アピコンプレクサ門原虫が持つ退化葉緑体の比較プロテオミクスによる普遍的機能の解明

通过顶复门原生动物退化叶绿体的比较蛋白质组学阐明通用功能

基本信息

批准号：
21KK0285
负责人：
坂本寛和
金额：
$ 7.9万
依托单位：
Chiba University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (A))
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022 至 2023
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21KK0285/
关键词：
細胞内共生葉緑体アピコンプレクサパーキンサス

项目摘要

マラリア原虫に代表されるアピコンプレクサ門原虫は葉緑体起源のオルガネラ（以降’原虫葉緑体’）をもつ。光合成能力を喪失した原虫葉緑体は、無用の長物に思えるが原虫の生存に必須であり、原虫葉緑体の生理学的意義や普遍的機能は完全には理解されていない。本研究では、原虫葉緑体の独自ゲノムすらも喪失した最も退化した葉緑体をもつパーキンサスに着目し、その葉緑体に残された機能を解析することで原虫葉緑体における最小限の機能の理解を目指す。本発展研究では、近位依存性ビオチン標識法によって初めてマラリア原虫葉緑体のプロテオームの解析に成功したスタンフォード大学Yeh博士の研究室の滞在し、Yeh博士らの経験を踏まえつつ、コントロール細胞や細胞可溶化法などについて議論しながらパーキンサスの原虫葉緑体プロテオーム解析を実施する。本研究は、令和５年３月に交付内定をいただき、令和４年度の１ヶ月の研究実施期間に、滞在先である米国スタンフォード大学Yeh博士および大学オフィスとの査証発行手続きを開始した。並行して、滞在中の具体的な研究実施計画に関する打ち合わせを実施した。渡米中に所属研究室で実施する基課題の進捗管理、指導学生らの指導方法など、研究代表者が不在中の研究室運営や代替人員の補充などに関する打ち合わせを所属研究室スタッフらと実施した。その他、渡航中の滞在先の確保など、渡航や滞在に関する情報収集や手続きを行い、滞在先での研究活動の基盤作りの準備を整えた。

以疟原虫为代表的顶复门原生动物具有源自叶绿体的细胞器(下文中称为“原生动物叶绿体”)。失去光合能力的原生动物叶绿体看似毫无用处，但它们对于原生动物的生存至关重要，而原生动物叶绿体的生理意义和普遍功能尚未完全了解。在本研究中，我们以叶绿体最退化、甚至失去了原生动物叶绿体特有的基因组的Perkinsus为对象，分析了原生动物叶绿体的剩余功能，以了解其功能。在这项高级研究中，我们将留在斯坦福大学叶博士的实验室，他是第一个使用近端依赖性生物素标记方法成功分析疟原虫叶绿体蛋白质组的人，同时讨论增溶方法等。将分析 Perkinsus 原生动物叶绿体蛋白质组。我们于2020年3月收到了这项研究的初步offer，在2020年为期一个月的研究实施期间，我们开始与我们将要居住的美国斯坦福大学的叶博士以及该大学办理签证签发手续办公室。同时，我们还召开了会议，讨论了在留期间的具体研究实施计划。访美期间，我与所属实验室工作人员召开会议，讨论所属实验室重点项目进展管理、学生教学方法、首席研究员不在期间实验室管理等事宜、招募替补人员等。此外，我们还收集了信息，并办理了旅行住宿等相关手续，为目的地的研究活动奠定了基础。