Kinship analysis based on massive SNP genotype data

基于海量SNP基因型数据的亲缘关系分析

• 批准号: 21590746
• 负责人: OSAWA Motoki
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Tokai University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21590746/
• 关键词: 親子鑑定; DNA多型; SNP; マイクロアレイ; 遺伝子

The multiplex system of 15 STR loci has been employed in kinship analysis, but its power is insufficient even for sibship. The microarray technique allows us to obtain massive SNP genotype data. As indices for the evaluation based on SNP, the proportion of identical-by-decent(IBD) numbers was preferable, in which linkage disequilibrium and minor allele frequency were conditioned. The minimum number to separate kinship from unrelated pairs was estimated to be approximately 500 and several thousands of SNPs for siblings and the second degree, respectively.

15个基因座的多重系统已用于亲属分析，但其功率甚至对sibship也不足。微阵列技术使我们能够获得大量的SNP基因型数据。作为基于SNP的评估指数，优先选择相同的按比例（IBD）数字的比例，其中链接不平衡和次要等位基因频率得到了调节。据估计，分开的亲属关系的最小数量分别为500个，兄弟姐妹和第二度分别为数千个SNP。

项目成果

IBS値に基づく血縁関係解析法の実用性

基于IBS值的亲属关系分析方法的实用性

• 发表时间: 2011
• 期刊: DNA多型
• 作者: 田村友紀;木村亮介;稲岡斉彦;田中佐知;佐藤文子;佐藤至;大澤資樹
• 通讯作者: 大澤資樹

個人識別におけるAmpFlSTR Identifiler Kitを用いたSTR解析の有用性

使用 AmpFlSTR Identifiler 试剂盒进行 STR 分析在个人身份识别中的有用性

• 发表时间: 2009
• 作者: 田村友紀;大澤資樹;田村佐和;木村亮介;稲岡斉彦;早田慈;山本佳世;石割敦也;鈴木隆徳;佐藤至
• 通讯作者: 佐藤至

Postmortem molecular analysis of sudden deaths from unknown causes

不明原因猝死的尸检分子分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 松本和子;牧内正男;橋野仁一;木村博子;今信子;Osawa M
• 通讯作者: Osawa M

IdentifilerシステムでのIBS法による血縁関係解析

在 Identifiler 系统上使用 IBS 方法进行亲属关系分析

• 发表时间: 2010
• 期刊: DNA多型
• 作者: 大澤資樹;田村友紀;木村亮介;稲岡斉彦;早田慈;長谷川巖;佐藤文子;佐藤至
• 通讯作者: 佐藤至

Evaluation of the allele-sharing approach, known as the IBS method, in kinship analysis the allele-sharing approach, known as the IBS method

等位基因共享方法（称为 IBS 方法）的评估，在亲属关系分析中等位基因共享方法（称为 IBS 方法）

• 期刊: Forensic Leg Med
• 作者: Tamura T;Osawa M;Kimura R;Inaoka Y;Tanaka S;Satoh F;Sato I
• 通讯作者: Sato I