臨床システム生物学を用いた循環器疾患の解析
利用临床系统生物学分析心血管疾病
基本信息
- 批准号:10F00801
- 负责人:
- 金额:$ 1.41万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2010
- 资助国家:日本
- 起止时间:2010 至 2012
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
動脈硬化などに代表される循環器疾患では、その発症メカニズムの解明と治療法の確立が大きな課題となっている。本研究では、循環器疾患の発症メカニズムを解明するための、複数オミックスデータ解析法を開発することを目的とする。平成24年度は、平成23年度までに設計したワークフローをマウスモデルに適用した結果を詳細に解析し、食事中のコレステロールと高コレステロール血症薬であるロスバスタチンなどの投与が肝臓に影響を与える際の主な代謝物としてジグリセリドを同定した。更に高コレステロール食を与えたマウスの解析からもジグリセリドがアテロームの発生に関連する代謝産物であることが明らかになり、肝臓の慢性炎症に関与していることが示唆された。特に、O2PLSに基づくSUS2プロット解析によってロバスタチンが高コレステロール食を与えたマウスのジグリセリドプロファイルをコントロールのマウスと同じプロファイルに戻すことが分かった。これらの結果をまとめた論文は、Analytical Chemistry誌に採録された。O2PLSを用いたワークフローの別の応用として、環境ホルモン(17βエストラジオール)を投与した魚(黒鯛)の血中メタボロームのプロファイル解析にも応用した。その際に、実験間の共通性と特性をより解釈しやすくするための拡張も試みた。その結果、トリメチルアミンオキサイド(TMAO)とコリンが環境ホルモンに影響を受けた魚のバイオマーカーとして有望であることが明らかになった。さらに、別の応用として、生分解性プラスチックの熱可塑性の最適化にも適用した。
对于动脉硬化等心血管疾病,阐明发病机制和建立治疗方法是重大挑战。本研究的目的是开发一种多组学数据分析方法来阐明心血管疾病的发病机制。 2012财年,我们将2011财年设计的工作流程应用于小鼠模型,并详细分析了结果,以研究饮食胆固醇的影响,并确定服用瑞舒伐他汀等高胆固醇药物对肝脏的影响。此外,对高胆固醇饮食小鼠的分析表明,甘油二酯是一种与动脉粥样硬化形成相关的代谢物,表明它与肝脏的慢性炎症有关。特别是,基于 O2PLS 的 SUS2 图分析表明,洛伐他汀可将高胆固醇饮食小鼠的甘油二酯谱恢复到与对照小鼠相同的水平。总结这些结果的论文已被《分析化学》杂志接受。作为 O2PLS 工作流程的另一个应用,我们将其应用于经环境激素(17β 雌二醇)处理的鱼类(黑鲷)的血液代谢组谱分析。同时,我们还尝试扩大实验之间的共性和特征,使它们更容易解释。结果表明,三甲胺氧化物(TMAO)和胆碱是受环境激素影响的鱼类的有前途的生物标志物。此外,作为另一个应用,我们将其应用于可生物降解塑料的热塑性性能的优化。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Systems biology approaches for investigating the relationship between lipids and cardiovascular diseases
研究脂质与心血管疾病之间关系的系统生物学方法
- DOI:
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kirwan;G.M.;Diez;D.;Haeggstrom;J.Z.;Goto;S.;Wheelock;C.M.
- 通讯作者:C.M.
Integration of large scale omic's datasets using 02PLS
使用 02PLS 集成大规模 omic 数据集
- DOI:
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kirwan GM;Johansson E;Goto S;Kooistra T;Kleemann R;Wheelock AM;Wheelock CE
- 通讯作者:Wheelock CE
Building Multivariate Systems Biology Models
- DOI:10.1021/ac301269r
- 发表时间:2012-08-21
- 期刊:
- 影响因子:7.4
- 作者:Kirwan, Gemma M.;Johansson, Erik;Wheelock, Craig E.
- 通讯作者:Wheelock, Craig E.
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