Molecular mechanism of genome maintenance in Thermus thermophilus

嗜热栖热菌基因组维持的分子机制

• 批准号: 20570131
• 负责人: MASUI Ryoji
• 金额: $ 3.16万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20570131/
• 关键词: 酵素; 核酸; 生体分子; ゲノム; 細菌; 塩基除去修復; ミスマッチ修復; DNAポリメラーゼ; 立体構造; 高度好熱菌; 組換え修復; RecJ; APエンドヌクレアーゼ; MutS; MutL; ウラシルDNAグリコシラーゼ; DNAポリメラーゼX

I prepared Thermus thermophilus HB8 proteins involved in mismatch repair and base excision repair systems and performed reconstitution of repair reactions, protein-protein interaction analysis and crystal structural analyss. Based on the results, I revealed that novel interactions between mismatch repair proteins contribute to strand discrimination, the nuclease which degrades an error-strand recognizes single-straded DNA by its unique structure, and two DNA polymerases function in different pathways of base excision repair.

我制备了参与错配修复和碱基切除修复系统的嗜热栖热菌HB8蛋白，并进行了修复反应的重建、蛋白质-蛋白质相互作用分析和晶体结构分析。基于这些结果，我发现错配修复蛋白之间的新型相互作用有助于链辨别，降解错误链的核酸酶通过其独特的结构识别单链 DNA，以及两种 DNA 聚合酶在碱基切除修复的不同途径中发挥作用。

项目成果

Degradation of ppGpp by Nudix Pyrophosphatase Modulates the Transition of Growth Phase in the Bacterium Thermus thermophilus

• DOI: 10.1074/jbc.m900582200
• 发表时间: 2009-06-05
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Ooga, Takushi;Ohashi, Yoshiaki;Masui, Ryoji
• 通讯作者: Masui, Ryoji

ヒトタイプMutLにおける、エンドヌクレアーゼドメインの二量体構造の解析

人型 MutL 核酸内切酶结构域二聚体结构分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 飯野均;増井良治
• 通讯作者: 増井良治

5'-3'および3'-5'エキソヌクレアーゼの関わるDNA修復経路の解明

阐明涉及 5-3 和 3-5 核酸外切酶的 DNA 修复途径

• 发表时间: 2009
• 作者: 若松泰介;増井良治;小寺祐太郎;島田敦広;島田敦広
• 通讯作者: 島田敦広

高度好熱菌由来DNAポリメラーゼXの3'-5'エキソヌクレアーゼ活性にはPOLXc, PHP両方のドメインが必要である

POLXc 和 PHP 结构域都是嗜热菌 DNA 聚合酶 X 的 3-5 核酸外切酶活性所必需的。

• 发表时间: 2009
• 作者: Hidefumi Suzuki;Ryo Ito;Kaori Ikeda;Taka-aki Tamura;Satoshi Yasuda;中根修平
• 通讯作者: 中根修平

高度好熱菌由来DNAポリメラーゼXの機能ドメイン解析

极端嗜热菌 DNA 聚合酶 X 的功能域分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 若松泰介;増井良治;小寺祐太郎;島田敦広;島田敦広;淺野瑠一;中根修平
• 通讯作者: 中根修平