光合成酸素発生反応機構の解明:マンガンクラスターによる水分解反応の直接検出

阐明光合析氧反应机理:锰簇直接检测水分解反应

基本信息

项目摘要

光化学系IIマンガン(Mn)クラスターの配位構造及びMnクラスターが水を酸化して酸素を発生する反応機構を明らかにすることを目的とした。本年度は下記1-3について研究を行った。1.低波数(650-350cm^<-1>)赤外分光法により同位体標識(^<15>N及び^<13>C)された光化学系IIコア標品(ラン藻Synechocystis sp.PCC6803)の光誘起赤外吸収差スペクトルを測定し、Mhクラスターの骨格振動もしくはMnと酸素配位子間の相互作用に由来するバンドを特定した。また、低波数領域におけるアミノ酸配位子の炭素及び酸素に由来するバンドを特定した。2.Mnクラスターの推定上の配位子と考えられているD1タンパク質のC末端アラニン(D1-Ala344)を構造的に最も類似性の高いグリシンに変異させることにより、Mnクラスターの骨格構造やアミノ酸配位子の配位構造を反映する振動モードに顕著な変化が見られたことから、C末端アラニンがMnクラスターの配位子であることを強く示唆する結果が得られた。また、複数のカルボキシレートを有する金属キレーターがMnクラスターの配位構造を変形させることを明らかにした。3.光合成酸素発生反応の4つの状態間遷移に対応する光誘起赤外吸収スペクトル(1700-800cm^<-1>)を測定した。得られたスペクトルに対する^<15>N及び^<13>C同位体置換の効果について分析し、アミノ酸配位子に由来する振動を特定した。この領域ではH_2^<18>O置換の効果が見られなかったため、650-350cm^<-1>の領域について各状態間遷移に対応するH_2^<18>O置換の効果を検証した。その結果、650-600cm^<-1>に全ての状態間遷移において同位体シフトが観測され、これらがMnクラスターによる水分解反応もしくは酸素発生反応に密接に関与するクラスターの骨格構造の変化を反映するものであることが示された。
本研究的目的是阐明光系统II锰(Mn)团簇的配位结构以及Mn团簇氧化水产生氧气的反应机制。今年,我们针对以下1-3点进行了研究。 1.测量光系统II核心样本(蓝细菌集胞藻属sp.),并鉴定源自Mh簇的骨架振动或Mn与氧配体之间的相互作用的谱带。我们还鉴定了源自低波数区域的氨基酸配体中的碳和氧的谱带。 2. 通过将 D1 蛋白的 C 端丙氨酸(D1-Ala344)(被认为是 Mn 簇的假定配体)突变为结构最相似的甘氨酸,与 Mn 簇的主链结构和观察到反映配体配位结构的氨基酸振动模式的显着变化,强烈表明C端丙氨酸是Mn簇配体。我们还发现,具有多个羧酸盐的金属螯合剂会使锰簇的配位结构变形。 3.测量了光合析氧反应的四种状态之间的转变对应的光致红外吸收光谱(1700-800cm^-1>)。分析 15 N 和 13 C 同位素取代对所得光谱的影响,并鉴定源自氨基酸配体的振动。由于在该区域没有观察到H_2^<18>O取代的影响,因此我们在650-350cm^<-1>区域验证了对应于每个状态转变的H_2^<18>O取代的效果。结果,在所有状态间转变中都在650-600cm^-1处观察到同位素位移,并且这些反映了与Mn团簇的水分解反应或氧析出反应密切相关的团簇的骨架结构的变化。结果表明

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Kimura, Y, Ono, T.-A.: "Functional and structural study on chelator-induced suppression of S_2/JS_11 FTIR spectrum in photosynthetic oxygen-evolving complex"Journal of Inorganic Biochemistry. 97. 231-239 (2003)
Kimura, Y, Ono, T.-A.:“光合释氧复合物中螯合剂诱导的 S_2/JS_11 FTIR 光谱抑制的功能和结构研究”无机生物化学杂志。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kimura, Y, Mizusawa, N., Ishii, A., Yamanari, T., Ono, T-A.: "Changes of Low-Frequency Vibrational Modes Induced by Universal ^N- and ^C-Isotope Labeling in S_2/S_1 FTIR Difference Spectrum of Oxygen-Evolving Complex"Biochemistry. 42. 13170-13177
Kimura, Y、Mizusawa, N.、Ishii, A.、Yamanari, T.、Ono, T-A.:“通用 ^<15>N- 和 ^<13>C-同位素标记引起的低频振动模式的变化
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

木村 行宏其他文献

紅色光合成細菌Thermochromatium tepidumのLH2タンパク質に結合するバクテリオクロロフィルaの化学酸化と光酸化
细菌叶绿素 a 与紫色光合细菌 Thermochromatium tepidum 的 LH2 蛋白结合的化学氧化和光氧化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    平尾 遥奈;木村 行宏;大友 征宇;佐賀 佳央
  • 通讯作者:
    佐賀 佳央
紅色光合成細菌Thermochromatium tepidumのLH2タンパク質に結合するバクテリオクロロフィルaの化学酸化と光酸化
细菌叶绿素 a 与紫色光合细菌 Thermochromatium tepidum 的 LH2 蛋白结合的化学氧化和光氧化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    平尾 遥奈;木村 行宏;大友 征宇;佐賀 佳央
  • 通讯作者:
    佐賀 佳央

木村 行宏的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('木村 行宏', 18)}}的其他基金

極限環境光合成微生物における3重耐性化と近赤外光利用の分子戦略
嗜极光合微生物的三重抗性和利用近红外光的分子策略
  • 批准号:
    22K06144
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

相似海外基金

光合成マンガンクラスターの機能発現と連動したアミノ酸配位子の経時的構造変化の役割
氨基酸配体的时间结构变化与光合锰簇功能表达的作用
  • 批准号:
    22K05317
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
パルスESR法を用いた光化学系IIマンガンクラスター構築過程の追跡
使用脉冲ESR方法跟踪光系统II锰团簇的构建过程
  • 批准号:
    15J11091
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ENDOR法による光合成酸素発生における基質水分子の同定及び反応メカニズムの解明
使用 ENDOR 方法识别底物水分子并阐明光合产氧的反应机制
  • 批准号:
    14J11113
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Development of QM/MM hybrid method for strongly correlated systems and its applications to reaction centers of bioenzyemes
强相关系统QM/MM混合方法的发展及其在生物酶反应中心的应用
  • 批准号:
    23550016
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
comprehensive theory of excitation energy transfer verifiable by ultrafast coherent spectroscopies
可通过超快相干光谱验证的激发能量转移综合理论
  • 批准号:
    22740276
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了