DNA転写制御に関わる光受容蛋白質の構造変化と分子情報伝達

参与DNA转录控制的光感受器蛋白的结构变化和分子信息传递

基本信息

  • 批准号:
    05F05385
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.54万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2005
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2005 至 2007
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

光によってDNAから蛋白質への発現をコントロールする、センサータンパク質の代表であるAppAと呼ばれる光合成細菌の持つタンパク質の光化学反応を、時間分解で調べ、拡散係数が時間変化するという新しい現象を見出した。この結果を元に、ダイマー化反応が起こっていることとその形成速度を決定することに成功している。更に、光センサーの代表的なタンパク質である、PYPというタンパク質について、その構造変化の詳細を明らかにするために、幾つかの変異体を用いた時間分解熱力学量測定を行った。特に、N末端を数残基から23残基欠損したPYPについて、時間分解熱容量測定を行い、この部分を欠損することによって、野生型で見られていた大きな熱容量増加が見られなくなるという顕著な変化を見出した。このことは、野生型での反応中問体における熱容盤増加の分子論的要因が、疎水性相互作用によるものであることを示しており、またN末端のヘリックス構造が、反応中間体で崩壊していると言う描像がよく適用できる事が分かった。さらに、初期中間体において大きな構造揺らぎの増加を見出した。こうした揺らぎが、それに続く構造変化を誘起している原因と考えられる。これは、発色団からN末端への情報伝達が、構造揺らぎを介して起こると言うスキームが妥当である事を示唆しており、この分野への大きな貢献となった。この成果も、国際誌に報告する予定で、現在結果をまとめている最中である。
我们使用时间分辨方法研究了光合细菌中一种名为 AppA 的蛋白质的光化学反应,AppA 是一种代表性的传感器蛋白质,通过光控制 DNA 到蛋白质的表达,并发现了一种新现象,其中扩散系数随着光的变化而变化。时间。基于这一结果,他们成功地确定了二聚反应的发生及其形成速率。此外,我们使用 PYP 蛋白(一种典型的光学传感器蛋白)的几种突变体进行了时间分辨热力学测量,以阐明其结构变化的细节。特别是,我们对 PYP 进行了时间分辨热容测量,从 N 端删除了几个到 23 个残基,发现这部分的删除导致了显着的变化,即在 PYP 中看到的热容大幅增加。我不再观察到野生型。这表明野生型反应过程中热包络增加的分子原因是由于疏水相互作用,并且我发现N末端的螺旋结构可以很好地应用崩溃的图像。此外,我们发现初始中间体的结构波动大幅增加。这些波动被认为是随后结构变化的原因。这表明通过结构波动从发色团到 N 末端的信息转移的方案是有效的,并且是对该领域的重大贡献。我们计划在国际期刊上报告这一结果,目前正在汇编结果。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Energetics and role of hydrophobic interaction during photoreaction of BLUF domain of AppA
AppA BLUF 结构域光反应过程中疏水相互作用的能量学和作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    P.Hazra
  • 通讯作者:
    P.Hazra
Tetramer Formation Kinetics in the Signaling State of AppA monitored by the time-resolved diffusion
通过时间分辨扩散监测 AppA 信号状态下的四聚体形成动力学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    P.Hazra
  • 通讯作者:
    P.Hazra
Conformational change of photoactive yellow protein studied by the time-resolved thermodynanucs
时间分辨热力学研究光活性黄色蛋白的构象变化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    P.Hazra
  • 通讯作者:
    P.Hazra
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

寺嶋 正秀其他文献

タンパク質反応解明を目指した生体分子科学研究
旨在阐明蛋白质反应的生物分子科学研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    寺嶋 正秀
  • 通讯作者:
    寺嶋 正秀
分子クラウディング環境における光活性化アデニル酸シクラーゼの揺らぎと機能
分子拥挤环境中光激活腺苷酸环化酶的波动和功能
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    中曽根 祐介;村上 大斗;寺嶋 正秀
  • 通讯作者:
    寺嶋 正秀
光センサータンパク質PYPと下流分子PBPの相互作用ダイナミクスとその多様性
光传感器蛋白PYP与下游分子PBP的相互作用动力学和多样性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    平田 瑞樹;中曽根 祐介;金 穂香;寺嶋 正秀
  • 通讯作者:
    寺嶋 正秀
Intermolecular interaction dynamics between PYPs and downstream PYP-binding proteins
PYP 和下游 PYP 结合蛋白之间的分子间相互作用动力学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    金 穂香;中曽根 祐介;高門 輝;山崎 洋一;上久保 裕生;寺嶋 正秀
  • 通讯作者:
    寺嶋 正秀
Kinetic analyses of photoinduced protein folding and interaction with molecular chaperone SecB
光诱导蛋白质折叠及其与分子伴侣 SecB 相互作用的动力学分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    中岡 育也;中曽根 祐介;太田 帆香;川越 聡一郎;石森 浩一郎;齋尾 智英;寺嶋 正秀
  • 通讯作者:
    寺嶋 正秀

寺嶋 正秀的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('寺嶋 正秀', 18)}}的其他基金

Time-resolved detection of protein conformation changes and reactions in space limited liquid droplets
空间有限液滴中蛋白质构象变化和反应的时间分辨检测
  • 批准号:
    21H01885
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
熱レンズ法を用いた超臨界流体中での溶質-溶媒エネルギー移動
使用热透镜效应在超临界流体中进行溶质-溶剂能量传递
  • 批准号:
    01740252
  • 财政年份:
    1989
  • 资助金额:
    $ 1.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
熱レンズ信号交換効率の振動モード依存性とその無輻射遷移機構への応用
热透镜信号交换效率的振动模式依赖性及其在非辐射跃迁机制中的应用
  • 批准号:
    63540364
  • 财政年份:
    1988
  • 资助金额:
    $ 1.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
熱レンズ効果を用いた2つの非共有軌道の相互作用の研究
利用热透镜效应研究两个非共价轨道的相互作用
  • 批准号:
    62740246
  • 财政年份:
    1987
  • 资助金额:
    $ 1.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

進化工学を用いた人工DNAゲノム機能発現の最適化
利用进化工程优化人工DNA基因组功能表达
  • 批准号:
    22KJ0540
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Development and Functional Evaluation of Cyclic Pyrrole-Imidazole Polyamides for Anticancer Drug Applications
用于抗癌药物应用的环状吡咯-咪唑聚酰胺的开发和功能评价
  • 批准号:
    22KJ1695
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 1.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Development of teaching materials on DNA analysis techniques to investigate species in aquatic ecosystem
开发水生生态系统物种DNA分析技术教材
  • 批准号:
    22K02953
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 1.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
内耳有毛細胞・支持細胞の免疫応答メカニズム-急性感音難聴の遺伝子医療にむけて-
内耳毛细胞和支持细胞的免疫反应机制 - 走向急性感音神经性听力损失的基因医学 -
  • 批准号:
    22K09744
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 1.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Study on the enhancer grammar that specifies cell type-specific gene expression
指定细胞类型特异性基因表达的增强子语法的研究
  • 批准号:
    22K06189
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 1.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了