Elucidation of ABO blood group gene expression though chromatin remodeling

通过染色质重塑阐明 ABO 血型基因表达

基本信息

批准号：
22390140
负责人：
KOMINATO Yoshihiko
金额：
$ 10.57万
依托单位：
Gunma University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2012
项目状态：
已结题

项目摘要

The ABO blood group is of great importance in blood transfusion and personal identification. However, the mechanisms regulating human ABO gene expression remain obscure. On the basis of DNase I hypersensitive sites in and upstream of ABO in the human erythroleukemia cell line K562 in publicly available expression data from the UCSC Genome Browser (http://genome.ucsc.edu), we prepared reporter plasmid constructs including these sites. Subsequent luciferase assays indicated a novel positive regulatory element in intron 1. This element was shown to enhance ABO promoter activity in an erythroid cell-specific manner. Electrophoretic mobility shift assays demonstrated that it bound to the tissue-restricted transcription factor GATA-1 and GATA-2. Mutation of the GATA motifs to abrogate binding of this factor reduced the regulatory activity of the element. Thus, GATA transcription factors seem to be involved in the cell-specific activity of the element. Furthermore, we found that Bm phenotypes were associated with a partial deletion in intron 1 involving the element as well as a single point mutation of GATA site leading to reduced activity of the element. Therefore, it is plausible that deletion or a single point mutation of the erythroid cell-specific regulatory element could down-regulate transcription in the B^m allele, leading to reduction of B antigen expression in cells of erythroid lineage, but not in mucus-secreting cells. These results support the contention that the enhancer-like element in intron 1 of ABO has a significant function in erythroid cells.

ABO血液组在输血和个人认同中非常重要。然而，调节人ABO基因表达的机制仍然晦涩。在人类红血病细胞系K562中，根据UCSC基因组浏览器（http://genome.ucsc.edu）的公开表达数据中的ABO中和上游的DNase I超敏部位，我们准备了记者的质粒质粒结构。随后的荧光素酶测定表明内含子1中有一个新型的正调节元件。该元素被证明可增强ABO启动子活性，以红细胞特异性的方式增强ABO启动子活性。电泳迁移率转移测定表明它与组织限制的转录因子GATA-1和GATA-2结合。 GATA基序的突变消除了该因子的结合，从而降低了该元素的调节活性。因此，GATA转录因子似乎与该元素的细胞特异性活性有关。此外，我们发现BM表型与内含子1中的部分缺失有关，涉及该元素以及GATA位点的单点突变，从而导致该元素活性降低。因此，可见的是，侵蚀性细胞特异性调节元件的缺失或单点突变可以下调B^M等位基因中的转录，从而导致红细胞谱系细胞中B抗原表达的降低，但在粘液分泌细胞中降低。这些结果支持这样的论点：ABO内含子1中的增强子样元件在红细胞细胞中具有重要功能。

项目成果

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Deoxyribonuclease II (DNase II)遺伝子に座位する非同義置換型SNPには不活性な酵素を産生するminor alleleが分布する

产生无活性酶的次要等位基因分布在位于脱氧核糖核酸酶 II (DNase II) 基因中的非同义取代 SNP 中。

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
藤原純子;木村かおり;竹下治男;中島たみ子;小湊慶彦;湯浅勲;飯田礼子;植木美鈴;安田年博
通讯作者：
安田年博

Comparison of methods of detecting bacterial biofilm.

细菌生物膜检测方法的比较。

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
Clin Lab.
影响因子：
0
作者：
Tajima Y;Yamaguchi T;Takagi R;Nakajima T;Kominato Y.
通讯作者：
Kominato Y.

Detection of allogeneic blood group A and B enzyme activities in patients with ABO incompatible kidney transplantation

ABO血型不合肾移植患者同种异体A、B型血酶活性检测

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
Glycobiology
影响因子：
4.3
作者：
Tasaki M;Nakajima T;Imai N;Nakagawa Y;Saito K;Takahashi K;Yazawa S
通讯作者：
Yazawa S

ベトナム人集団でのFUT2の多様性

越南人口中 FUT2 的多样性

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
森口茂樹;福永浩司;佐野利恵,中島たみ子,高橋圭子,小湊慶彦;佐野利恵,高橋圭子,小湊慶彦;Kokubo Y;中島たみ子;副島美貴子
通讯作者：
副島美貴子

Nonsynonymous single-nucleotide polymorphisms of the human apoptosis-related endonuclease-DNA fragmentation factor beta polypeptide, endonuclease G, and Flap endonuclease 1-genes show a low degree of genetic heterogeneity

人类凋亡相关内切核酸酶-DNA 片段因子 β 多肽、内切核酸酶 G 和 Flap 内切核酸酶 1 基因的非同义单核苷酸多态性显示出较低程度的遗传异质性

DOI：
10.1089/dna.2011.1293
发表时间：
2012
期刊：
DNA and Cell Biology
影响因子：
3.1
作者：
Poudel-Tandukar K;Nanri A;Matsushita Y;Sasaki S;Ohta M;Sato M;Mizoue T;Soichiro Usui;新開省二;H.Takeshita
通讯作者：
H.Takeshita