Construction of Integrated Molecular Network Based on Interaction and Structural Information

基于相互作用和结构信息的集成分子网络的构建

基本信息

  • 批准号：
    21310131
  • 负责人：
    SARAI Akinori
  • 金额：
    $ 10.65万
  • 依托单位：
    Kyushu Institute of Technology
  • 依托单位国家：
    日本
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份：
    2009
  • 资助国家：
    日本
  • 起止时间：
    2009 至 2012
  • 项目状态：
    已结题

项目摘要

We have developed an integrated database/tool of biomolecular network, PDBnet, based on the structural and interaction information, in order to get useful information from the structurome. We have developed various interfaces for searching data and visualizing the results, which enables users to get insight into the relationship among structure, interaction, network and function of molecules. Using the data in PDBnet, we have made systematic analyses on the relationship among various properties at molecular structure, interaction and network levels to demonstrated the utility of PDBnet.
我们已经根据结构和交互信息开发了生物分子网络PDBNET的集成数据库/工具，以便从结构组中获取有用的信息。我们已经开发了各种搜索数据和可视化结果的接口，这使用户能够深入了解分子的结构，交互，网络和功能之间的关系。使用PDBNET中的数据，我们对分子结构，相互作用和网络水平上各种特性之间的关系进行了系统的分析，以证明PDBNET的实用性。

项目成果

期刊论文数量（0）
专著数量（0）
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会议论文数量（0）
专利数量（0）
Analysis of Relationship among Evolvability, Thermodynamics and Function of Intrinsically Disordered Proteins/Regions
本质无序蛋白质/区域的进化性、热力学和功能之间的关系分析
  • DOI：
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    Compt. Biol. Chem.
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    J. Wada;R. Kamada;Y. Chuman;T. Imagawa;and K. Sakaguchi;H. He and A. Sarai
  • 通讯作者：
    H. He and A. Sarai
Analysis of Domain and Non-Domain Interactions in Protein-Protein Interaction Network
蛋白质-蛋白质相互作用网络中的域和非域相互作用分析
  • DOI：
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Satoshi Komori;Satoshi Fujii and Akinori Sarai
  • 通讯作者：
    Satoshi Fujii and Akinori Sarai
Protein-DNA Recognition Mechanism and Prediction
蛋白质-DNA识别机制与预测
  • DOI：
  • 发表时间：
    2009
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Sugiyama;A.;(11人略);Yazaki;K.;海老敬行; 根本圭一郎; 杉山直幸; 冨田勝; 澤崎達也; 石濱泰;程 久美子;A.Sarai
  • 通讯作者：
    A.Sarai
Integration of Structural and Biochemical Information into Protein Interaction Network
将结构和生化信息整合到蛋白质相互作用网络中
  • DOI：
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Yuji Kawakami;Satoshi Fujii and Akinori Sarai
  • 通讯作者：
    Satoshi Fujii and Akinori Sarai
Stability, Dynamics and Cooperativity of Protein-DNA Interactions
蛋白质-DNA 相互作用的稳定性、动力学和协同性
  • DOI：
  • 发表时间：
    2009
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Sasaki;K.;Tsurumaru;Y.;Yamamoto;H.;Yazaki;K.;程久美子;石濱泰;S.Osada;A.Sarai
  • 通讯作者：
    A.Sarai
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