Construction of the chromosome map of hamster and Suncus by FISH using human and mouse cDNA clones
使用人和小鼠 cDNA 克隆通过 FISH 构建仓鼠和 Suncus 染色体图谱
基本信息
- 批准号:09680829
- 负责人:
- 金额:$ 2.3万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:1997
- 资助国家:日本
- 起止时间:1997 至 1998
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
The construction of comparative chromosome map is one of useful approaches for identifiing chromosome rearrangements and chromosomal homology between different animal species.In this study, we constructed comparative maps of Syrian hamster and Chinese hamster to mouse and rat by the direct R-banding fluorescence in situ hybridization (FISH) using mouse and rat cDNA clones. We identified twenty-six and thirteen chromosomal regions with conserved linkage homology to mouse in Syrian and Chinese hamsters, respectively. In comparison between mouse-rat and mouse-Syrian hamster comparative chromosome maps, our results indicated a possibility that there are more chromosome rearrangements between mouse and Syrian hamster chromosomes than between mouse and rat chromosomes.To estimate the process of X chromosome rearrangements in Rodentia animals, we constructed cytogenetic maps of mouse (M.m. domesticus), rat, Syrian hamster, Chinese hamster and Indian spiny mouse (M.platythrix) X chromosomes with twenty-six functional genes, which have been mapped on human X chromosome. The comparison of the gene orders indicated the presence of four chromosome segments with conserved linkage homology between mouse and rat X chromosomes. However, the gene orders were the same among rat, Syrian hamster, Chinese hamster and Indian spiny mouse X chromosomes with the exception of two genes. The gene orders in these species were similar to that of human X chromosome. These results suggested that numerous X chromosome rearrangements accumulated in mouse, and that Indian spiny mouse X chromosome is closely related to the ancestral mammalian X chromosome. We found several chromosome segments with different gene orders in Suncus murinus compared with mouse and human X chromosomes.
比较染色体图谱的构建是鉴定不同动物物种之间染色体重排和染色体同源性的有用方法之一。在本研究中,我们通过直接R带荧光原位构建了叙利亚仓鼠和中国仓鼠与小鼠和大鼠的比较图谱使用小鼠和大鼠 cDNA 克隆进行杂交 (FISH)。我们在叙利亚仓鼠和中国仓鼠中分别鉴定了 26 个和 13 个与小鼠具有保守连锁同源性的染色体区域。通过比较小鼠-大鼠和小鼠-叙利亚仓鼠的比较染色体图谱,我们的结果表明,小鼠和叙利亚仓鼠染色体之间的染色体重排可能比小鼠和大鼠染色体之间的染色体重排更多。 估计啮齿类动物中 X 染色体重排的过程,我们构建了小鼠(M.m. Domesticus)、大鼠、叙利亚仓鼠、中国仓鼠和印度刺鼠(M.platythrix)X染色体的细胞遗传学图谱,其中有26条功能性染色体基因,已被定位在人类X染色体上。基因顺序的比较表明小鼠和大鼠 X 染色体之间存在四个具有保守连锁同源性的染色体片段。然而,除了两个基因外,大鼠、叙利亚仓鼠、中国仓鼠和印度刺鼠X染色体的基因顺序是相同的。这些物种的基因顺序与人类 X 染色体相似。这些结果表明,小鼠体内积累了大量的X染色体重排,并且印度刺鼠的X染色体与祖先哺乳动物的X染色体密切相关。与小鼠和人类 X 染色体相比,我们在 Suncus murinus 中发现了几个具有不同基因顺序的染色体片段。
项目成果
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科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Saito, T.,Matsuda, Y., Suzuki, T.et al.: "Comparative gene mapping of the human and mouse TEP1 genes, which encode one protein component of telomerase." Genomics. 46. 46-50 (1997)
Saito, T.、Matsuda, Y.、Suzuki, T.等人:“人类和小鼠 TEP1 基因的比较基因图谱,该基因编码端粒酶的一种蛋白质成分。”
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Yan, J.: "Identification of mouse ULK1, a novel protein kinase structurally related to C.elegans UNC-51." Biochem.Biophys.Res.Com.246. 222-227 (1998)
Yan, J.:“小鼠 ULK1 的鉴定,一种与线虫 UNC-51 结构相关的新型蛋白激酶。”
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- 影响因子:0
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Matsushima,Y.et al.: "Cloning and genomic mapping of matrin 3 gene and its pseudogene." Cytogenetics Cell Genetics. 81. 194-198 (1998)
Matsushima,Y.et al.:“matrin 3 基因及其假基因的克隆和基因组作图”。
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- 通讯作者:
Kuroiwa, A.: "Association of tyrosine phosphatase SHP-1 and SHP-2, and inositol 5-phoshatase SHIP with gp49B1, and chromosomal assignment of the gene." J.Biol.Chem.273. 1070-1074 (1998)
Kuroiwa, A.:“酪氨酸磷酸酶 SHP-1 和 SHP-2 以及肌醇 5-磷酸酶 SHIP 与 gp49B1 的关联,以及该基因的染色体分配。”
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Meno, C.: "Two closely-related left-right asymmetrically exoressed genes, lefty-1 and lefty-2 : their distinct expression domains, chromosomal linkage and direct neuralizing activity in Xenopus embryos." Genes to Cell.3. 513-524 (1997)
Meno, C.:“两个密切相关的左右不对称外显基因,lefty-1 和 lefty-2:它们在非洲爪蟾胚胎中的独特表达域、染色体连锁和直接神经化活性。”
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