Glycoproteomic identification of carbohydrate targeting lung cancer biomarkers

靶向肺癌生物标志物的碳水化合物的糖蛋白组学鉴定

• 批准号: 22680064
• 负责人: UEDA Koji
• 金额: $ 15.23万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22680064/
• 关键词: 腫瘍マーカー; プロテオミクス; 糖鎖; 肺癌; 質量分析; 血清; バイオマーカー; レクチン; 診断; グライコプロテオミクス; LC/MS/MS; 血漿

To develop novel carbohydrate-targeting biomarkers for early detection of lung cancer, glycoproteomic profiling of 144 serum samples was conducted. We further established a mass spectrometric quantification method for glycan structure alterations, named Energy resolved oxonium ion monitoring (Erexim) technology, in order for large-scaled validation study of 16 identified lung cancer biomarker candidates. The Erexim-based validation experiment using 87 independent serum samples revealed that frequency of alpha-1, 6 fucosylation on CD163-Asn105, Asn140, and Asn1027 was significantly up-regulated in even stage-I or II lung adenocarcinoma patients compared to normal control group. The Erexim technology was patented in US (US 8653448, 18.Feb.2014) and already utilized in various areas, such as chemistry, manufacturing and control (CMC) of biologics.

为了开发用于肺癌早期检测的新型碳水化合物靶向生物标志物，对 144 份血清样本进行了糖蛋白组学分析。我们进一步建立了一种聚糖结构改变的质谱定量方法，称为能量解析氧鎓离子监测（Erexim）技术，以便对16种已确定的肺癌生物标志物候选物进行大规模验证研究。使用 87 个独立血清样本进行的基于 Erexim 的验证实验表明，与正常对照组相比，即使在 I 期或 II 期肺腺癌患者中，CD163-Asn105、Asn140 和 Asn1027 上的 α-1、6 岩藻糖基化频率也显着上调。 Erexim 技术已在美国获得专利（US 8653448，2014 年 2 月 18 日），并已应用于多个领域，例如生物制剂的化学、制造和控制 (CMC)。

项目成果

Histone lysine methyltransferase SETD8 promotes carcinogenesis by deregulating PCNA expression

组蛋白赖氨酸甲基转移酶 SETD8 通过失调 PCNA 表达促进癌发生

• DOI: 10.1158/0008-5472.can-11-3701
• 发表时间: 2012
• 影响因子: 11.2
• 作者: M. Takawa; H. S. Cho; S. Hayami; G. Toyokawa; M. Kogure; Y. Yamane; Y. Iwai; K. Maejima; K. Ueda; A. Masuda; N. Dohmae; H. I. Field; T. Tsunoda; T. Kobayashi; T. Akasu; M. Sugiyama; S. Ohnuma; Y. Atomi; B. A. Ponder; Y. Nakamura;R. Hamamoto
• 通讯作者: R. Hamamoto

Current State of Early Detection Biomarker Development for Cancer in Japan.

日本癌症早期检测生物标志物开发的现状。

• 发表时间: 2014
• 作者: Ueda K.

Erexim 法を用いた抗体医薬品糖鎖構造の高速定量評価

利用Erexim法快速定量评价抗体药物糖链结构

• 发表时间: 2013
• 作者: K. Ueda

Energy Resolved Oxonium Ion Monitoring (Erexim) technology for the analysis of N-glycan microheterogeneity.

用于分析 N-聚糖微观异质性的能量分辨氧离子监测 (Erexim) 技术。

• 发表时间: 2012
• 作者: 植田幸嗣

Development of serum glycoproteomic profiling technology for the identification of pancreatic cancer biomarkers ; simultaneous identification of glycosylation sites and site-specific quantification of glycan structure changes

开发用于鉴定胰腺癌生物标志物的血清糖蛋白组学分析技术；

• 发表时间: 2010
• 作者: 植田幸嗣