低分子ＲＮＡネットワークのシステム的理解と新たな癌制御アプローチへの応用

对小 RNA 网络的系统理解及其在新癌症控制方法中的应用

• 批准号: 24689018
• 负责人: 鈴木 洋
• 金额: $ 16.97万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24689018/
• 关键词: microRNA; 低分子RNA; がん; がん微小環境; ネットワーク; 病理学; 遺伝子; システム生物学; 癌; シグナル伝達

本研究では、様々な病態における低分子RNAの発現異常の分子基盤となる低分子RNA生合成経路の新規調節機構、および悪性腫瘍との関係を明らかにすることを目的とする。また、低分子RNAの作動機構をネットワークレベルでシステム的に理解することを目的とする。平成24年度では、まず、miRNAによる標的mRNAの抑制効果を複数の内在性miRNAの発現量が変動する状況に外挿することが可能であるかを検討した。このために、GSEA-FAME analysis（GFA）という新規解析手法を開発し、癌のトランスクリプトームにおいてmiRNAがmRNA発現に与える負の影響が広範囲に観察されること、この原理を応用して、より頑健な新規バイオマーカーや新規治療標的をゲノムワイド発現解析から抽出できる可能性を明らかにした（Nucleic Acid Res, 41, e62）。また、これまでにMCPIP1と呼ばれるribonucleaseがmiRNAの生合成を抑制することを見出しているが、平成24年度では、MCPIP1によるmiRNA前駆体の分解を抑制するRNA結合タンパクLaとMCPIP1の関係について、乳癌の遺伝子発現データを解析し、DicerおよびLaとMCPIP1が拮抗関係にあることを見出した（J Biol Chem, 288, 723-736）。平成25年度では、GFA解析をT細胞リンパ腫の網羅的遺伝子発現解析データに拡張し、各リンパ腫サブタイプが特徴的なmiRNA活性パターンを示すことを明らかにするとともに、NPM-ALK陽性の悪性リンパ腫（未分化大細胞型リンパ腫）で発現異常が認められる複数のmiRNAの同定に成功し、mRNA発現データの解析からmiRNA―mRNAネットワークを類推できる可能性を新たに見出した（Leukemia, 27, 2107-2111）。

本研究的目的是阐明小RNA生物合成途径的新型调控机制，即各种病理状态下小RNA表达异常的分子基础，及其与恶性肿瘤的关系。我们还旨在系统地了解小RNA在网络层面的运行机制。 2012财年，我们首先研究了是否可以将miRNA对靶mRNA的抑制作用推断到多个内源miRNA的表达水平波动的情况。为此，我们开发了一种称为 GSEA-FAME 分析 (GFA) 的新分析方法，并证明 miRNA 对 mRNA 表达的负面影响在癌症转录组中广泛观察到，我们揭示了提取强大的新生物标志物和新颖的可能性。来自全基因组表达分析的治疗靶标（核酸研究，41，e62）。此外，我们迄今为止发现一种称为MCPIP1的核糖核酸酶抑制miRNA生物发生，分析基因表达数据发现Dicer和La与MCPIP1具有拮抗关系（J Biol Chem，288， 723-736）。 2013财年，我们将GFA分析扩展到T细胞淋巴瘤的综合基因表达分析数据，阐明了每种淋巴瘤亚型都显示出特征性的miRNA活性模式，并研究了NPM-ALK阳性恶性淋巴瘤（我们成功鉴定了多个miRNA，这些miRNA是在间变性大细胞淋巴瘤（anaplasty large cell淋巴瘤）中异常表达，并发现了从mRNA表达数据分析中推断miRNA-mRNA网络的新可能性（Leukemia，27， 2107-2111）。

项目成果

Complexity of microRNA biogenesis and Inference of small RNA network through transcriptome analysis

microRNA生物合成的复杂性以及通过转录组分析推断小RNA网络

• 发表时间: 2012
• 作者: HI Suzuki;K Miyazono.
• 通讯作者: K Miyazono.

Prostate Cancer Cells and Bone Stromal Cells Mutually Interact with Each Other through Bone Morphogenetic Protein-mediated Signals

• DOI: 10.1074/jbc.m112.353094
• 发表时间: 2012-06-08
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Nishimori, Hikaru;Ehata, Shogo;Miyazono, Kohei
• 通讯作者: Miyazono, Kohei

RNA言語を編む

编织RNA语言

• 作者: HI Suzuki;K Miyazono.
• 通讯作者: K Miyazono.

がん増殖と悪性化の分子機構(宮澤恵二・伊藤進 編) 9章 がんとmicroRNA

癌症生长和恶性肿瘤的分子机制（宫泽敬二和伊藤进主编）第9章癌症和microRNA

• 发表时间: 2012
• 作者: HI Suzuki;K Miyazono.;鈴木洋，宮園浩平;鈴木洋
• 通讯作者: 鈴木洋

microRNAバイオロジーの新展開

microRNA生物学的新进展

• 作者: HI Suzuki;K Miyazono.
• 通讯作者: K Miyazono.