Discovering novel genetic alterations in highly complicated genetic regions of pediatric brain tumors

在儿科脑肿瘤高度复杂的遗传区域中发现新的遗传改变

• 批准号: 22K19591
• 负责人: 鈴木 啓道
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: National Cancer Center Japan
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19591/
• 关键词: 脳腫瘍; 遺伝子変異; 全ゲノムシークエンス; 変異解析

本研究課題では、解析が十分に行われていない繰り返し領域や相同性の高い領域を解析する手法を確立し、ドライバー遺伝子異常が未だ同定されていない小児悪性脳腫瘍を解析対象とし、原因遺伝子変異を同定することを目的として研究を進めている。Group 4髄芽腫において、新規の遺伝子異常を同定した。Group 4髄芽腫は発達段階にある胎児脳の菱脳唇脳室下帯に存在する神経前駆細胞が起源細胞と考えられ、CBFA2T2・CBFA2T3・PRDM6・KDM6Aを含んだCBFA複合体に異常が生じることで発生していることを明らかにした。CBFA複合体に異常が生じることで、神経前駆細胞は正常な分化が阻害され、正常な神経細胞に分化できなくなる。神経前駆細胞は出生時には神経に分化して消失していなければならないが、分化異常のため出生後も遺残することにより髄芽腫の発生母地となることを明らかにした。解析困難領域の解析手法を整えており、寛容なマッピングを用いた解析困難領域の解析を対象疾患計501例に対して行った。さらに精度をあげるために、フィルタリングの改良などを行う予定である。また、ショートタンデムリピートの解析も進んでおり、対象疾患約400例の解析に対して解析を行った。現在のところ、疾患特異的である有意な異常伸長は同定されていない。引き続き解析を進めていく。また、既知のショートタンデムリピートとトランスポソンによる転移因子を解析するアルゴリズムの導入を行い、今後解析を進めていく。

在本研究项目中，我们将建立一种方法来分析尚未充分分析的重复区域和高度同源区域，并对尚未确定驱动基因异常的儿童恶性脑肿瘤进行分析，并确定致病基因突变。正在进行中，目的是识别它。我们在第 4 组髓母细胞瘤中发现了一种新的遗传异常。第 4 组髓母细胞瘤被认为起源于发育中胎儿大脑菱形脑室下区中存在的神经祖细胞，并且包含 CBFA2T2、CBFA2T3、PRDM6 和 KDM6A 的 CBFA 复合体中出现异常，这一点已明确。 CBFA复合体的异常会抑制神经祖细胞的正常分化，使其无法分化为正常神经细胞。神经祖细胞必须分化为神经元并在出生时消失，但由于分化异常，它们在出生后仍然存在，成为髓母细胞瘤的滋生地。我们准备了难分析区域的分析方法，并对总共501名目标疾病患者使用许可映射进行了难分析区域的分析。为了进一步提高准确性，我们计划改进过滤。此外，短串联重复序列的分析正在进行中，并对大约400例目标疾病进行了分析。迄今为止，尚未发现疾病特异性的显着异常生长。我们将继续分析。此外，我们将引入一种算法来分析由于已知的短串联重复和转座子而产生的转座元件，并将在将来继续进行分析。

项目成果

髄芽腫における新規遺伝子変異と起源細胞の同定

髓母细胞瘤中新型基因突变和细胞起源的鉴定

• 发表时间: 2022
• 作者: Hiromichi Suzuki

全ゲノムシークエンスによるIDH変異型diffuse gliomaの変異・構造異常解析

使用全基因组测序分析 IDH 突变弥漫性神经胶质瘤的突变和结构异常

• 发表时间: 2022
• 作者: 舟越勇介;中島拓真;畝田篤仁;南部翔平;田中將太;石田穣治;齋藤竜太;花谷亮典;吉本幸司;成田善孝;鈴木啓道
• 通讯作者: 鈴木啓道

Whole-genome sequencing and comprehensive molecular profiling of Astrocytoma, IDH-mutant

IDH 突变型星形细胞瘤的全基因组测序和全面分子分析

• 发表时间: 2022
• 作者: Yusuke Funakoshi; Takuma Nakashima; Shohei Nambu; Atsuhito Uneda; Kotoe Katayama; Seiya Imoto; Ryosuke Hanaya; Shota Tanaka;Ryuta Saito; Koji Yoshimoto; Yoshitaka Narita; Hiromichi Suzuki
• 通讯作者: Hiromichi Suzuki

Recent advances in the molecular understanding of medulloblastoma

髓母细胞瘤分子认识的最新进展

• DOI: 10.1111/cas.15691
• 发表时间: 2023-03
• 影响因子: 5.7
• 作者: Funakoshi Y;Sugihara Y;Uneda A;Nakashima T;Suzuki H
• 通讯作者: Suzuki H

バイオインフォマティクスを用いて脳腫瘍に挑むBioinformatics: indispensable for the latest brain tumor research

生物信息学：最新脑肿瘤研究不可或缺

• 发表时间: 2022
• 作者: Hiromichi Suzuki