鳥類血液寄生原虫のゲノム解析および遺伝情報を応用した分子疫学的研究
应用禽血寄生虫基因组分析和遗传信息的分子流行病学研究
基本信息
- 批准号:08J03886
- 负责人:
- 金额:$ 1.15万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2008
- 资助国家:日本
- 起止时间:2008 至 2010
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
ヒトマラリア原虫のアピコプラストゲノムは、熱帯熱マラリア(P.falciparum)など3種において、その全塩基配列が明らかになったが、鳥類血液原虫のアピコプラストゲノムを含む核外ゲノムは部分的な情報しか得られていない。そこで、本年度も昨年度に引き続き、本ゲノムの解析を行った。現在は鳥類血液原虫3種(Plasmodium gallinaceum, P. juxtanucleareおよびLeucocytozoon caulleryi)に関して、アピコプラストゲノムの塩基配列の約3~30Kbpの解析を終了した。また、鳥類血液寄生原虫を対象に2例ほど報告がある定量PCR法による原虫診断について、上記のゲノム解析を含めて得られたゲノム情報を利用し、3つのゲノムの各遺伝子を標的として検討を行った。結果、3つのゲノム(核、ミトコンドリアおよびアピコプラスト)上の遺伝子のいずれにおいても、従来のPCR法よりも感度が100倍以上高いことが明らかとなった。さらに、原虫特異的な細胞小器官であるアピコプラストの遺伝子を標的とした際にもっとも特異性が高いにとが示唆された。したがって、鳥類血液原虫の分子生物学的検出における標的配列としてミトコンドリアゲノムのcytb遺伝子が現在もっとも頻繁に利用されているが、原虫特異的なゲノムであるアピコプラスト上の遺伝子を標的とすることで、より検出能力の高いPCRによる検出系を構築できる可能性があるということがわかった。以上より、いまだ十分に把握されていない我が国における鳥類血液原虫の分布状況や原虫保有鳥種、ベクターとなる節足動物種を明らかにするための原虫検出法の開発に寄与する基礎情報が得られたと思われる。今後は、より最適な原虫特異的配列を増幅するプライマーセットの設計を考慮し、PCR系を改良して野外サンプルの検出に応用することが望まれる。
人类疟疾寄生虫的顶质体基因组的完整核苷酸序列已在包括恶性疟原虫在内的三个物种中被揭示,但关于核外基因组的信息只有部分,包括我只得到的禽类血液寄生虫的顶质体基因组。很多。所以今年继去年之后,我们又对这个基因组进行了分析。目前,我们已经完成了三种禽血原虫(鸡疟原虫、近核疟原虫和考勒氏白细胞虫)约3至30 Kbp的顶端体基因组序列的分析。此外,关于使用定量PCR方法进行的原虫诊断,已报道了两例禽类血液寄生原虫的病例,我们将使用包括上述基因组分析在内获得的基因组信息,以检查三个基因组中的每个基因作为目标。 。结果显示,对于三个基因组(细胞核、线粒体和顶质体)中的所有基因,其灵敏度比传统 PCR 方法高出 100 倍以上。此外,靶向顶质体(一种原生动物特异性细胞器)中的基因被认为是最具特异性的。因此,尽管线粒体基因组中的cytb基因目前在禽血原虫的分子生物学检测中最常被用作靶序列,但针对寄生虫特异性基因组顶端体中的基因可能更有效。发现利用PCR构建具有高检测能力的检测系统是可能的。由此,我们获得了有助于原生动物检测方法开发的基本信息,以明确尚未完全了解的日本禽血原生动物的分布、携带原生动物的鸟类以及携带原生动物的节肢动物物种。看来作为载体。未来,需要考虑设计引物组来扩增更优化的原生动物特异性序列,改进PCR系统,并将其应用于现场样品的检测。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Prevalence of avian malaria parasite in mosquitoes collected at a zoological garden in Japan.
日本动物园收集的蚊子中禽疟原虫的流行情况。
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Ejiri H; Sato Y; Sawai R; Sasaki E; Matsumoto R; Ueda M; Higa Y; Tsuda Y; Omori S; Murata K; Yukawa M.
- 通讯作者:Yukawa M.
鳥類血液寄生原虫のアピコプラストゲノムに関する研究
禽血液寄生虫顶质体基因组研究
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:大森澄枝; 佐藤雪太; 平川詞保; 磯部尚; 湯川眞嘉; 村田浩一
- 通讯作者:村田浩一
Two extra chromosomal genomes of Leucocytozoon caulleryi ; completenucleotide sequences of the mitochondrial genome and existence of the apicoplast genome
白细胞虫 caulleryi 的两个额外染色体基因组;
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Omori S; Sato Y; Hirakawa S; Isobe T; Yukawa M; Murata K.
- 通讯作者:Murata K.
Use of flow cytometry to separate Leucocytozoon caulleryi gametocytes from avian blood.
使用流式细胞术从禽类血液中分离白细胞虫配子细胞。
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:2.4
- 作者:Omori; S.; Sato; Y.; Toda; H.; Sasaki; K.; Isobe; T.; Nakanishi; T.; Murata; K.; Yukawa; M.
- 通讯作者:M.
Detection of avian Plasmodium spp. DNA sequences from mosquitoes captured in Minami Daito Island of Japan
禽疟原虫属的检测
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Ejiri H; Sato Y; Sasaki E; Sumiyama D; Tsuda Y; Sawabe K; Matsui S; Horie S; Akatani K; Takagi M; Omori S; Murata K; Yukawa M.
- 通讯作者:Yukawa M.
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大森 澄枝其他文献
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