セルロースの1級水酸基の酸化で始まる新規生分解経路の解明

阐明从纤维素中伯羟基氧化开始的新型生物降解途径

基本信息

  • 批准号:
    08J07128
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.38万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2008
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2008 至 2009
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

セルロース分解菌Trichoderma reeseiを、セルロースの酸化処理によって調製したセロウロン酸(β-1,4グルクロナン)を含む液体培地で培養した。T.reeseiはセロウロン酸を唯一の炭素源とする培地で生育することができ、菌体外液中に27kDaの分子最を持つタンパク質を最も多量に生産することが判明した。そこで検出したタンパク質のcDNAをT.reeseiの全ゲノム情報を用いてクローニングし、さらにメタノール資化酵母Pichia pastorisに導入し、組み換えタンパク質を大量発現させた。得られた組み換えタンパク質でセロウロン酸を処理し、分解生成物を^<13>C NMRで分析したところ、本酵素はβ-脱離反応によりセロウロン酸を分解するβ-1,4グルクロンナンリアーゼ(TrGL)であることが示された。TrGLのアミノ酸配列と相同性の高いタンパク質を検索した結果、全てHypothetical proteinであり、どの多糖リアーゼ(PL)とも相同性を示さなかつたことから、本酵素は新規多糖リアーゼファミリー(PLファミリー20)に属することが明らかとなった。本研究により、セルロース分解菌として有名な糸状菌Trichoderma reeseiがグルクロナンリアーゼを生産することが初めて証明された。また、データベースを用いた配列解析から、約10のグルクロナンリアーゼ活性を有する可能性が高いタンパク質の存在が明らかになり、いずれも高い細胞壁(セルロース)分解能を有する微生物由来のタンパク質であった。これまで自然界におけるセルロースの分解機構としては、加水分解酵素(セルラーゼ)による分解のみが知られているが、本酵素の発見はセルロース分解にリアーゼ型酵素が関与することを示唆する重要な知見である。
通过氧化处理纤维素氧化处理,将纤维素降解的细菌Trichoderma Reesei培养在含有cerouronic酸(β-1,4葡萄糖醛酸)的液体培养基中。 T. reesei可以在培养基中生长,用炉子酸作为唯一的碳源,并且发现它在体外液体中产生的蛋白质最大,最高分子为27KDA。然后使用T. resei的整个基因组信息克隆检测到的蛋白质的cDNA,然后引入甲醇辅助的酵母菌Pichia Pastoris,并大量表达重组蛋白。将所得的重组蛋白用二抗酸处理,并通过 ^<13> c NMR分析降解产物,并表明该酶是β-1,4葡萄糖醛酸裂解酶(TRGL),该酶通过β-启示反应降解cerouronic酸。搜索与TRGL氨基酸序列具有高同源性的蛋白质表明,它们都是假设的蛋白质,并且与任何多聚糖酸酯酶(PL)并非同源,这表明该酶属于新型多糖酸酯裂解酶家族(PL家族20)。这项研究首次证明了著名的纤维素降解真菌Trichoderma Reesei产生葡萄糖民烯基裂解酶。此外,使用数据库的序列分析揭示了可能具有大约10种葡萄糖丹尼基裂解酶活性的蛋白质的存在,并且它们都是微生物衍生的具有高细胞壁(纤维素)分辨率的蛋白。到目前为止,只有自然界中纤维素的降解是通过水解酶(纤维素酶)的,但是这种酶的发现是一个重要发现,表明裂解酶型酶参与纤维素降解。

项目成果

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专著数量(0)
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会议论文数量(0)
专利数量(0)
Characterization of cellouronate lyase from Trichoderma reesei
里氏木霉纤维质酸裂解酶的表征
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    倉島洋介;清野宏;倉島洋介・清野宏;谷口智憲;谷口智憲;谷口智憲;谷口智憲;谷口智憲;Naotake Konno;Naotake Konno;Naotake Konno;金野尚武;金野尚武;金野尚武
  • 通讯作者:
    金野尚武
Crystal structure of polysaccharide lyase family 20 endo-β-1,4-glucuronan lyase from the filamentous fungus Trichoderma reesei
  • DOI:
    10.1016/j.febslet.2009.03.034
  • 发表时间:
    2009-04-17
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Konno, Naotake;Ishida, Takuya;Isogai, Akira
  • 通讯作者:
    Isogai, Akira
Cloning of the Trichoderma reesei cDNA Encoding a Glucuronan Lyase Belonging to a Novel Polysaccharide Lyase Family
  • DOI:
    10.1128/aem.01749-08
  • 发表时间:
    2009-01-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Konno, Naotake;Igarashi, Kiyohiko;Isogai, Akira
  • 通讯作者:
    Isogai, Akira
糸状菌 Trichoderma reesei 由来セロウロン酸リアーゼの結晶構造解析
丝状真菌里氏木霉纤维质酸裂解酶的晶体结构分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    倉島洋介;清野宏;倉島洋介・清野宏;谷口智憲;谷口智憲;谷口智憲;谷口智憲;谷口智憲;Naotake Konno;Naotake Konno;Naotake Konno;金野尚武
  • 通讯作者:
    金野尚武
Purification and characterization of exo-type cellouronate lyase
外切型纤维醛酸裂解酶的纯化和表征
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    倉島洋介;清野宏;倉島洋介・清野宏;谷口智憲;谷口智憲;谷口智憲;谷口智憲;谷口智憲;Naotake Konno;Naotake Konno
  • 通讯作者:
    Naotake Konno
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