Elucidation of protein dynamics as the control of protein function

阐明蛋白质动力学作为蛋白质功能的控制

• 批准号: 20370062
• 负责人: KATAOKA Mikio
• 金额: $ 13.15万
• 依托单位: Nara Institute of Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20370062/
• 关键词: 中性子散乱; 蛋白質動力学; 誘導折り畳み; 水和; 動力学転移; 動力学的転移; 非天然構造; 核酸分解酵素; 中性子非干渉性散乱; 平均二乗変位; 水和水; 動力学の階層性; タンパク質動力学; ボソンピーク; 中性子非弾性散乱; 中性子準弾性散乱; 振動スペクトル

We succeeded to create an functionally active mutant without native structure under physiological condition. Using the mutant and wild type, neutron incoherent scattering experiments were performed under various hydration levels to reveal the protein dynamics required for function. Protein dynamics relevant for function is controlled by hydration water, and the hierarchical structures of protein dynamics are dependent on the conformational states. The essential property of hydration water is revealed to be the formation of hydrogen bond network between hydration water molecules.

我们成功地创造了一种在生理条件下没有天然结构的功能活性突变体。使用突变型和野生型，在不同水合水平下进行中子不相干散射实验，以揭示功能所需的蛋白质动力学。与功能相关的蛋白质动力学由水合水控制，蛋白质动力学的层次结构取决于构象状态。水合水的本质性质被揭示为水合水分子之间氢键网络的形成。

项目成果

Systematic alanine insertion reveals the essential regions that encode structure formation and activity of dihydrofolate reductase

系统性丙氨酸插入揭示了编码二氢叶酸还原酶结构形成和活性的重要区域

• 发表时间: 2011
• 作者: Rumi Shiba

Percolation of hydration water as a control of protein dynamics

水合水的渗透作为蛋白质动力学的控制

• 发表时间: 2010
• 作者: Hiroshi Nakagawa; Mikio Kataoka
• 通讯作者: Mikio Kataoka

Nucleotide-dependent conformational changes and assembly of the AAA ATPase SKD1/VPS4B

AAA ATPase SKD1/VPS4B 的核苷酸依赖性构象变化和组装

• 发表时间: 2008
• 作者: Michio Inoue

High resolution neutron crystallography of photoactive yellow protein-Discovery of low barrier hydrogen bond

光活性黄色蛋白的高分辨率中子晶体学-低势垒氢键的发现

• 发表时间: 2011
• 作者: Mikio Kataoka

Effect of hydration water on protein dynamics

水合水对蛋白质动力学的影响

• 发表时间: 2010
• 作者: Mikio Kataoka