複合体X線解析で解明する葉緑体内還元力分配システムの構造基盤
复杂X射线分析阐明叶绿体内还原配电系统的结构基础
基本信息
- 批准号:21687008
- 负责人:
- 金额:$ 14.56万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
- 财政年份:2009
- 资助国家:日本
- 起止时间:2009 至 2011
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本年度も,複合体構造解析で解明を目指す電子伝達分配システムの内,主にクロロフィル合成の鍵酵素であるフェレドキシン依存性の暗所作動型プロトクロロフィリド還元酵素(DPOR)に的を絞って主に変異体構造解析を遂行した。その結果,DPORの触媒コンポーネントのうちBchBのC末端ヘリックスの中ほどにあるMet408をAlaに置換した変異体で、これまでは結晶中で電子密度を確認することのできなかったC末端ドメイン(約70残基)を電子密度中に確認することができた。今回初めて構造決定したC末端ドメインの構造は全く新しいフォールドをもつ小型の球状ドメインで非常に特徴的な表面電荷分布をとっていた。具体的には,正に帯電した領域を多く持ち,基質のクロロフィル前躯体がもつ負の電荷と非常によい相補性を示していた。基質取り込み機構に密接に関与している可能性を指摘することができたので、引き続き機能解析と併せて研究を推進していく。また,電子伝達コンポーネントであるBchLとフェレドキシンとの複合体構造解析を目指した試料調製も行っているが,現在までのところ安定にBchLタンパクを取ることが出来ず,結晶化には至っていない。並行して、フェレドキシンへ還元電子を伝達する光化学系I反応中心とフェレドキシンとの結晶化条件の検討を行なっている。光化学系I反応中心単独の結晶化においても精製ロット差が大きく,安定して良質な結晶を得ることが出来ていないので,引き続き精製の再現性を中心に研究を展開していく。
今年,旨在通过复合结构分析阐明的电子传输分布系统,主要集中在依赖Ferleedoxin的黑暗巨型固定质赎回酶(DPOR)上。结果,在DPOR催化剂组件的BCHB的C-末端螺旋中间取代MET408的突变体,并且无法在晶体中确认晶体中的电子密度(约70个残基)。电子密度。 C端结构域的结构首次是在这次首次确定的,具有非常独特的表面电荷分布,带有一个小的球形域,具有全新的折叠。具体而言,它具有许多不寻常的领域,表明负电荷和互补的互补区域,具有底物叶绿素前面。由于有可能指出参与底物掺入机制的可能性,因此我们将继续促进研究以及功能分析。此外,我们正在准备旨在分析电子透射成分BCHL和铁氧还蛋白之间复杂结构分析的样品,但到目前为止,尚未稳定地采用BCHL蛋白,并且尚未达到结晶。同时,正在使用Feledoxin检查结晶条件,该蛋白质将电子降低到铁氧还蛋白,以及铁蛋白之间的结晶条件。即使仅在光电I -REACTIONS的结晶中,纯化批次的差异也很大,并且无法获得稳定且高质量的晶体,因此我们将继续开发主要关于完善可重复性的研究。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structural basis for chiral substrate recognition by two 2,3-butanediol dehydrogenases
- DOI:10.1016/j.febslet.2009.11.068
- 发表时间:2010-01-04
- 期刊:
- 影响因子:3.5
- 作者:Otagiri, Masato;Ui, Sadaharu;Kusunoki, Masami
- 通讯作者:Kusunoki, Masami
Functional importance of Crenarchaea-specific extra-loop revealed by an X-ray structure of a heterotetrameric crenarchaeal splicing endonuclease
异四聚体缝隙菌剪接核酸内切酶的 X 射线结构揭示了缝隙菌特异性外环的功能重要性
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:S.Yoshinari;T.Shiba;D.K.Inaoka;T.Itoh;G.Kurisu;S.Harada;K.Kita;Y.Watanabe
- 通讯作者:Y.Watanabe
小型結晶化ロボットを用いた嫌気条件下での結晶化実験効率化
使用小型结晶机器人提高厌氧条件下结晶实验的效率
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Christiane Reinbothe;et.al.;村木則文;村木則文;Norifumi Muraki;Norifumi Muraki;Norifumi Muraki;村木則文
- 通讯作者:村木則文
Asymmetric dimeric structure of ferredoxin-NAD(P)+ oxidoreductase from Chlorobaculum tepidum : Implications for binding ferredoxin and NADP+
来自温热绿杆菌的铁氧还蛋白-NAD(P)氧化还原酶的不对称二聚体结构:对铁氧还蛋白和 NADP 结合的影响
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:N.Muraki;D.Seo;T.Sakurai;G.Kurisu
- 通讯作者:G.Kurisu
X-ray crystal structure of the light-independent protochlorophyllide reductase
- DOI:10.1038/nature08950
- 发表时间:2010-05-06
- 期刊:
- 影响因子:64.8
- 作者:Muraki, Norifumi;Nomata, Jiro;Fujita, Yuichi
- 通讯作者:Fujita, Yuichi
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
栗栖 源嗣其他文献
ガリウム置換が可能にした光化学系Ⅰ-フェレドキシン電子伝達複合体の結晶構造解析
通过镓取代实现光系统 I-铁氧还蛋白电子传递复合物的晶体结构分析
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
河合(久保田) 寿子;村木 則文;田中 秀明;栗栖 源嗣 - 通讯作者:
栗栖 源嗣
電子顕微鏡を利用した繊維状蛋白質の解離定数の新規測定法の開発
开发使用电子显微镜测量纤维蛋白解离常数的新方法
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
渡邊 真人;今井 洋;宮田 知子;牧野 文信;武藤 悦子;Gerle Christoph;光岡 薫;栗栖 源嗣;難波 啓一;昆 隆英 - 通讯作者:
昆 隆英
カルシウム依存性レドックス蛋白質の構造解析
钙依赖性氧化还原蛋白的结构分析
- DOI:
- 发表时间:
2016 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Saito R;Takeuchi A;Himeno Y;Inagaki N;Matsuoka S;栗栖 源嗣 - 通讯作者:
栗栖 源嗣
光合成型複合体Iの高分解能構造解析を目指した高純度精製
高纯度纯化用于光合复合物 I 的高分辨率结构分析
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
浜岡 紀之;三角 裕子;川本 晃大;田中 秀明;小沼 剛;池上 貴久;栗栖 源嗣 - 通讯作者:
栗栖 源嗣
Wavefront sensing for nano-focusing characterization
用于纳米聚焦表征的波前传感
- DOI:
- 发表时间:
2017 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
今井 洋;加藤 貴之;Christoph Gerle;武藤 悦子;光岡 薫;栗栖 源嗣;難波 啓一;昆 隆英;S. Matsuyama - 通讯作者:
S. Matsuyama
栗栖 源嗣的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('栗栖 源嗣', 18)}}的其他基金
Structural analysis of the complex between Fd and Fd-dependent proteins considering their redox states strictly
严格考虑氧化还原态的 Fd 和 Fd 依赖性蛋白复合物的结构分析
- 批准号:
21H02417 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
巨大モーター蛋白質ダイニンのX線構造解析
巨运动蛋白动力蛋白的 X 射线结构分析
- 批准号:
20051006 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
膜面新規ヘム鉄の役割解明を目指す高等植物チトクロムb6f複合体のX線構造解析
高等植物细胞色素b6f复合物的X射线结构分析旨在阐明新型血红素铁在膜表面的作用
- 批准号:
19036003 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
巨大モーター蛋白質ダイニンのX線による原子レベル構造研究
使用巨运动蛋白动力蛋白的 X 射线进行原子水平结构研究
- 批准号:
18054008 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
巨大モーター蛋白質ダイニンのX線結晶構造に基づいた機能解析
基于巨运动蛋白动力蛋白X射线晶体结构的功能分析
- 批准号:
17053006 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
複合体結晶構造解析で明らかにする高等植物に特有な光還元力分配システムの構造基盤
复杂晶体结构分析揭示高等植物特有的光还原配电系统的结构基础
- 批准号:
17687008 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
光合成循環電子伝達を制御するチトクロム複合体とフェレドキシンとの相互作用解析
控制光合循环电子转移的细胞色素复合物与铁氧还蛋白之间的相互作用分析
- 批准号:
17048005 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
立体構造から探るフェレドキシン依存性循環電子伝達でのチトクロムb_6f複合体の役割
从三维结构研究细胞色素b_6f复合物在铁氧还蛋白依赖性循环电子转移中的作用
- 批准号:
16048217 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
X線結晶解析法によるフェレドキシンと亜硫酸還元酵素による電子伝達複合体の構造研究
利用 X 射线晶体学研究铁氧还蛋白和亚硫酸还原酶之间的电子传递复合物的结构
- 批准号:
15770067 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
X線結晶解析法によるフェレドキシンと亜硫酸還元酵素による電子伝達複合体の構造研究
利用 X 射线晶体学研究铁氧还蛋白和亚硫酸还原酶之间的电子传递复合物的结构
- 批准号:
14780474 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
相似海外基金
温帯落葉樹林の林床草本の葉の光合成電子伝達系の制御機構の多様性の解析
温带落叶林林地草本植物叶片光合电子传递链控制机制多样性分析
- 批准号:
23K23967 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
光合成電子伝達鎖によるレドックス制御の統合解析
光合电子传递链氧化还原控制的综合分析
- 批准号:
23K23914 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
電子伝達系の理解に基づく人工光合成プラットフォームの創出
基于电子传递链的理解创建人工光合作用平台
- 批准号:
24K17827 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
生理的環境下の光合成から生成する活性酸素のライブイメージング検出
生理环境下光合作用产生的活性氧的实时成像检测
- 批准号:
23K04977 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
光合成電子伝達系の構築過程における葉緑体リン脂質PGの役割
叶绿体磷脂PG在光合电子传递链构建过程中的作用
- 批准号:
23KJ1853 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 14.56万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows