towards highly transcribed regions) mediates the formation of a cell subpopulation that promotes mutagenesis in B. subtilis. We test this hypothesis using genetic and genomic approaches that examine the accumulation of mutations in stressed cells that develop into the K-state and compare it to non-K cells. The genetic approach uses constructs that experimentally control the development of the K-state and transcription of a gene marker to measure mutagenesis. The genomic approach examines how natural development of the K-state and transcriptional responses during stress shape genomic mutation. Ultimately, this application examines a novel mutagenic mechanism and how it remodels the genome and promotes evolution in response to stress. The long term human health implications of this project are that it studies potential therapeutic targets for the treatment of degenerative and pathogenic diseases.
描述(由申请人提供):我们对经历应激或非复制条件的细胞诱变过程的了解有限且存在争议。虽然众所周知,应激细胞会激活增加诱变的机制,但仍不清楚这些机制如何使诱变偏向于形成有益突变,从而使细胞逃避应激。全基因组超突变的后果之一是遗传负荷风险增加。突变增加导致细胞无法存活的点。解决这一困境的一个有趣的想法以及本研究的主题是,受压力的细胞群通过分化促进遗传多样性的细胞亚群来降低与超可变状态相关的风险。这些产生这种突变的机制是保守的,并为进化过程提供了新的观点。这些过程还与病原菌产生抗生素耐药性和绕过免疫反应有关。在分化的动物细胞中,这些过程既有益又有害。一是它们产生遗传多样性,二是它们与肿瘤和退行性疾病的发展有关。该应用的总体目标是更好地了解应激细胞群如何激活产生遗传多样性的细胞机制。正在研究的假设是,能力(又名 K 状态)的发展与转录过程和转录修复耦合因子(TRCF - 该因子使 DNA 修复系统偏向于高度转录区域)相结合,介导了促进枯草芽孢杆菌诱变的细胞亚群。我们使用遗传和基因组方法检验了这一假设,这些方法检查发育成 K 状态的应激细胞中突变的积累,并将其与非 K 细胞进行比较。遗传方法使用通过实验控制 K 状态发展和基因标记转录的构建体来测量诱变。基因组方法检查应激过程中 K 状态的自然发展和转录反应如何塑造基因组突变。最终,该应用程序检查了一种新的诱变机制以及它如何重塑基因组并促进进化以应对压力。该项目对人类健康的长期影响是,它研究了治疗退行性疾病和致病性疾病的潜在治疗靶点。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Eduardo A Robleto其他文献

Eduardo A Robleto的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Eduardo A Robleto', 18)}}的其他基金

TRANSCRIPTION ASSOCIATED MUTAGENESIS IN CELLS UNDER CONDITIONS OF ARRESTED GROWT
生长抑制条件下细胞转录相关的诱变
  • 批准号:
    8168232
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 33.89万
  • 项目类别:
TRANSCRIPTION ASSOCIATED MUTAGENESIS IN CELLS UNDER CONDITIONS OF ARRESTED GROWT
生长抑制条件下细胞转录相关的诱变
  • 批准号:
    7959720
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 33.89万
  • 项目类别:
Role of transcription in adaptive mutagenesis
转录在适应性诱变中的作用
  • 批准号:
    7253856
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 33.89万
  • 项目类别:
Developmental Research Project Program
发展研究项目计划
  • 批准号:
    10415129
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 33.89万
  • 项目类别:
Developmental Research Project Program
发展研究项目计划
  • 批准号:
    10600052
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 33.89万
  • 项目类别:
Developmental Research Project Program
发展研究项目计划
  • 批准号:
    10190697
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 33.89万
  • 项目类别:

相似国自然基金

十年禁渔对赤水河底栖动物群落多样性及其维持机制的影响
  • 批准号:
    32301370
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
模拟增温对高寒草甸节肢动物“晨起”时间的影响及其生态学效应
  • 批准号:
    32301391
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
三江源国家公园黄河源园区食草野生动物与放牧家畜冲突的强度、影响及未来情景
  • 批准号:
    42371283
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    46 万元
  • 项目类别:
    面上项目
城市化对土壤动物宿主-寄生虫关系的影响机制研究
  • 批准号:
    32301430
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
大型野生动物对秦岭山地森林林下植物物种组成和多样性的影响及作用机制
  • 批准号:
    32371605
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

Executive functions in urban Hispanic/Latino youth: exposure to mixture of arsenic and pesticides during childhood
城市西班牙裔/拉丁裔青年的执行功能:童年时期接触砷和农药的混合物
  • 批准号:
    10751106
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 33.89万
  • 项目类别:
A HUMAN IPSC-BASED ORGANOID PLATFORM FOR STUDYING MATERNAL HYPERGLYCEMIA-INDUCED CONGENITAL HEART DEFECTS
基于人体 IPSC 的类器官平台,用于研究母亲高血糖引起的先天性心脏缺陷
  • 批准号:
    10752276
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 33.89万
  • 项目类别:
Endothelial Cell Reprogramming in Familial Intracranial Aneurysm
家族性颅内动脉瘤的内皮细胞重编程
  • 批准号:
    10595404
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 33.89万
  • 项目类别:
Research Project 2
研究项目2
  • 批准号:
    10403256
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 33.89万
  • 项目类别:
Dravet Syndrome Anti-Epileptic Control by Targeting GIRK Channels
通过针对 GIRK 通道进行 Dravet 综合征抗癫痫控制
  • 批准号:
    10638439
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 33.89万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了