High-speed NMR methods for membrane protein analysis
用于膜蛋白分析的高速 NMR 方法
基本信息
- 批准号:8316193
- 负责人:
- 金额:$ 36.77万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2011
- 资助国家:美国
- 起止时间:2011-08-15 至 2015-07-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:AddressAmino AcidsCell-Free SystemCellsChemicalsCysteineDependencyDetectionDetergentsDevelopmentDrug DesignEscherichia coliHumanIn VitroIntegral Membrane ProteinIsotope LabelingLabelMeasuresMembrane ProteinsMethodsMutationProcessPropertyProtein AnalysisRelaxationResearchResolutionSamplingSignal TransductionSiteSpectrum AnalysisSpeedStructureSystembasecombinatorialhigh throughput screeninginnovationnovelprotein structureresearch studytool
项目摘要
DESCRIPTION (provided by applicant): The purpose of the proposed research is to develop a set of NMR strategies for membrane protein structure determination. Combined with our existing E. coli-based cell-free (CF) expression system, these strategies will then be used to solve several structures of human integral membrane proteins (hIMPs). The existing NMR structure determination methods are not effective for membrane proteins because of their intrinsic structural and dynamical properties. The internal mobility of transmembrane (TM) helical bundles causes strong broadening of the signals in NMR spectra and creates problems with signal assignment, spectra analysis, and detection of long-range interactions, which are necessary to build up the structure of the TM 1-helical domain. Therefore, we propose a set of NMR strategies utilizing the CF expression system, which will significantly speed up structure determination of membrane proteins. In particular, we will further develop the combinatorial dual-isotope labeling strategy in order to make the resonance assignment process fast and robust (Aim 1); incorporate unnatural amino acids that can be modified with a paramagnetic label to measure relaxation enhancement and paramagnetic chemical shift effects (Aim 2); implement 13C-methyl and 19F-labeling in the CF system to obtain additional long-range distance constraints for structure determination (Aim 3). These methods will be applied to preselected (Aim4) hIMPs to determine the high resolution NMR structures of 10 or more targets (Aim 5).
描述(由申请人提供):拟议研究的目的是为确定膜蛋白结构的确定制定一组NMR策略。结合我们现有的基于大肠杆菌的细胞(CF)表达系统,这些策略将用于解决人类整合膜蛋白(HISP)的几种结构。现有的NMR结构确定方法对于膜蛋白而言无效,因为它们具有内在的结构和动力学特性。跨膜(TM)螺旋束的内部迁移率会导致NMR光谱中信号的强大扩展,并在信号分配,光谱分析和检测长期相互作用的情况下引起了问题,这对于建立TM 1螺旋域的结构是必不可少的。因此,我们提出了使用CF表达系统的一组NMR策略,该策略将大大加快膜蛋白的结构测定。特别是,我们将进一步制定组合双异位标记策略,以使共振分配过程快速,稳健(AIM 1);掺入不自然的氨基酸,可以用顺磁性标签修饰,以测量弛豫增强和顺磁化学移位效应(AIM 2);在CF系统中实现13C-甲基和19F标记,以获得结构确定的其他远程距离约束(AIM 3)。这些方法将应用于预选的(AIM4)HIMP,以确定10个或更多目标的高分辨率NMR结构(AIM 5)。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
SENYON CHOE其他文献
SENYON CHOE的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('SENYON CHOE', 18)}}的其他基金
Chimeric TGF-beta Ligands for Regenerative Medicine
用于再生医学的嵌合 TGF-β 配体
- 批准号:
9127791 - 财政年份:2015
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
Chimeric TGF-beta Ligands for Regenerative Medicine
用于再生医学的嵌合 TGF-β 配体
- 批准号:
9761830 - 财政年份:2015
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
Structural analysis of alcohol-dependent activation of GIRKs
GIRK 酒精依赖性激活的结构分析
- 批准号:
8693873 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
Structural analysis of alcohol-dependent activation of GIRKs
GIRK 酒精依赖性激活的结构分析
- 批准号:
8516907 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
Structural analysis of alcohol-dependent activation of GIRKs
GIRK 酒精依赖性激活的结构分析
- 批准号:
8299394 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
High-speed NMR methods for membrane protein analysis
用于膜蛋白分析的高速 NMR 方法
- 批准号:
8163237 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
High-speed NMR methods for membrane protein analysis
用于膜蛋白分析的高速 NMR 方法
- 批准号:
8510668 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
High-speed NMR methods for membrane protein analysis
用于膜蛋白分析的高速 NMR 方法
- 批准号:
8705542 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
High-speed NMR methods for membrane protein analysis
用于膜蛋白分析的高速 NMR 方法
- 批准号:
8994602 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
Cell-free expression of human integral membrane proteins for structural studies
用于结构研究的人类整合膜蛋白的无细胞表达
- 批准号:
8312574 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
相似国自然基金
胃肠道微生物宏基因组的氨基酸消旋酶挖掘及分析
- 批准号:32360034
- 批准年份:2023
- 资助金额:32 万元
- 项目类别:地区科学基金项目
甘油制α-氨基酸钌基双金属催化剂的构筑及产物调控策略
- 批准号:22308255
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
射频协同纳他霉素干扰氨基酸转运高效杀灭黑曲霉的分子机制研究
- 批准号:32302279
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
αKG-NHFe酶FtmOx1通过氨基酸多重构象变化催化内过氧化反应的机理研究
- 批准号:22307037
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
18F-TZA分子探针靶向识别胶质瘤IDH1突变及其与氨基酸转运体的关联研究
- 批准号:82302337
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
相似海外基金
Identifying New Astrocytic Kir4.1 Channel Modulators for Treating Huntington's Disease
鉴定用于治疗亨廷顿病的新型星形细胞 Kir4.1 通道调节剂
- 批准号:
10681097 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
Determinants of amino acid transporter oligomerization in membranes
膜中氨基酸转运蛋白寡聚的决定因素
- 批准号:
10725968 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
Understanding the link between FAIM expression and Alzheimer’s disease and related dementias
了解 FAIM 表达与阿尔茨海默病及相关痴呆症之间的联系
- 批准号:
10380077 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
Biological Regulation Studied In Vitro and In Cellulo with Modified Proteins
用修饰蛋白在体外和细胞内研究生物调节
- 批准号:
10613406 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别:
Biological Regulation Studied In Vitro and In Cellulo with Modified Proteins
用修饰蛋白在体外和细胞内研究生物调节
- 批准号:
10164536 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 36.77万 - 项目类别: