INVESTIGATING THE ROLE OF RSC4 ACETYLATION

研究 RSC4 乙酰化的作用

基本信息

项目摘要

This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. Primary support for the subproject and the subproject's principal investigator may have been provided by other sources, including other NIH sources. The Total Cost listed for the subproject likely represents the estimated amount of Center infrastructure utilized by the subproject, not direct funding provided by the NCRR grant to the subproject or subproject staff. A complex problem for every eukaryotic organism is how to regulate the process of chromatin remodeling, a critical function to mediate DNA accessibility throughout the genome. Using the UCSF Mass Spec Facility, we have found that Rsc4, an essential sub unit of the RSC remodeling complex, is acetylated, by Gcn5, on K25 at its N-terminus. Purification of RSC under standard growth conditions suggests that most of Rsc4 is acetylated. In vitro comparisons of WT and mutant (K25R) RSC complexes reveal similar capabilities to remodel nucleosomes, bind DNA, and recognize acetylation. Since acetylation does not appear to alter the enzymatic properties of RSC, we are taking several in vivo approaches to understand the biological processes in which acetylation is important and to understand the functional consequences of the acetylation. Specifically, we will use mass spectrometry to identify conditions where acetylation is regulated and, combined with genetic mutations, identify the genes responsible for this regulation. These studies are the first to characterize the function of acetylation in the context of a chromatin remodeling complex.
该子项目是利用资源的众多研究子项目之一 由 NIH/NCRR 资助的中心拨款提供。子项目的主要支持 并且子项目的主要研究者可能是由其他来源提供的, 包括其他 NIH 来源。 子项目可能列出的总成本 代表子项目使用的中心基础设施的估计数量, NCRR 赠款不直接向子项目或子项目工作人员提供资金。 对于每个真核生物来说,一个复杂的问题是如何调节染色质重塑过程,这是介导整个基因组 DNA 可及性的关键功能。使用 UCSF 质谱设施,我们发现 Rsc4(RSC 重塑复合物的重要亚基)被 Gcn5 在其 N 末端的 K25 上乙酰化。 在标准生长条件下纯化 RSC 表明大部分 Rsc4 被乙酰化。 WT 和突变型 (K25R) RSC 复合物的体外比较揭示了重塑核小体、结合 DNA 和识别乙酰化的相似能力。 由于乙酰化似乎不会改变 RSC 的酶性质,因此我们正在采取几种体内方法来了解乙酰化在其中重要的生物过程,并了解乙酰化的功能后果。 具体来说,我们将使用质谱法来识别乙酰化受到调节的条件,并结合基因突变来识别负责这种调节的基因。 这些研究首次描述了染色质重塑复合物中乙酰化功能的特征。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

GEETA J NARLIKAR其他文献

GEETA J NARLIKAR的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('GEETA J NARLIKAR', 18)}}的其他基金

2022 Chromatin Structure and Function GRC and GRS
2022 染色质结构和功能 GRC 和 GRS
  • 批准号:
    10389240
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
ATP-dependent and independent mechanisms of regulating chromatin states
调节染色质状态的 ATP 依赖性和非依赖性机制
  • 批准号:
    10394727
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
ATP-dependent and independent mechanisms of regulating chromatin states
调节染色质状态的 ATP 依赖性和非依赖性机制
  • 批准号:
    10158528
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
ATP-dependent and independent mechanisms of regulating chromatin states
调节染色质状态的 ATP 依赖性和非依赖性机制
  • 批准号:
    10390191
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
ATP-dependent and independent mechanisms of regulating chromatin states
调节染色质状态的 ATP 依赖性和非依赖性机制
  • 批准号:
    10623899
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
ATP-dependent and independent mechanisms of regulating chromatin states
调节染色质状态的 ATP 依赖性和非依赖性机制
  • 批准号:
    9908103
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Mechanistic dissection of HP1 mediated heterochromatin
HP1介导的异染色质的机制剖析
  • 批准号:
    8711780
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Mechanistic dissection of HP1 mediated heterochromatin
HP1介导的异染色质的机制剖析
  • 批准号:
    8831702
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Mechanistic dissection of HP1 mediated heterochromatin
HP1介导的异染色质的机制剖析
  • 批准号:
    9060337
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Mechanistic dissection of HP1 mediated heterochromatin
HP1介导的异染色质的机制剖析
  • 批准号:
    9267993
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:

相似国自然基金

流动乳品体系中嗜热混合菌生物被膜的形成过程及机制研究
  • 批准号:
    32302027
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
生物质/含氮废弃物可控热裂解-定向催化重整过程调控与多还原组分分解炉脱硝机制研究
  • 批准号:
    52372024
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目
玉米秸秆生物炭投加对促进低浓度废水厌氧消化的过程与机理研究
  • 批准号:
    52300035
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
混合营养型原生生物代谢可塑性对气候变暖和水体富营养化的响应过程及机制
  • 批准号:
    32371625
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目
土壤环境中四溴双酚A及其衍生物的微生物转化过程及机制研究
  • 批准号:
    42377386
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    49 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

Gene Modulation of Acetylation Modifiers to Reveal Regulatory Links to Human Cardiac Electromechanics
乙酰化修饰剂的基因调节揭示与人类心脏机电的调节联系
  • 批准号:
    10677295
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
PBRM1 bromodomain missense mutations in ccRCC vascular signaling
ccRCC 血管信号传导中的 PBRM1 溴结构域错义突变
  • 批准号:
    10604440
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
An IGF-1R-targeting peptide drug conjugate for targeted treatment of atypical teratoid/rhabdoid tumors
用于靶向治疗非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤的 IGF-1R 靶向肽药物缀合物
  • 批准号:
    10760549
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Epigenetic mechanisms of disrupted neurodevelopment in Menke-Hennekam syndrome
Menke-Hennekam 综合征神经发育障碍的表观遗传机制
  • 批准号:
    10816703
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Elucidating the epigenetic regulation of extracellular matrix and virus-induced fibroblast activation
阐明细胞外基质和病毒诱导的成纤维细胞活化的表观遗传调控
  • 批准号:
    10572863
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了