FAMILY BASED TESTS OF ASSOCIATION FOR COMPLEX DISEASES

复杂疾病协会基于家庭的测试

基本信息

  • 批准号:
    2891153
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 34.76万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    1998
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    1998-09-30 至 2001-05-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

The long-term objective of this proposal is to enable the discovery of genes underlying complex traits using family based association tests that detect linkage disequilibrium while protecting against spurious evidence of association due to population admixture. To achieve this, specific aims of this project are to: (i) develop computer program that implements family based association tests with arbitrary nuclear family structure including those with missing parental information; that can incorporate environmental covariates and multiple genes into the model; that can test for gene-gene and gene-environment interactions; and that may be applied to dichotomous, quantitative, and time-of-onset phenotypes; (ii) develop a simple and flexible use interface to the program and easy installation procedures, and make the program widely available via ftp; (iii) test the statistical properties of the methodology in simulations and in real data, and use the test results to develop guidelines for the use of the program; (iv) develop an online help system and well-indexed user's manual; provide user support for the program; and develop comprehensive documentation of the statistical procedures; and (v) to extend the methodology to handle pedigrees of arbitrary structure including families with missing founder information. The resulting methodology will be able to test candidate genes, to test for linkage in the presence of association, and to test for association in homogeneous populations where linkage has been established (fine mapping). The investigators also indicate that the new computer software will fill gaps in family based association tests, specifically in cases with arbitrary pedigrees missing parental information, multiple genes, covariates, gene-gene and gene-environment interactions, and survival end-points.
该提议的长期目标是使发现 使用基于家庭的关联测试的复杂性状的基因 在保护伪造的同时,检测到连锁不平衡 由于人口混合而导致的关联证据。 为此, 该项目的具体目的是:(i)开发计算机程序 与任意核心家庭实施基于家庭的关联测试 结构包括那些缺少父母信息的结构;那可以 将环境协变量和多个基因纳入模型; 可以测试基因基因和基因环境相互作用;那 可以应用于二分法,定量和发作时间 表型; (ii)将简单灵活的使用接口开发到 程序和简单的安装程序,并广泛地进行程序 可通过FTP获得; (iii)测试 模拟和实际数据中的方法论,并使用测试结果 制定使用该计划的准则; (iv)开发在线 帮助系统和良好的用户手册;提供用户支持 程序;并制定统计的全面文档 程序; (v)扩展方法来处理 任意结构,包括具有缺失创始人信息的家庭。 最终的方法将能够测试候选基因,以测试 在建立关联的情况下进行连接,并测试关联 在建立联系的同质人群中(罚款 映射)。 调查人员还指出了新计算机 软件将填补基于家庭关联测试的空白,特别是 如果有任意的血统书缺失父母信息,则多个 基因,协变量,基因基因和基因环境相互作用,以及 生存终点。

项目成果

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