Bacteriophage-derived Inhibitors of the Bacterial RNA Polymerase
噬菌体衍生的细菌 RNA 聚合酶抑制剂
基本信息
- 批准号:BB/K000233/1
- 负责人:
- 金额:$ 79.53万
- 依托单位:
- 依托单位国家:英国
- 项目类别:Research Grant
- 财政年份:2012
- 资助国家:英国
- 起止时间:2012 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Many activities that allow organisms to grow, remain alive and viable rely on molecules resembling small machines. In bacteria, the machine which is responsible for accessing information contained in the genes is the RNA polymerase (RNAp), and the process by which the RNAp accesses the information contained in the genes is collectively called gene expression. Therefore, since the RNAp carries out an essential function necessary for the survival of the bacterial cell, the RNAp is also an attractive target for drugs to treat bacterial infections. For instance, the clinically widely used antibiotic rifampicin inhibits the RNAp. However, the frequent emergence of rifampicin-resistant harmful bacteria necessitates research into new compounds to combat bacterial infections by inhibiting the RNAp. Our research focuses on naturally-occurring small proteins which are potent inhibitors of the RNAp and display several of the desirable features for potential development into novel antibiotic-like compounds for inhibiting the RNAp. Here, we will study precisely how three such naturally-occurring RNAp inhibitors, called Gp2, P7 and Gp5.7 inhibit the RNAp from the bacterium Escherichia coli (for Gp2 and Gp5.7) and Xanthomonas orzyae (a bacterial pathogen that causes rice blight). We will employ structural biology to unravel how Gp2, Gp5.7 and P7 look like and interact with the RNAp. We will employ state-of-the art biochemistry and molecular biology to study how Gp2, Gp5.7 and P7 inhibit the RNAp. We will employ a technique called "next-generation sequencing" to study the impact of Gp2 on RNAp activity, i.e. gene expression, at a whole-cell level. In summary, our results will (1) provide novel insights into how the activity of the bacterial RNAp can be controlled, in this case inhibited, by non-bacterial and naturally-occurring factors; (2) establish a solid framework and industrial links for development of novel antibiotic-like lead compounds targeting the bacterial RNAp and (3) provide useful resources for synthetic biology applications.
许多有机体生长、保持活力和活力的活动都依赖于类似小型机器的分子。在细菌中,负责获取基因中信息的机器是RNA聚合酶(RNAp),RNAp获取基因中信息的过程统称为基因表达。因此,由于RNAp执行细菌细胞生存所必需的基本功能,因此RNAp也是治疗细菌感染的药物的有吸引力的靶标。例如,临床上广泛使用的抗生素利福平就抑制RNAp。然而,对利福平耐药的有害细菌的频繁出现使得有必要研究新的化合物,通过抑制 RNAp 来对抗细菌感染。我们的研究重点是天然存在的小蛋白,它们是 RNAp 的有效抑制剂,并显示出一些理想的特征,有可能开发成用于抑制 RNAp 的新型抗生素样化合物。在这里,我们将精确研究三种天然存在的 RNAp 抑制剂(Gp2、P7 和 Gp5.7)如何抑制大肠杆菌(Gp2 和 Gp5.7)和黄单胞菌(一种引起稻瘟病的细菌病原体)的 RNAp )。我们将利用结构生物学来揭示 Gp2、Gp5.7 和 P7 的外观以及与 RNAp 的相互作用。我们将采用最先进的生物化学和分子生物学来研究 Gp2、Gp5.7 和 P7 如何抑制 RNAp。我们将采用一种称为“下一代测序”的技术来研究 Gp2 在全细胞水平上对 RNAp 活性(即基因表达)的影响。总之,我们的结果将(1)提供关于如何通过非细菌和自然发生的因素来控制(在本例中是抑制)细菌 RNAp 活性的新见解; (2) 为开发针对细菌 RNAp 的新型抗生素类先导化合物建立坚实的框架和工业联系;(3) 为合成生物学应用提供有用的资源。
项目成果
期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The sabotage of the bacterial transcription machinery by a small bacteriophage protein.
小噬菌体蛋白对细菌转录机制的破坏。
- DOI:http://dx.10.4161/bact.28520
- 发表时间:2014
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Liu B
- 通讯作者:Liu B
Key roles of the downstream mobile jaw of Escherichia coli RNA polymerase in transcription initiation.
大肠杆菌 RNA 聚合酶下游活动颌在转录起始中的关键作用。
- DOI:http://dx.10.1021/bi301260u
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:2.9
- 作者:Drennan A
- 通讯作者:Drennan A
Phage T7 Gp2 inhibition of Escherichia coli RNA polymerase involves misappropriation of s70 domain 1.1.
噬菌体 T7 Gp2 对大肠杆菌 RNA 聚合酶的抑制涉及盗用 s70 结构域 1.1。
- DOI:http://dx.10.1073/pnas.1314576110
- 发表时间:2013
- 期刊:
- 影响因子:11.1
- 作者:Bae B
- 通讯作者:Bae B
Nitrogen stress response and stringent response are coupled in Escherichia coli.
大肠杆菌中的氮胁迫反应和严格反应是耦合的。
- DOI:http://dx.10.1038/ncomms5115
- 发表时间:2014
- 期刊:
- 影响因子:16.6
- 作者:Brown DR
- 通讯作者:Brown DR
The Xp10 Bacteriophage Protein P7 Inhibits Transcription by the Major and Major Variant Forms of the Host RNA Polymerase via a Common Mechanism.
Xp10 噬菌体蛋白 P7 通过共同机制抑制宿主 RNA 聚合酶的主要和主要变体形式的转录。
- DOI:http://dx.10.1016/j.jmb.2016.08.004
- 发表时间:2016
- 期刊:
- 影响因子:5.6
- 作者:Brown DR
- 通讯作者:Brown DR
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Sivaramesh Wigneshweraraj其他文献
A Rapid Colorimetric Method to Visualize Protein Interactions
一种可视化蛋白质相互作用的快速比色方法
- DOI:
10.1002 - 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Xiufeng Zhang;Bing Liu;Zhihao Wang;Ling Lan;Qianfan Yang;Peipei Zhang;Lei Shi;Yunhe Lang;Aline Tabib-Salazar;Sivaramesh Wigneshweraraj;Jiye Zhang;Yawen Wang;Yalin Tang;Steve Matthews - 通讯作者:
Steve Matthews
Sivaramesh Wigneshweraraj的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('Sivaramesh Wigneshweraraj', 18)}}的其他基金
Characterisation of a novel bacterial ribonucleoprotein complex analogous to eukaryotic processing (P) bodies in Escherichia coli
类似于大肠杆菌中的真核加工 (P) 体的新型细菌核糖核蛋白复合物的表征
- 批准号:
BB/V000284/1 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 79.53万 - 项目类别:
Research Grant
Transcriptional Regulation of a major virulence operon in Staphylococcus aureus: Insights from biochemcial genomic and proteomic studies
金黄色葡萄球菌主要毒力操纵子的转录调控:生化基因组和蛋白质组学研究的见解
- 批准号:
BB/I001492/1 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 79.53万 - 项目类别:
Research Grant
Mechanism of action of small-molecule inhibitors of bacterial gene transcription.
细菌基因转录小分子抑制剂的作用机制。
- 批准号:
BB/E023703/1 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 79.53万 - 项目类别:
Fellowship
相似国自然基金
THZ1及其氟化衍生物THZ1-F对结肠癌的抗癌机制研究及其在克服结肠癌对EGFR抑制剂西妥昔单抗及帕尼单抗耐药性方面的作用探索
- 批准号:81902426
- 批准年份:2019
- 资助金额:20.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
2,7-萘啶酮类天然产物NPD01及其结构衍生物的全合成和生物活性研究
- 批准号:81903515
- 批准年份:2019
- 资助金额:21.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
新型STAT3抑制剂的设计、合成与优化及其抗胰腺癌活性研究
- 批准号:81903431
- 批准年份:2019
- 资助金额:20.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
基于Aplysiatoxin衍生物的钾离子通道Kv1.5抑制剂的发现及作用机制研究
- 批准号:81973233
- 批准年份:2019
- 资助金额:55 万元
- 项目类别:面上项目
特异性识别磷酸二酯酶PDE8的黄嘌呤类衍生物:设计、抗血管性痴呆活性及作用机制研究
- 批准号:21877134
- 批准年份:2018
- 资助金额:67.5 万元
- 项目类别:面上项目
相似海外基金
Activity and therapeutic antagonism of the TP receptor in cardiomyopathy of muscular dystrophy
TP受体在肌营养不良性心肌病中的活性和治疗拮抗作用
- 批准号:
10736005 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 79.53万 - 项目类别:
Project 3: Credentialing CDK 4/6 inhibitors used with radiation as an effective treatment strategy in locally advanced ER+ and TNBC
项目 3:认证 CDK 4/6 抑制剂与放射结合使用作为局部晚期 ER 和 TNBC 的有效治疗策略
- 批准号:
10554474 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 79.53万 - 项目类别:
Targeting BACE1 for the prevention and treatment of Brain metastases
靶向 BACE1 预防和治疗脑转移
- 批准号:
494957 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 79.53万 - 项目类别:
Operating Grants
Developing novel LOX inhibitors to target chemotherapy resistant TNBC
开发新型 LOX 抑制剂以靶向化疗耐药的 TNBC
- 批准号:
10696810 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 79.53万 - 项目类别:
Noninvasive monitoring of therapeutic response to immune checkpoint inhibitors using circulating exosomes in non-small cell lung cancer
使用循环外泌体对非小细胞肺癌中免疫检查点抑制剂的治疗反应进行无创监测
- 批准号:
10727974 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 79.53万 - 项目类别: