Unlock the biodiversity and functioning in food-webs using metabarcoding and metagenomics

使用元条形码和宏基因组学解锁食物网中的生物多样性和功能

基本信息

批准号：
16F16092
负责人：
本川雅治
金额：
$ 1.47万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2016
资助国家：
日本
起止时间：
2016-10-07 至 2019-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究ではメタバーコーディングとメタゲノミクスの手法を用い，同所的に分布する真無盲腸類（食虫類）の食性と腸内微生物相の多様性解明を目指した．前年度までに収集したサンプルについて，その食性を明らかにするためのメタバーコーディングと同位体解析を行った．胃内容物から動物性および植物性のＤＮＡを新たに抽出し，春，夏，秋の季節変化および標高（低，中，高）による違いを考慮した解析を行った．Illuminaプラットフォームを用いて，無脊椎動物についてはＣＯI，植物質についてはchloroplast trnl遺伝子をＤＮＡバーコーディング領域とした．得られた配列データはスーパーコンピュータを用いて，既存のＤＮＡバーコードデータとの比較を行い，真無盲腸類が食物として利用している無脊椎動物および植物質を明らかにした．腸内微生物相についてはメタゲノミクスにより腸内微生物相やその多様性を明らかにし，さらに真無盲腸類の種間，季節，標高による違いを解明した．研究では，真無盲腸類と同所的に分布するが生態学的・系統学的に異なるネズミ類との比較も行った．同位体分析は乾燥させた体毛を用い，種間，季節，標高を考慮して，Ｃ１３とＮ１５の同位体比をもとに食物連鎖において，同所的に分布する真無盲腸類がその生態学的位置を時系列で変化させていることを明らかにした．また，無脊椎動物への食物としての依存についても検証し，メタバーコーディングにより得られた結果との比較を進めている．一連の研究で得られた成果について現在投稿論文としての作成を進めている．

在这项研究中，我们使用元法编码和元基因组学技术来阐明原始分布的真实acecals（Invasives）的肠道菌群的饮食特性和多样性。到上一年收集的样品是元编码和同位素分析，以阐明其饮食特性。动物和植物DNA是从胃含量中新提取的，并考虑到春季，夏季和秋季和高度（低，中和高）季节性变化之间的差异进行分析。使用Illumina平台，将COI用于无脊椎动物，并且将叶绿体TRNL基因用于植物物质。使用超级计算机将获得的序列数据与现有的DNA条形码数据进行了比较，以揭示由真正的acecals用作食物的无脊椎动物和植物。宏基因组学揭示了肠道微生物群及其多样性，此外，阐明了物种，季节和升高的差异。该研究还比较了与真正的acecals一起在生态和系统发育上分布的小鼠。同位素分析使用干燥的身体毛发进行，并揭示，基于C13和N15的同位素比，真正的acecals在食物链中的研讨会的生态位置，按时间顺序分布的真实acecal会随着时间的流逝而改变其生态位置，并考虑到了季节，季节，季节，季节，季节和高度。我们还检查了食物对无脊椎动物的依赖性，并将其与通过元法编码获得的结果进行了比较。我们目前正在努力创建从一系列作为提交论文的研究获得的结果。