Methodische Beiträge zur Schätzung genomischer Werte unter Berücksichtigung von Interaktionseffekten am Beispiel des Milchrindes

以奶牛为例，考虑到相互作用效应，对基因组值估计的方法学贡献

• 批准号: 97707656
• 负责人: Professor Dr. Jörn Bennewitz
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Tierzucht und Tierhaltung
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2008-12-31 至 2013-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/97707656?language=en
• 关键词: Methodische; Beitr; ge; zur; Sch

In diesem Forschungsvorhaben sollen methodische Beiträge zur Schätzung genomischer Werte unter Berücksichtigung von Interaktionseffekten und unter der Verwendung von genomweiten und massiven SNP-Markerdaten am Beispiel des Milchrindes erarbeitet werden (genomic selection). Als Interaktionseffekte sollen zum einen dominante und epistatische Genwirkungen betrachtet werden. Die Trennung von additiven und dominanten bzw. epistatischen Genwirkungen erhöht die Sicherheit der Zuchtwertschätzung und ermöglicht die Ausnutzung der nicht-additiven Genwirkungen bei der gezielten Anpaarung von Tieren. Methodisch sollen sowohl Bayes-Verfahren als auch nichtparametrische Regressionen erarbeitet und mittels stochastischer Simulationen sowie an realen Datensätzen (ca. 500 genomweit SNP-genotypisierte und phänotypisierte Milchkühe) validiert werden. Des Weiteren sollen Gen x Umweltinteraktionen berücksichtigt werden. Diese Interaktionseffekte sollen zunächst an einem bestehenden Design zur QTL-Kartierung quantifiziert und anschließend durch die Verknüpfung der oben genannten Verfahren mit Reaktionsnorm-Modellen bei der genomischen Zuchtwertschätzung berücksichtigt werden. Die Modelle sollen an einem realen Datensatz (ca. 500 genomweit SNP-genotypisierte und nachkommengeprüfte Vererber) validiert werden.

Interaktionseffekten und unter Verwendung von genomweiten und Massn SNP-Markerdaten am Beispiel des Milchrindes Erarbeitet werden（基因组选择）。 zum einendominanteandepistatischeGenwirkungenbetrachtetwerden.DieTrnnungvonadditionnanddominantenbzw。 Methodisch sowohl Bayes-Verfahren 也有效 Des Weiteren sollen Gen x。基因组反应规范模型Zuchtwertschätzung berücksichtigt werden. Die Modelle sollen an einem realen Datensatz (ca.