自家不和合性の認識特異性とSハプロタイプの分化機構に関する研究

自交不亲和性识别特异性及S单倍型分化机制研究

基本信息

批准号：
10158101
负责人：
西尾剛
金额：
$ 2.24万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
1998
资助国家：
日本
起止时间：
1998 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10158101/
关键词：
自家不和合性アブラナ科植物 Sハプロタイプ SLG SRK 塩基配列多様性認識特異性

项目摘要

アブラナ科植物では1つの種内にSハプロタイプが50〜100種類あるといわれているが、これまでSLGについては報告が多いものの、SRKの塩基配列が解析されているものはその中のごく一部に過ぎなかった。本研究でSRKのS領域の塩基配列をBrassica oleraceaでは新たに23種類、Brassica rapaでは12種類、SLGについてはB.oleraceaで新たに11種類決定し、既に報告されているSRK10種類SLG43種類と比較した。推定アミノ酸配列をもとにNJ法で系統樹を作成したところ、同じハプロタイプのSLGとSRKが最も近接した対を作ったものは、40中18あった。同じハプロタイプのSLGとSRKが似ていて、同じ花粉リガンドを認識するというこれまでの考えは、半数程度のSハプロタイプについては当てはまると言える。しかし、残り半数のSハプロタイプではSLGとSRKが似ておらず、これらのSLGがSRKと同じ花粉リガンドに結合するとするモデルを支持しない。種内で異なるSハプロタイプが極めて類似したSLGを有する例があり、これらではSRKのS領域は互いに異なっていた。種内でSRKが極めて類似するSハプロタイプの組み合わせは見られなかった。このことはSRKが自己認識に際し主要な役割を果たすことを示唆し、SLGの機能については疑問がもたれた。B.rapaとB.oleraceaの間でSLGが極めて類似するSハプロタイプが5組み合わせあったが、これらでは、SRKのS領域も互いに類似していた。これまで、SLGの解析から、Sハプロタイプの分化はB.rapaとB.oleraceaの種分化以前に起こったと主張されてきたが、SRKのS領域の解析によっても同じことが言える。これら5組み合わせは、種分化以前には同一のハプロタイプであったものと推測される。

据说一个十字花科植物中有50到100种S单倍型，虽然关于SLG的报道很多，但只有少数对其SRK序列进行了分析。本研究确定了甘蓝SRK S区的23个新核苷酸序列、白菜中12个新类型和甘蓝中11个新SLG类型，并与已发现的10个SRK和43个SLG进行了比较。被举报了。当基于推导的氨基酸序列使用NJ方法构建系统发育树时，相同单倍型的40对SLG和SRK中的18对最接近。相同单倍型的 SLG 和 SRK 相似并识别相同花粉配体的传统观点可以说对于大约一半的 S 单倍型来说是正确的。然而，在剩下的一半S单倍型中，SLG和SRK不相似，这不支持这些SLG与SRK与相同花粉配体结合的模型。在某些情况下，一个物种内的不同 S 单倍型具有非常相似的 SLG，并且在这些情况下 SRK 的 S 区域彼此不同。在物种内没有发现 S 单倍型与极其相似的 SRK 的组合。这表明 SRK 在自我识别中发挥着重要作用，引发了人们对 SLG 功能的质疑。白菜和甘蓝之间存在5种SLG极其相似的S单倍型组合，并且在这些组合中，SRK的S区域也彼此相似。迄今为止，SLG的分析表明S单倍型的分化发生在白菜和甘蓝的物种形成之前，并且通过SRK的S区域的分析也可以得出同样的结论。假设这五种组合在物种形成之前是相同的单倍型。