ホヤ胚の内胚葉分化と中胚葉誘導における分子機構の解明

阐明海鞘胚胎内胚层分化和中胚层诱导的分子机制

基本信息

  • 批准号:
    14704070
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 16.81万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
  • 财政年份:
    2002
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2002 至 2004
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

転写因子が発生においてきわめて重要な働きを行うことは自明であるが、特定の動物で転写因子について網羅的かつ統合的な研究が行われている例はほとんど無い。ホヤは脊索動物でありながら脊椎動物よりもはるかに単純なゲノム構造を持ち、そのドラフト配列は決定されている。このことを利用して昨年度までにホヤのゲノムにコードされる転写因子遺伝子を網羅的に同定した。16年度はその情報をもとにそれらの遺伝子の胚発生における発現パターンをホールマントin situハイブリダイゼーション法によって可能な限り網羅的に明らかにした。それによれば、ホヤ胚ではほぼすべての割球の発生運命の決定が行われる110細胞期までに胚性の発現を開始する遺伝子は65個しかないことが明らかとなった。すなわち、この65個の転写因子遺伝子の昨日および相互の関係を明らかにしていくことによってホヤ胚における各割球の運命決定メカニズムの骨格を明らかにすることができることが明らかとなった。同時に、600あまりの転写因子遺伝子のcDNAクローンの塩基配列を決定し、オルターナティブスプライシングフォームを含めた遺伝子の一次構造を正確に同定した。こうした基礎的な情報に基づいて、筋肉細胞の発生運命決定にきわめて重要な働きをもつ転写因子であるCi-machol遺伝子について解析を進め、その下流で初期原腸期胚までに発現を始める転写因子遺伝子を網羅的に同定した。特に筋肉細胞は自律的に分化し細胞間相互作用を必要としないことが知られているので、下流遺伝子として同定された遺伝子が直接筋肉細胞における構造遺伝子の発現に関与している可能性もある。また、Ci-machol遺伝子の下流遺伝子であるCi-Tbx6bは筋肉細胞の分化に必須であることも明らかにし、筋肉細胞分化における遺伝子カスケードの大枠をとらえることに成功した。
尽管转录因子在发育中发挥着极其重要的作用是显而易见的,但对特定动物中转录因子进行全面综合研究的例子却很少。虽然海鞘是脊索动物,但它们的基因组结构比脊椎动物简单得多,而且它们的草图序列已经确定。利用这一事实,到去年我们已经全面鉴定了海鞘基因组中编码的转录因子基因。基于这些信息,我们在2016财年利用Holmant原位杂交方法尽可能全面地阐明了这些基因在胚胎发育过程中的表达模式。他们发现,在海鞘胚胎中,只有 65 个基因在 110 细胞阶段开始表达胚胎表达,此时几乎所有卵裂球的发育命运都已决定。换句话说,通过阐明这65个转录因子基因之间的关系,我们可以揭示海鞘胚胎中每个卵裂球命运决定机制的框架。同时,他们对600多个转录因子基因的cDNA克隆进行了测序,并准确鉴定了基因的一级结构,包括可变剪接形式。基于这些基本信息,我们将对 Ci-machol 基因进行分析,该基因是在决定肌肉细胞发育命运方面发挥极其重要作用的基因。特别是,已知肌肉细胞自主分化,不需要细胞间相互作用,因此被确定为下游基因的基因有可能直接参与肌肉细胞中结构基因的表达。我们还揭示了 Ci-machol 基因的下游基因 Ci-Tbx6b 对于肌肉细胞分化至关重要,并成功理解了肌肉细胞分化中基因级联的概要。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The ascidian Mesp gene specifies heart precursor cells
海鞘 Mesp 基因指定心脏前体细胞
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Satou Y
  • 通讯作者:
    Satou Y
Identification of downstream genes of the ascidian muscle determinant gene Ci-machol.
海鞘肌决定基因 Ci-machol 下游基因的鉴定。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yagi K
  • 通讯作者:
    Yagi K
Yutaka Satou, et al.: "A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis. I. Genes for bHLH transcription factors"Dev Genes Evol. 213. 213-221 (2003)
Yutaka Satou 等人:“海鞘发育相关基因的全基因组调查。I. bHLH 转录因子的基因”Dev Genes Evol.
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Yutaka Satou: "A cDNA resource from the basal chordate Ciona intestinalis"Genesis. 33. 153-154 (2002)
Yutaka Satou:“来自基底脊索动物 Ciona Enteris 的 cDNA 资源”起源。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Yutaka Satou: "Fgf genes in the basal chordate Ciona intestinalis"Development Genes and Evolution. 212. 432-438 (2002)
Yutaka Satou:“基础脊索动物海鞘中的 Fgf 基因”发育基因和进化。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

佐藤 ゆたか其他文献

ホヤ32細胞期胚におけるNodalの発現には転写補因子Fogが必要である
海鞘 32 细胞胚胎中的节点表达需要转录辅助因子 Fog
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    徳岡 三紀;佐藤 ゆたか
  • 通讯作者:
    佐藤 ゆたか
ホヤ32細胞期胚におけるNodalの発現には転写補因子Fogが必要である
海鞘 32 细胞胚胎中的节点表达需要转录辅助因子 Fog
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    徳岡 三紀;佐藤 ゆたか
  • 通讯作者:
    佐藤 ゆたか

佐藤 ゆたか的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('佐藤 ゆたか', 18)}}的其他基金

ホヤ初期胚の細胞運命決定機構
早期海鞘胚胎的细胞命运决定机制
  • 批准号:
    21H02486
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 16.81万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
ホヤ胚発生を支配する転写制御ネットワーク
调控海鞘胚胎发育的转录调控网络
  • 批准号:
    20687014
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 16.81万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
ホヤ胚発生の包括的理解のための遺伝子発現アトラスの作製にむけた試み
尝试创建基因表达图谱以全面了解海鞘胚胎发育
  • 批准号:
    20657042
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 16.81万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
ホヤ初期胚発生におけるゲノムワイドな転写因子ネットワークの解析
早期海鞘胚胎发育过程中全基因组转录因子网络的分析
  • 批准号:
    17687022
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 16.81万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
ホヤ胚の筋肉および内胚葉細胞分化における内在的決定機構の解析
海鞘胚胎肌肉和内胚层细胞分化的内在决定机制分析
  • 批准号:
    99J03806
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 16.81万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ホヤ胚の筋肉細胞分化における筋肉アクチン遺伝子の特異的発現調節機構の解析
海鞘胚胎肌细胞分化过程中肌动蛋白基因的特异性表达调控机制分析
  • 批准号:
    96J06806
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 16.81万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似国自然基金

海鞘早期胚胎发育的单细胞表观遗传调控机制研究
  • 批准号:
    32370863
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目
海鞘真菌来源chamigrane过氧倍半萜定向挖掘及抗脑胶质瘤作用机制研究
  • 批准号:
    42376098
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    51 万元
  • 项目类别:
    面上项目
海鞘变态调控因子甲状腺激素的合成机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
TRPA1通道介导污损生物玻璃海鞘幼虫乳突黏附的分子调控机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    56 万元
  • 项目类别:
    面上项目
海鞘被囊启迪的牙周GTR胶原水凝胶的“多模态”交联构建及自适应调控机理
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    53 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

Mitochondrial electron transport dysfunction: Dissecting pathomechanisms
线粒体电子传递功能障碍:剖析病理机制
  • 批准号:
    10679988
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 16.81万
  • 项目类别:
Structural Basis of Coupling and Dynamics in K+ Channels
K 通道耦合和动力学的结构基础
  • 批准号:
    10682241
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 16.81万
  • 项目类别:
NSF Postdoctoral Fellowship in Biology FY 2021: Deciphering grammatical rules of notochord enhancers and their role in notochord development in Ciona intestinalis
2021 财年 NSF 生物学博士后奖学金:破译脊索增强子的语法规则及其在海鞘脊索发育中的作用
  • 批准号:
    2109907
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 16.81万
  • 项目类别:
    Fellowship Award
Decoding the dynamics and regulation of parental allelic expression at single-cell resolution
以单细胞分辨率解码亲本等位基因表达的动态和调节
  • 批准号:
    10376247
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 16.81万
  • 项目类别:
Deciphering the regulatory principles governing enhancer specificity
解读增强剂特异性的监管原则
  • 批准号:
    10319729
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 16.81万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了