臨床システム生物学を用いた循環器疾患の解析

利用临床系统生物学分析心血管疾病

基本信息

  • 批准号:
    10F00801
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.41万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2010
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2010 至 2012
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

動脈硬化などに代表される循環器疾患では、その発症メカニズムの解明と治療法の確立が大きな課題となっている。本研究では、循環器疾患の発症メカニズムを解明するための、複数オミックスデータ解析法を開発することを目的とする。平成24年度は、平成23年度までに設計したワークフローをマウスモデルに適用した結果を詳細に解析し、食事中のコレステロールと高コレステロール血症薬であるロスバスタチンなどの投与が肝臓に影響を与える際の主な代謝物としてジグリセリドを同定した。更に高コレステロール食を与えたマウスの解析からもジグリセリドがアテロームの発生に関連する代謝産物であることが明らかになり、肝臓の慢性炎症に関与していることが示唆された。特に、O2PLSに基づくSUS2プロット解析によってロバスタチンが高コレステロール食を与えたマウスのジグリセリドプロファイルをコントロールのマウスと同じプロファイルに戻すことが分かった。これらの結果をまとめた論文は、Analytical Chemistry誌に採録された。O2PLSを用いたワークフローの別の応用として、環境ホルモン(17βエストラジオール)を投与した魚(黒鯛)の血中メタボロームのプロファイル解析にも応用した。その際に、実験間の共通性と特性をより解釈しやすくするための拡張も試みた。その結果、トリメチルアミンオキサイド(TMAO)とコリンが環境ホルモンに影響を受けた魚のバイオマーカーとして有望であることが明らかになった。さらに、別の応用として、生分解性プラスチックの熱可塑性の最適化にも適用した。
对于动脉硬化等心血管疾病,阐明发病机制和建立治疗方法是重大挑战。本研究的目的是开发一种多组学数据分析方法来阐明心血管疾病的发病机制。 2012财年,我们将2011财年设计的工作流程应用于小鼠模型,并详细分析了结果,以研究饮食胆固醇的影响,并确定服用瑞舒伐他汀等高胆固醇药物对肝脏的影响。此外,对高胆固醇饮食小鼠的分析表明,甘油二酯是一种与动脉粥样硬化形成相关的代谢物,表明它与肝脏的慢性炎症有关。特别是,基于 O2PLS 的 SUS2 图分析表明,洛伐他汀可将高胆固醇饮食小鼠的甘油二酯谱恢复到与对照小鼠相同的水平。总结这些结果的论文已被《分析化学》杂志接受。作为 O2PLS 工作流程的另一个应用,我们将其应用于经环境激素(17β 雌二醇)处理的鱼类(黑鲷)的血液代谢组谱分析。同时,我们还尝试扩大实验之间的共性和特征,使它们更容易解释。结果表明,三甲胺氧化物(TMAO)和胆碱是受环境激素影响的鱼类的有前途的生物标志物。此外,作为另一个应用,我们将其应用于可生物降解塑料的热塑性性能的优化。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Systems biology approaches for investigating the relationship between lipids and cardiovascular diseases
研究脂质与心血管疾病之间关系的系统生物学方法
Integration of large scale omic's datasets using 02PLS
使用 02PLS 集成大规模 omic 数据集
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kirwan GM;Johansson E;Goto S;Kooistra T;Kleemann R;Wheelock AM;Wheelock CE
  • 通讯作者:
    Wheelock CE
Building Multivariate Systems Biology Models
  • DOI:
    10.1021/ac301269r
  • 发表时间:
    2012-08-21
  • 期刊:
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Kirwan, Gemma M.;Johansson, Erik;Wheelock, Craig E.
  • 通讯作者:
    Wheelock, Craig E.
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

五斗 進其他文献

POST: プロテオーム解析ワークフローの標準化
POST:蛋白质组分析工作流程的标准化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    守屋 勇樹;河野 信;奥田 修二郎;山本 格;松本 雅記;小林 大樹;荒木 令江;吉沢 明康;五斗 進;田畑 剛;杉山 直幸;石濱 泰
  • 通讯作者:
    石濱 泰
A Study on Development of a Deductive Object-Oriented Database and Its Application to Genome Analysis
演绎面向对象数据库的开发及其在基因组分析中的应用研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    1994
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    五斗 進
  • 通讯作者:
    五斗 進
配列類似性に基づいたウイルスゲノム自動分類法
基于序列相似性的病毒基因组自动分类
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    黒西 愛;Blanc-Mathieu;R.;遠藤 寿;五斗 進;緒方 博之
  • 通讯作者:
    緒方 博之
jPOST 同定結果のFDR改善を目指す再解析プロトコルの開発
开发再分析协议,旨在提高 jPOST 识别结果的 FDR
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    吉沢 明康;田畑 剛;守屋 勇樹;河野 信;奥田 修二郎;渡辺 由;山本 格;松本 雅記;高見 知代;小林 大樹;荒木 令江;杉山 直幸;田中 聡;五斗 進;石濱 泰
  • 通讯作者:
    石濱 泰
無限測度から読み解く非平衡非定常現象
从无限测度解释非平衡不稳定现象
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    黒西 愛;Blanc-Mathieu;R.;遠藤 寿;五斗 進;緒方 博之;Y. Yoshida and M. Hayashi;秋元琢磨
  • 通讯作者:
    秋元琢磨

五斗 進的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('五斗 進', 18)}}的其他基金

病原体が持つ抗原変異多コピー遺伝子ファミリーのメタゲノム解析
病原体抗原变异多拷贝基因家族的宏基因组分析
  • 批准号:
    10F00786
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
遺伝子発現情報を用いたマラリアの病原性に関する研究
利用基因表达信息研究疟疾发病机制
  • 批准号:
    07F07418
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
マラリア原虫Plasmodium falciarumの疾病立過程に関する研究
疟原虫恶性疟原虫发病过程的研究
  • 批准号:
    06F06712
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
アロステリックおよび転写調節による代謝ネットワークの制御に関する研究
通过变构和转录调节控制代谢网络的研究
  • 批准号:
    05F05439
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
アラキドン酸・リノレン酸経路における炎症の化学伝達物質に関する代謝系データベースの開発
开发关于花生四烯酸-亚麻酸途径中炎症化学介质的代谢系统数据库
  • 批准号:
    04F04910
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
環境汚染物質に対する肺プロテオーム・メタボロームの応答に関するバイオインフォマティクス研究
肺蛋白质组和代谢组对环境污染物响应的生物信息学研究
  • 批准号:
    04F04770
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似海外基金

Construction of platform for clinical application of cancer omics data
癌症组学数​​据临床应用平台构建
  • 批准号:
    20H03747
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Development of cell trajectory inference and comparison algorithm based on single-cell omics data
基于单细胞组学数据的细胞轨迹推断与比较算法开发
  • 批准号:
    19K20399
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Identification of the pathogenesis from the origin to uterine carcinosarcoma based on evolutional theory
基于进化论的子宫癌肉瘤发病机制鉴定
  • 批准号:
    17H04336
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Development of statistical methods based on omics data for realizing predictive medicine
开发基于组学数据的统计方法以实现预测医学
  • 批准号:
    15H02671
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Analysis of robustness of metabolic networks focusing on environmental dependency of gene knockouts
代谢网络稳健性分析,重点关注基因敲除的环境依赖性
  • 批准号:
    23700353
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 1.41万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了