転位活性を持つビフィズス菌挿入配列の単離と変異導入系の構築

具有转座活性的双歧杆菌插入序列的分离和诱变系统的构建

基本信息

批准号：
18780050
负责人：
吹谷智
金额：
$ 2.24万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18780050/
关键词：
ビフィズス菌挿入配列転位変異導入

项目摘要

平成19年度はビフィズス菌からの挿入配列の単離および単離された挿入配列の詳細な解析を行った.1.新規挿入配列様因子TLS16の解析昨年度同定されたBifidobacterium longum BK28株由来の挿入配列様因子TLS16について塩基配列の解析および各種ビフィズス菌における保存性について解析を行った.TLS16は1.59kbpの挿入配列であり,その内部には転位に関与するタンパク質であるトランスポゼースをコードする単一の遺伝子が存在していた.アミノ酸レベルの相同性解析,および因子末端に存在する特徴的なステム・ループ構造などの特徴から,TLS16は挿入配列IS605ファミリーに属する因子と考えられた.またサザンハイブリダイゼーション解析により,TLS16はB.longum,B. breve,B.adolescentis,B.gallicumの基準株にそのホモログが保存されている事を明らかにした.2.転位活性を持つ挿入配列様因子TLS143の解析咋年度構築した転位因子のスクリーニング系を用いて,B.longum 105-A株を用いて転位活性を持つ因子を探索した.その結果,1.43kbpの長さの因子がスクリーニングベクターに挿入されていたため,本因子をTLS143と命名した.TLS143は末端に逆方向反復配列を持つ典型的なIS因子であり,その相同性からからIS3ファミリーに属する因子であると考えられた.1.と同様に各種ビフィズス菌における保存性を調べたところ,TLS16に比べて多くのビフィズス菌種壕存在する普遍性の高い因子であることが明らかになった.ビフィズス菌の転位因子の研究はほとんど行われていなかったが,本研究により二つの因子が同定された.特に,TLS143は転位活性を持つことが証明されたビフィズス菌由来の初めての因子であり,今後更なる応用が期待される.

2007财年，我们从双歧杆菌中分离出插入序列，并对分离的插入序列进行了详细分析。 1.去年发现的新型插入序列样因子TLS16长双歧杆菌的分析。我们分析了源自 BK28 菌株的插入序列样因子 TLS16 的核苷酸序列，并分析了其在各种双歧杆菌中的保守性。TLS16 是一个 1.59 kbp 的插入序列，包含转座酶，转座酶是一种参与转座的蛋白质，有一个编码基因。基于氨基酸水平的同源性分析和元件末端存在的特征性茎环结构等特征，TLS16被认为是属于插入序列IS605家族的因子，TLS16是B.longum,B。。结果表明，该同源物在短芽孢杆菌、偶像芽孢杆菌和鸡芽孢杆菌等典型菌株中是保守的。 2.利用2011年构建的转座元件筛选系统分析具有转座活性的插入序列样因子TLS143。长双歧杆菌我们利用105-A菌株寻找具有转座活性的因子，结果在筛选载体中插入了一个1.43kbp长的因子，因此我们将这个因子命名为TLS143，它的末端有一个反向重复序列。具有序列的典型IS元件，根据其同源性，被认为属于IS3家族。与1.类似，它存在于多种双歧杆菌中。当我们研究双歧杆菌的保存特性时，我们发现与TLS16相比，它是一个高度通用的因子，存在于许多双歧杆菌幼苗中。虽然对双歧杆菌转座因子的研究很少，但本研究确定了两个因子。特别是， TLS143是第一个被证明具有转座活性的源自双歧杆菌的因子，预计未来会有进一步的应用。

项目成果

期刊论文数量（0）

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专利数量（0）

Bifidobacterium longum内在性プラスミドからの挿入配列の同定と塩基配列解析

长双歧杆菌内源质粒插入序列的鉴定和核苷酸序列分析

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
吹谷智;杉山智彦;加納康正;横田篤
通讯作者：
横田篤

ランダム変異導入系構築に向けたビフィズス菌からのトランスポゾン様因子の同定と解析

双歧杆菌转座子样因子的鉴定与分析及其构建随机突变导入系统

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
吹谷智;杉山智彦;加納康正;横田篤
通讯作者：
横田篤

Identification and characterization of a transposon-like sequence in a cryptic plasmid from Bifidobacterium longum

长双歧杆菌隐秘质粒中转座子样序列的鉴定和表征

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
Satoru Fukiya;Tomohiko Sugiyama;Yasunobu Kano and Atsushi Yokota
通讯作者：
Yasunobu Kano and Atsushi Yokota

ビフィズス菌からの転位能をもつ挿入配列の単離と同定

双歧杆菌转座插入序列的分离和鉴定

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
小林諒子;吹谷智;加納康正;横田篤
通讯作者：
横田篤

ビフィズス菌Bifidobacterium longum内在性プラスミドからの挿入配列の同定と塩基配列解析

长双歧杆菌内源质粒插入序列的鉴定和核苷酸序列分析

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
吹谷智;杉山智彦;加納康正;横田篤
通讯作者：
横田篤

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发表时间：
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作者：
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